MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 9171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017524	GTG	2	6	231337	231342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017524	ACAT	2	8	231373	231380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_017524	GCG	2	6	231395	231400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017524	CTG	2	6	241052	241057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017524	GTGC	2	8	241086	241093	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
506	NC_017524	GGC	2	6	241155	241160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017524	TCG	2	6	241190	241195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017524	GCC	2	6	241213	241218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_017524	CCG	3	9	241689	241697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_017524	G	6	6	243038	243043	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017524	GCC	2	6	243059	243064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_017524	CGC	2	6	243097	243102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_017524	ACG	2	6	243109	243114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017524	CCG	2	6	243115	243120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_017524	CA	3	6	247125	247130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_017524	GCC	2	6	248677	248682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_017524	CGG	2	6	248715	248720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_017524	CTG	2	6	248732	248737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017524	CGG	2	6	248748	248753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017524	CCA	2	6	248762	248767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_017524	GAAC	2	8	248772	248779	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
522	NC_017524	GTT	2	6	251367	251372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017524	CCA	2	6	251471	251476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_017524	CGCA	2	8	253381	253388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
525	NC_017524	GACG	2	8	255790	255797	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
526	NC_017524	GGA	2	6	255801	255806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017524	AGA	2	6	255813	255818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017524	TGC	2	6	257438	257443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017524	CCA	2	6	257492	257497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_017524	TGG	2	6	260670	260675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017524	CTC	3	9	267529	267537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_017524	TCG	2	6	267554	267559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017524	CGG	2	6	267561	267566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017524	GTG	2	6	272636	272641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017524	GCGG	2	8	272671	272678	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
536	NC_017524	TCG	2	6	272692	272697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017524	CCT	2	6	272722	272727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_017524	TCG	2	6	272742	272747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017524	CAG	2	6	272800	272805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017524	CGGC	2	8	274037	274044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_017524	GCAGT	2	10	275759	275768	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
542	NC_017524	TCG	2	6	275779	275784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017524	CG	3	6	277567	277572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_017524	AGG	2	6	277645	277650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017524	TCG	2	6	280899	280904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017524	GCC	2	6	286621	286626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_017524	GCG	2	6	286634	286639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017524	CTC	2	6	286834	286839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_017524	C	6	6	286898	286903	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
550	NC_017524	TAGA	2	8	288146	288153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017524	GC	3	6	291818	291823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_017524	ACTT	2	8	291851	291858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
553	NC_017524	GTA	2	6	291876	291881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017524	GCC	2	6	293299	293304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_017524	GGT	2	6	293322	293327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017524	GTT	2	6	293373	293378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017524	CCCCGA	2	12	293386	293397	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_017524	GCC	2	6	293427	293432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_017524	TGG	2	6	293435	293440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017524	GCG	2	6	293452	293457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017524	TCGT	2	8	293477	293484	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_017524	CCA	2	6	293496	293501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_017524	TCC	2	6	295395	295400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_017524	CCA	2	6	295457	295462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_017524	AT	3	6	295477	295482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017524	AACT	2	8	295527	295534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
567	NC_017524	AACC	2	8	295535	295542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_017524	GCG	2	6	295586	295591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017524	GAA	2	6	295605	295610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017524	GGC	2	6	295625	295630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017524	ATC	2	6	295648	295653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017524	GC	3	6	295688	295693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_017524	ACA	2	6	296282	296287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017524	ATG	2	6	296320	296325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017524	AGT	2	6	296349	296354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017524	GC	3	6	296401	296406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_017524	GAT	2	6	296426	296431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017524	GCC	2	6	296446	296451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_017524	CCG	2	6	296494	296499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_017524	ATGC	2	8	296525	296532	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_017524	TCG	2	6	301438	301443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017524	G	6	6	301475	301480	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017524	GACG	2	8	301843	301850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
584	NC_017524	CGG	2	6	301886	301891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017524	CGGCC	2	10	301898	301907	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
586	NC_017524	CA	3	6	302531	302536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_017524	GGA	2	6	305189	305194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017524	AGG	2	6	305198	305203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017524	GGC	2	6	306122	306127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_017524	CGG	2	6	309303	309308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017524	CCG	2	6	309313	309318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_017524	GTC	2	6	309327	309332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_017524	AGC	2	6	309341	309346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017524	CAG	2	6	309359	309364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017524	GTG	3	9	309366	309374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017524	CGG	2	6	309852	309857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017524	TCGG	2	8	309880	309887	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
598	NC_017524	GCG	2	6	309893	309898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_017524	GTC	2	6	309920	309925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_017524	CGG	2	6	309955	309960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017524	CCA	2	6	309984	309989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_017524	CA	3	6	310013	310018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_017524	TGC	2	6	312461	312466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017524	TTG	2	6	313970	313975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017524	GGC	2	6	314042	314047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017524	AGCGG	2	10	314053	314062	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
607	NC_017524	GCT	2	6	315523	315528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017524	TCC	2	6	315529	315534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_017524	TCGGC	2	10	316216	316225	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
610	NC_017524	CG	4	8	317272	317279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_017524	GC	3	6	320997	321002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
612	NC_017524	CGG	3	9	322484	322492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017524	ATA	2	6	323061	323066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017524	CG	3	6	326010	326015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_017524	AAC	2	6	328267	328272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_017524	TTA	2	6	328284	328289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017524	AGATTC	2	12	330118	330129	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
618	NC_017524	GCC	2	6	330143	330148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_017524	ATC	2	6	331418	331423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017524	AGTTC	2	10	332926	332935	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
621	NC_017524	TCG	2	6	332943	332948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017524	ACA	2	6	332959	332964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017524	GCC	2	6	333038	333043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_017524	GCG	3	9	333051	333059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017524	CCG	2	6	333065	333070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_017524	AGT	2	6	333138	333143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017524	GGT	2	6	333161	333166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017524	ATG	2	6	333171	333176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017524	AAG	2	6	336003	336008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017524	G	6	6	336034	336039	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017524	GGTA	2	8	336053	336060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017524	GCCG	2	8	336140	336147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_017524	TGGC	2	8	336152	336159	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_017524	CGG	2	6	336160	336165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_017524	AAG	2	6	338962	338967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_017524	G	6	6	338993	338998	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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952	NC_017524	TGG	2	6	577141	577146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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