MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 9171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017524	CCG	2	6	1476818	1476823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_017524	CG	4	8	1476822	1476829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_017524	GACG	2	8	1476872	1476879	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_017524	TGG	2	6	1476999	1477004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017524	C	6	6	1477012	1477017	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3006	NC_017524	ACA	2	6	1477097	1477102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_017524	CCCT	2	8	1477103	1477110	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3008	NC_017524	AAAC	2	8	1477129	1477136	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_017524	C	6	6	1477178	1477183	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3010	NC_017524	CGG	2	6	1477209	1477214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_017524	GAT	2	6	1477276	1477281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017524	CCG	2	6	1477311	1477316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_017524	GGT	2	6	1477342	1477347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017524	CGGG	2	8	1477428	1477435	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3015	NC_017524	CAA	2	6	1479430	1479435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_017524	GTC	2	6	1479485	1479490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_017524	GC	3	6	1481177	1481182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_017524	GTT	2	6	1481187	1481192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017524	GT	3	6	1484540	1484545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017524	AAC	2	6	1484562	1484567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_017524	GC	3	6	1484574	1484579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_017524	GGC	2	6	1485592	1485597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_017524	CTG	2	6	1485607	1485612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_017524	GGTC	2	8	1486116	1486123	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3025	NC_017524	GAG	2	6	1486145	1486150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017524	GGC	2	6	1487355	1487360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_017524	TCC	2	6	1490277	1490282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_017524	TCA	2	6	1490390	1490395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_017524	TG	3	6	1494759	1494764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017524	CTT	2	6	1494767	1494772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_017524	ACCC	2	8	1494782	1494789	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3032	NC_017524	CGG	2	6	1494824	1494829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_017524	GTAAG	2	10	1494856	1494865	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017524	CCG	2	6	1497464	1497469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_017524	AGA	2	6	1497470	1497475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017524	GCG	2	6	1501895	1501900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_017524	CCGCG	2	10	1507842	1507851	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3038	NC_017524	ACG	2	6	1509234	1509239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_017524	GCT	2	6	1512939	1512944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_017524	TGA	2	6	1513042	1513047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017524	CCGC	2	8	1513110	1513117	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3042	NC_017524	CGG	2	6	1513246	1513251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_017524	GCC	2	6	1513331	1513336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_017524	GA	3	6	1513339	1513344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017524	ACC	2	6	1517678	1517683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_017524	TCC	2	6	1517704	1517709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_017524	AGA	2	6	1517757	1517762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017524	CGC	2	6	1517767	1517772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_017524	TGC	2	6	1518884	1518889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_017524	AGCGG	2	10	1518892	1518901	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3051	NC_017524	GAT	2	6	1518959	1518964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017524	GCC	2	6	1518984	1518989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_017524	GGCA	2	8	1519039	1519046	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3054	NC_017524	GAG	2	6	1519061	1519066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017524	TGC	2	6	1525134	1525139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_017524	AGC	2	6	1525150	1525155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_017524	TGC	2	6	1525184	1525189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_017524	CG	3	6	1525295	1525300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_017524	CACGCG	2	12	1525312	1525323	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_017524	GTT	2	6	1525373	1525378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017524	TGG	2	6	1525435	1525440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017524	ATTC	2	8	1525495	1525502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_017524	CCCA	2	8	1525516	1525523	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3064	NC_017524	TGCG	2	8	1525531	1525538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3065	NC_017524	CAC	2	6	1526590	1526595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_017524	GTC	2	6	1526600	1526605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_017524	TAC	2	6	1526685	1526690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_017524	GGC	2	6	1526751	1526756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_017524	CGG	2	6	1526792	1526797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_017524	GCC	2	6	1526824	1526829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_017524	GCCAG	2	10	1526843	1526852	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3072	NC_017524	CGG	2	6	1531304	1531309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_017524	ATC	2	6	1531315	1531320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_017524	AG	3	6	1531337	1531342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017524	TCG	2	6	1531451	1531456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_017524	TCAT	2	8	1531498	1531505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3077	NC_017524	CAT	2	6	1531512	1531517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_017524	AGC	2	6	1531527	1531532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_017524	ATC	2	6	1531538	1531543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_017524	GTC	2	6	1531559	1531564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_017524	GC	3	6	1531574	1531579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_017524	TG	3	6	1531582	1531587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017524	GC	3	6	1532679	1532684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_017524	CCA	2	6	1532700	1532705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_017524	TGCG	2	8	1532735	1532742	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3086	NC_017524	ATG	2	6	1533978	1533983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017524	AAC	2	6	1533991	1533996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_017524	TC	3	6	1534015	1534020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_017524	AGT	2	6	1534022	1534027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_017524	GCC	2	6	1534054	1534059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_017524	AGC	2	6	1534209	1534214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_017524	CACC	2	8	1535810	1535817	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3093	NC_017524	GCA	2	6	1535831	1535836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_017524	CT	3	6	1535850	1535855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3095	NC_017524	TGTCG	2	10	1535918	1535927	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3096	NC_017524	CCT	2	6	1537953	1537958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_017524	GCAAC	2	10	1538007	1538016	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3098	NC_017524	GCC	2	6	1538074	1538079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_017524	CTC	2	6	1538475	1538480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_017524	CGG	2	6	1538483	1538488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_017524	