MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 chromosome

Total Repeats: 4196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017856	TGA	2	6	36	41	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017856	TGT	2	6	42	47	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017856	GGA	2	6	122	127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017856	A	8	8	5107	5114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017856	AATT	2	8	5191	5198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017856	GTG	2	6	8111	8116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017856	ATA	2	6	11910	11915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017856	T	6	6	11931	11936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017856	GTA	2	6	14782	14787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017856	TGTC	2	8	14810	14817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017856	ACA	2	6	14829	14834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017856	A	6	6	18899	18904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017856	ACA	2	6	19937	19942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017856	GTC	2	6	19954	19959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017856	AC	3	6	25400	25405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017856	GAG	2	6	25412	25417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017856	GTT	2	6	26602	26607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017856	GT	3	6	30576	30581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017856	T	6	6	30627	30632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017856	TGGT	2	8	30877	30884	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017856	TTAC	2	8	30913	30920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017856	GAA	2	6	30921	30926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017856	ATC	2	6	31141	31146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017856	GAT	2	6	31159	31164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017856	ACT	2	6	31192	31197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017856	T	6	6	32204	32209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017856	TAA	2	6	32231	32236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017856	AGT	2	6	32247	32252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017856	CTG	2	6	32305	32310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017856	CTG	2	6	32323	32328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017856	TA	3	6	32335	32340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017856	GGTCT	2	10	32380	32389	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017856	AAAAT	2	10	32410	32419	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017856	ATC	2	6	32467	32472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017856	CTT	2	6	32479	32484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017856	ATG	2	6	38257	38262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017856	GT	3	6	42369	42374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017856	TGT	2	6	42397	42402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017856	GGC	2	6	43599	43604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017856	GATG	2	8	44488	44495	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017856	A	6	6	44935	44940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017856	T	6	6	44959	44964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017856	GCA	2	6	50778	50783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017856	GTT	2	6	51817	51822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017856	ATT	2	6	51852	51857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017856	AAC	2	6	51898	51903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017856	AG	3	6	51926	51931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017856	ATC	2	6	53545	53550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017856	TGA	2	6	58520	58525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017856	ACGCA	2	10	59442	59451	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017856	CGGT	2	8	59460	59467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017856	CGG	2	6	59493	59498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017856	TGTC	2	8	59648	59655	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017856	ACAA	2	8	59675	59682	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017856	TGA	2	6	60431	60436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017856	AT	3	6	60443	60448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017856	AATT	2	8	60504	60511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017856	T	6	6	60686	60691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017856	TGA	2	6	62422	62427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017856	A	6	6	62431	62436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017856	AATA	2	8	62464	62471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017856	CT	3	6	63237	63242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017856	ATTT	2	8	63260	63267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017856	T	7	7	63265	63271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017856	T	9	9	64957	64965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017856	T	6	6	64988	64993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017856	T	6	6	65029	65034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017856	T	6	6	67364	67369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017856	AAT	2	6	67399	67404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017856	TGC	2	6	67415	67420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017856	TA	3	6	67432	67437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017856	ATTT	2	8	67450	67457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017856	ATT	2	6	67494	67499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017856	ATTTA	2	10	67534	67543	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017856	AAT	2	6	67545	67550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017856	T	6	6	67564	67569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017856	GAT	2	6	67594	67599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017856	CAC	2	6	67644	67649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017856	GTCA	2	8	67661	67668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017856	CAA	2	6	67674	67679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017856	AAT	2	6	68210	68215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017856	TC	3	6	70079	70084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017856	AAC	2	6	70680	70685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017856	TTAAT	2	10	70695	70704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017856	A	6	6	70717	70722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017856	AGC	2	6	70749	70754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017856	CCG	2	6	70769	70774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017856	TAT	2	6	70776	70781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017856	AAC	3	9	70788	70796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017856	ACC	2	6	70857	70862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017856	TTA	2	6	70880	70885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017856	AGG	2	6	70974	70979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017856	TAA	2	6	71002	71007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017856	TA	3	6	71023	71028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017856	TTA	2	6	71045	71050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017856	GCTTG	2	10	71120	71129	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017856	AAG	2	6	71238	71243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017856	ATA	2	6	71251	71256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017856	TAT	2	6	71303	71308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017856	A	7	7	71378	71384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017856	ATC	2	6	71398	