MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 9171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017524	TGC	2	6	1251883	1251888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_017524	TGG	2	6	1251912	1251917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_017524	GGC	2	6	1251920	1251925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_017524	ACA	2	6	1253360	1253365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_017524	CTG	2	6	1253381	1253386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_017524	CTG	2	6	1253417	1253422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_017524	TCGA	2	8	1261719	1261726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2508	NC_017524	GGT	2	6	1261729	1261734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_017524	CCGC	2	8	1261738	1261745	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2510	NC_017524	CCGAT	2	10	1261756	1261765	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2511	NC_017524	GCC	2	6	1261829	1261834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2512	NC_017524	GCGCG	2	10	1261837	1261846	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2513	NC_017524	GGTG	2	8	1261890	1261897	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_017524	CGG	2	6	1261954	1261959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_017524	CAG	2	6	1262059	1262064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_017524	CGGC	2	8	1262099	1262106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2517	NC_017524	CGGC	2	8	1262113	1262120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2518	NC_017524	CGC	2	6	1262158	1262163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2519	NC_017524	ATG	2	6	1262202	1262207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_017524	CGC	2	6	1262226	1262231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2521	NC_017524	GTG	2	6	1262525	1262530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_017524	CGC	2	6	1262553	1262558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2523	NC_017524	CG	3	6	1262604	1262609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_017524	GCT	2	6	1262616	1262621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_017524	GCTG	2	8	1264553	1264560	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2528	NC_017524	GC	3	6	1264632	1264637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2529	NC_017524	CAC	2	6	1264642	1264647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_017524	AGCC	2	8	1264930	1264937	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2531	NC_017524	GGC	2	6	1264938	1264943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_017524	CGC	3	9	1265343	1265351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2533	NC_017524	CGA	2	6	1265384	1265389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2535	NC_017524	AGG	2	6	1265422	1265427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2541	NC_017524	CAGCC	2	10	1267425	1267434	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2542	NC_017524	TCG	2	6	1267555	1267560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_017524	TCG	2	6	1267613	1267618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_017524	GTG	2	6	1267647	1267652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2546	NC_017524	CG	3	6	1268558	1268563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2547	NC_017524	GCA	2	6	1269374	1269379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2553	NC_017524	AAAG	2	8	1272280	1272287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_017524	CGA	2	6	1272331	1272336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_017524	GAG	2	6	1272366	1272371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_017524	GCT	2	6	1272433	1272438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_017524	AG	3	6	1272475	1272480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2559	NC_017524	GTC	2	6	1272515	1272520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_017524	GCC	2	6	1272546	1272551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2561	NC_017524	CGGT	2	8	1272600	1272607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2562	NC_017524	TGC	2	6	1272612	1272617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_017524	TGG	2	6	1272625	1272630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_017524	GTT	2	6	1272694	1272699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2572	NC_017524	GGATC	2	10	1276087	1276096	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2573	NC_017524	ACC	2	6	1276211	1276216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2584	NC_017524	GCT	2	6	1276572	1276577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_017524	GGTC	2	8	1276599	1276606	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2589	NC_017524	CG	3	6	1278690	1278695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2590	NC_017524	ACC	2	6	1278704	1278709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2591	NC_017524	CAGGC	2	10	1278765	1278774	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2592	NC_017524	CTG	2	6	1278791	1278796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2596	NC_017524	AGATC	2	10	1278946	1278955	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2597	NC_017524	CGG	2	6	1278982	1278987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_017524	CCA	2	6	1278992	1278997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2599	NC_017524	CGC	2	6	1279006	1279011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2600	NC_017524	ACCT	2	8	1279103	1279110	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2601	NC_017524	CGG	2	6	1279111	1279116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_017524	CTG	2	6	1279121	1279126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_017524	GCT	2	6	1282277	1282282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_017524	CGG	2	6	1282283	1282288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_017524	TCG	2	6	1282309	1282314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_017524	CTC	2	6	1282338	1282343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2607	NC_017524	TCG	2	6	1282369	1282374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_017524	AGGCT	2	10	1282377	1282386	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2609	NC_017524	GTC	2	6	1282482	1282487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_017524	GGC	3	9	1282510	1282518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_017524	CCG	2	6	1282563	1282568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2612	NC_017524	GCT	2	6	1282594	1282599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_017524	GCG	2	6	1282602	1282607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_017524	TCA	2	6	1282630	1282635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_017524	GTCC	2	8	1282640	1282647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2625	NC_017524	CGGC	2	8	1287605	1287612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2626	NC_017524	CG	3	6	1287640	1287645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2627	NC_017524	CGGCC	2	10	1287650	1287659	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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2629	NC_017524	CCA	2	6	1293138	1293143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2631	NC_017524	CG	3	6	1296435	1296440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2632	NC_017524	CGG	2	6	1298435	1298440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2753	NC_017524	GC	3	6	1357497	1357502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2754	NC_017524	GGC	2	6	1357516	1357521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2759	NC_017524	C	6	6	1357613	1357618	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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2884	NC_017524	TGCT	2	8	1453275	1453282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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