GC	3	6	1538520	1538525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_017524	CGT	2	6	1538536	1538541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_017524	GGCC	2	8	1538555	1538562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_017524	CGG	2	6	1538586	1538591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_017524	CG	3	6	1538633	1538638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_017524	CCG	2	6	1538668	1538673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_017524	TGGC	2	8	1539513	1539520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3108	NC_017524	GTC	2	6	1539524	1539529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_017524	AAG	2	6	1539582	1539587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017524	GC	3	6	1539729	1539734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_017524	CGG	2	6	1541050	1541055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_017524	GCG	2	6	1541147	1541152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_017524	GCT	2	6	1541175	1541180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_017524	GCT	2	6	1541281	1541286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_017524	TGGCC	2	10	1542145	1542154	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3116	NC_017524	GCC	2	6	1542181	1542186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_017524	GAA	2	6	1542190	1542195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017524	GGA	2	6	1542288	1542293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017524	TC	3	6	1545949	1545954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_017524	TGC	2	6	1545963	1545968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_017524	ACA	2	6	1545993	1545998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_017524	CAG	2	6	1546007	1546012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_017524	GGA	2	6	1546552	1546557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017524	CGAC	2	8	1546634	1546641	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_017524	AG	3	6	1546679	1546684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017524	GAG	2	6	1546687	1546692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017524	CGC	2	6	1546743	1546748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_017524	CGC	2	6	1560228	1560233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_017524	CCA	2	6	1560240	1560245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3130	NC_017524	GTG	2	6	1560253	1560258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_017524	CGT	2	6	1560297	1560302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_017524	ATATTC	2	12	1560331	1560342	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3133	NC_017524	TGGC	2	8	1562345	1562352	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3134	NC_017524	GA	3	6	1562361	1562366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_017524	GAT	2	6	1562398	1562403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_017524	AGC	2	6	1562429	1562434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_017524	GAT	2	6	1562438	1562443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_017524	TTG	2	6	1562446	1562451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_017524	CG	3	6	1562516	1562521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3140	NC_017524	GCC	2	6	1562575	1562580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3141	NC_017524	GTC	2	6	1562585	1562590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3142	NC_017524	CGT	2	6	1562594	1562599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3143	NC_017524	GCCG	2	8	1563212	1563219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3144	NC_017524	TGG	2	6	1563242	1563247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_017524	GGC	2	6	1563272	1563277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3146	NC_017524	G	6	6	1563317	1563322	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_017524	CGT	2	6	1563973	1563978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3149	NC_017524	CGG	2	6	1565645	1565650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3152	NC_017524	TTA	2	6	1572961	1572966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_017524	CG	3	6	1572971	1572976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3154	NC_017524	GCG	2	6	1573005	1573010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3155	NC_017524	GTC	2	6	1573043	1573048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3157	NC_017524	CGG	2	6	1573751	1573756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3158	NC_017524	GCG	2	6	1573757	1573762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3159	NC_017524	GCC	2	6	1573781	1573786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3160	NC_017524	CGG	2	6	1575768	1575773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3161	NC_017524	GGT	2	6	1575777	1575782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3162	NC_017524	GGGC	2	8	1575791	1575798	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3163	NC_017524	AGC	2	6	1576488	1576493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3164	NC_017524	CG	3	6	1576538	1576543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3165	NC_017524	TGC	2	6	1576546	1576551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3171	NC_017524	CCGT	2	8	1580038	1580045	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3172	NC_017524	GAC	2	6	1580056	1580061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3173	NC_017524	AAGT	2	8	1580924	1580931	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3174	NC_017524	CGG	2	6	1580969	1580974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3192	NC_017524	GGT	2	6	1603808	1603813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3201	NC_017524	TCG	2	6	1610221	1610226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3203	NC_017524	CTC	2	6	1611915	1611920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3205	NC_017524	CAAT	2	8	1611943	1611950	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3213	NC_017524	ACA	2	6	1612243	1612248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3214	NC_017524	GAG	2	6	1612257	1612262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3225	NC_017524	TCGA	2	8	1615809	1615816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3226	NC_017524	CGCGC	2	10	1615831	1615840	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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3228	NC_017524	CGCGT	2	10	1615875	1615884	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3229	NC_017524	CTG	2	6	1615902	1615907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3232	NC_017524	GGCA	2	8	1616750	1616757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3233	NC_017524	CCG	2	6	1617046	1617051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3234	NC_017524	ACCGG	2	10	1617052	1617061	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3235	NC_017524	CTG	2	6	1617110	1617115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3242	NC_017524	GCA	2	6	1621084	1621089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3243	NC_017524	CAC	2	6	1621098	1621103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3244	NC_017524	CCTCG	2	10	1621621	1621630	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3245	NC_017524	GCT	2	6	1621922	1621927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3246	NC_017524	TC	3	6	1621948	1621953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3247	NC_017524	CGA	2	6	1622040	1622045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3248	NC_017524	CGA	2	6	1622055	1622060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3249	NC_017524	CTC	2	6	1622175	1622180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3250	NC_017524	CTC	3	9	1624279	1624287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3251	NC_017524	TCGCT	2	10	1624289	1624298	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3252	NC_017524	TCG	2	6	1624304	1624309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_017524	GAT	2	6	1629128	1629133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_017524	CG	3	6	1629216	1629221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3255	NC_017524	CTG	3	9	1629284	1629292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3256	NC_017524	GTG	2	6	1629325	1629330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_017524	CGGC	2	8	1629340	1629347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3258	NC_017524	CAT	2	6	1629386	1629391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3260	NC_017524	GAA	2	6	1629502	1629507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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