71403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017856	CAA	2	6	71469	71474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017856	TGG	2	6	71488	71493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017856	ATT	2	6	71494	71499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017856	AAC	2	6	75109	75114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017856	TTAAT	2	10	75124	75133	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017856	CAA	2	6	75898	75903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017856	TCT	2	6	79295	79300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017856	ATC	2	6	80317	80322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017856	CTT	2	6	80345	80350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017856	GA	3	6	80477	80482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017856	TGGGC	2	10	80491	80500	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017856	TCAA	2	8	80514	80521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017856	CAAC	2	8	81817	81824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017856	TAT	2	6	81836	81841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017856	ATT	2	6	82605	82610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017856	GTCA	2	8	82626	82633	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017856	TTCC	2	8	82634	82641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017856	CA	3	6	82678	82683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017856	A	8	8	82688	82695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017856	TTG	2	6	82718	82723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017856	ATA	2	6	82730	82735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017856	A	7	7	82765	82771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017856	TAA	2	6	84163	84168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017856	GTG	2	6	84193	84198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017856	AATA	2	8	84242	84249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017856	CGTT	2	8	84254	84261	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017856	T	6	6	84314	84319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017856	TTTA	2	8	84392	84399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017856	TTA	2	6	84429	84434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017856	GTC	2	6	84607	84612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017856	AGC	2	6	84789	84794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017856	AAAC	2	8	84796	84803	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017856	AAT	2	6	87422	87427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017856	TTA	2	6	87444	87449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017856	ATTA	2	8	87597	87604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017856	TAC	2	6	87769	87774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017856	TCG	2	6	87806	87811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017856	TTAT	2	8	89792	89799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017856	TA	4	8	89826	89833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017856	TAAA	2	8	89863	89870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017856	GTT	2	6	89904	89909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017856	TTC	2	6	91264	91269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017856	AAC	2	6	91307	91312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017856	AC	3	6	91319	91324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017856	AAC	2	6	94962	94967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017856	TTAAT	2	10	94977	94986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017856	CCG	2	6	99414	99419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_017856	ATC	2	6	99461	99466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017856	CTTAT	2	10	99486	99495	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017856	TGA	2	6	99505	99510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017856	TTG	2	6	100504	100509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_017856	GTTG	2	8	103078	103085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017856	TC	3	6	103110	103115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
161	NC_017856	TC	3	6	105767	105772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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284	NC_017856	CACT	2	8	207952	207959	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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291	NC_017856	A	7	7	223189	223195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_017856	GC	3	6	223283	223288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
293	NC_017856	T	6	6	223325	223330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_017856	TC	3	6	319993	319998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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426	NC_017856	GCT	2	6	320196	320201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_017856	TTG	2	6	320243	320248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
428	NC_017856	GAT	2	6	320387	320392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
429	NC_017856	ACA	2	6	320549	320554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_017856	GTGCT	2	10	320617	320626	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
431	NC_017856	AT	3	6	320721	320726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_017856	GTA	2	6	320763	320768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
433	NC_017856	T	7	7	320854	320860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_017856	TG	3	6	320876	320881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
435	NC_017856	AGA	2	6	324514	324519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_017856	ACT	2	6	325530	325535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
439	NC_017856	ACA	2	6	325538	325543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_017856	GAT	2	6	325582	325587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
441	NC_017856	A	8	8	325592	325599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017856	TGC	2	6	326173	326178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_017856	ATA	2	6	326217	326222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_017856	A	6	6	326245	326250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_017856	GCT	2	6	326281	326286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_017856	AAG	2	6	326312	326317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_017856	TTA	2	6	326319	326324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_017856	TTA	2	6	326637	326642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_017856	TTA	2	6	326654	326659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_017856	ATC	2	6	326704	326709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_017856	TCAGG	2	10	335391	335400	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
454	NC_017856	ATT	2	6	335417	335422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_017856	TTGG	2	8	335423	335430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
456	NC_017856	GTT	2	6	335438	335443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_017856	CAA	2	6	338822	338827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
460	NC_017856	TCC	2	6	338828	338833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
461	NC_017856	ATT	2	6	341210	341215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_017856	TAT	2	6	341249	341254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017856	ATT	2	6	341274	341279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_017856	CAT	2	6	341362	341367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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468	NC_017856	CAT	2	6	344098	344103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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491	NC_017856	ACC	2	6	355260	355265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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