MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 9171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017524	GGT	2	6	610680	610685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017524	GTCC	2	8	610701	610708	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_017524	GCA	2	6	611712	611717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017524	GAA	2	6	611728	611733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017524	ATG	2	6	611799	611804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017524	GTC	2	6	611821	611826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017524	CGG	2	6	612523	612528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017524	CCA	2	6	614304	614309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_017524	TGG	2	6	614348	614353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017524	GTC	2	6	614409	614414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017524	GC	3	6	617876	617881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_017524	GCA	2	6	620474	620479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_017524	CCG	2	6	621731	621736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_017524	TCG	3	9	621750	621758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017524	GC	3	6	621804	621809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_017524	GAG	2	6	621845	621850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017524	CCT	2	6	621869	621874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_017524	GGC	2	6	622322	622327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017524	TCG	2	6	625162	625167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017524	CGA	2	6	625183	625188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017524	GCCC	2	8	625201	625208	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1022	NC_017524	C	6	6	629400	629405	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1023	NC_017524	TGG	2	6	629441	629446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017524	GGCCG	2	10	629460	629469	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1025	NC_017524	CGA	2	6	629505	629510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017524	AGCC	2	8	629682	629689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_017524	GGA	2	6	631376	631381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017524	GCAGG	2	10	635174	635183	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1029	NC_017524	CAG	3	9	635184	635192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017524	CCGG	2	8	635206	635213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_017524	CTG	2	6	637139	637144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_017524	TCG	2	6	637201	637206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017524	CGG	2	6	637663	637668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017524	TCG	2	6	638630	638635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017524	TGCC	2	8	639643	639650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_017524	GGC	2	6	639733	639738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_017524	GCT	2	6	639774	639779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017524	TCA	2	6	639786	639791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1040	NC_017524	CGG	2	6	640575	640580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_017524	CGCC	2	8	640588	640595	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1042	NC_017524	CGG	2	6	640661	640666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017524	CAGAT	2	10	640717	640726	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1044	NC_017524	CGGCC	2	10	645923	645932	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1045	NC_017524	CGT	2	6	650425	650430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017524	GCCG	2	8	651185	651192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_017524	CAG	2	6	653497	653502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1049	NC_017524	TGA	2	6	654431	654436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017524	GAG	2	6	654453	654458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017524	TGGC	2	8	654475	654482	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_017524	GCG	2	6	654493	654498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_017524	CGA	2	6	655655	655660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1055	NC_017524	CGC	2	6	657204	657209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_017524	CCT	2	6	657714	657719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_017524	GT	3	6	657733	657738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017524	GGC	2	6	657770	657775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_017524	CCA	2	6	657851	657856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_017524	CG	3	6	657902	657907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_017524	CGGT	2	8	657929	657936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_017524	GCG	2	6	657942	657947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017524	CAA	2	6	657962	657967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_017524	TGG	2	6	659017	659022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017524	CAA	2	6	659085	659090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017524	TGG	2	6	660596	660601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017524	CCG	2	6	660614	660619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_017524	GTGC	2	8	660629	660636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_017524	AAGG	2	8	660652	660659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017524	CGA	2	6	660948	660953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017524	CGG	2	6	663038	663043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_017524	CGGC	2	8	663136	663143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_017524	GT	3	6	664490	664495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1076	NC_017524	GGT	2	6	664640	664645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1084	NC_017524	CGG	2	6	665347	665352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1086	NC_017524	GAC	2	6	665497	665502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1088	NC_017524	ACC	2	6	668064	668069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_017524	GCC	2	6	668070	668075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1094	NC_017524	GAT	2	6	670823	670828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1096	NC_017524	CAGGT	2	10	675581	675590	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1097	NC_017524	TG	3	6	675622	675627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017524	TTG	2	6	675687	675692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017524	CGAA	2	8	675730	675737	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_017524	GGT	2	6	676659	676664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017524	GC	3	6	676665	676670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_017524	TCG	2	6	676676	676681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017524	CGG	2	6	676709	676714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017524	GCG	2	6	676721	676726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017524	CCA	2	6	676735	676740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1107	NC_017524	CAA	2	6	677326	677331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017524	AT	3	6	677333	677338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017524	GTA	2	6	677349	677354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1111	NC_017524	GC	3	6	678732	678737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_017524	CCGG	2	8	678761	678768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_017524	GC	3	6	678801	678806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_017524	TTCA	2	8	684047	684054	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1116	NC_017524	GCT	2	6	695158	695163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017524	CGC	2	6	695168	695173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_017524	GCT	2	6	695217	695222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017524	TGG	2	6	695243	695248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017524	GC	3	6	695270	695275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_017524	CGGA	2	8	695277	695284	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_017524	GCC	2	6	695286	695291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_017524	CAT	2	6	696634	696639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1127	NC_017524	GCT	2	6	696701	696706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017524	CGGG	2	8	696741	696748	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_017524	TGG	2	6	696757	696762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017524	GTT	2	6	696788	696793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017524	CCG	2	6	697504	697509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_017524	CGA	2	6	697522	697527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_017524	GCG	2	6	697542	697547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_017524	CGG	2	6	698142	698147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_017524	TTC	2	6	698150	698155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_017524	GCG	2	6	698172	698177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_017524	GGC	2	6	698650	698655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_017524	GAG	2	6	699885	699890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_017524	CGC	2	6	700870	700875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1140	NC_017524	ACC	2	6	700878	700883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1141	NC_017524	CGT	2	6	700907	700912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1143	NC_017524	GCG	2	6	702436	702441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1167	NC_017524	CGC	2	6	711887	711892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1257	NC_017524	TCG	2	6	754679	754684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1262	NC_017524	GGGGA	2	10	758705	758714	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_017524	CATC	2	8	759510	759517	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1264	NC_017524	GC	3	6	759601	759606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1404	NC_017524	GTC	2	6	811610	811615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1407	NC_017524	CTGG	2	8	811727	811734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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