MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 9171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017524	CGT	2	6	2864251	2864256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_017524	CGACT	2	10	2864257	2864266	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6003	NC_017524	TTC	2	6	2864273	2864278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_017524	TCT	2	6	2864325	2864330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_017524	GCG	3	9	2864430	2864438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_017524	CAGC	2	8	2864467	2864474	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_017524	GTT	2	6	2864506	2864511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_017524	GCA	2	6	2864524	2864529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_017524	CAACG	2	10	2864551	2864560	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6010	NC_017524	GCTG	2	8	2865308	2865315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6011	NC_017524	TTG	2	6	2865322	2865327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_017524	CGC	2	6	2865332	2865337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_017524	GTG	2	6	2865339	2865344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_017524	CCG	2	6	2865362	2865367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_017524	GCC	3	9	2865373	2865381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_017524	CG	3	6	2865455	2865460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6017	NC_017524	GC	3	6	2865521	2865526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_017524	AGCA	2	8	2865554	2865561	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6019	NC_017524	CGC	2	6	2865570	2865575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_017524	CGACGG	2	12	2865578	2865589	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_017524	TTC	2	6	2871395	2871400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_017524	GC	3	6	2871902	2871907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_017524	CGGC	2	8	2871947	2871954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_017524	GGA	2	6	2871960	2871965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_017524	CGG	2	6	2872659	2872664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_017524	GCCCGA	2	12	2872673	2872684	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_017524	CTG	2	6	2872698	2872703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_017524	GCG	2	6	2872715	2872720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_017524	GAC	2	6	2874846	2874851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_017524	AAT	2	6	2874879	2874884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_017524	CG	3	6	2874886	2874891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_017524	CG	3	6	2874932	2874937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_017524	CCG	2	6	2875963	2875968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_017524	CTGAT	2	10	2876139	2876148	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6035	NC_017524	GCC	2	6	2876184	2876189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_017524	GGT	2	6	2876205	2876210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_017524	CGA	2	6	2876222	2876227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_017524	ACG	2	6	2876230	2876235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_017524	TGG	2	6	2876269	2876274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_017524	GAT	2	6	2877074	2877079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017524	CGAC	2	8	2877091	2877098	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_017524	GCG	2	6	2879276	2879281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_017524	CCG	2	6	2879282	2879287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_017524	C	6	6	2879300	2879305	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6045	NC_017524	GCC	2	6	2879311	2879316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_017524	CCT	2	6	2889318	2889323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_017524	ATCAC	2	10	2889329	2889338	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6048	NC_017524	CGG	2	6	2889343	2889348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_017524	TCG	2	6	2889363	2889368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_017524	TATT	2	8	2890870	2890877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_017524	CGT	2	6	2890893	2890898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_017524	CAA	2	6	2892790	2892795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_017524	ACG	2	6	2892840	2892845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_017524	CGC	2	6	2892848	2892853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_017524	CGCC	2	8	2895609	2895616	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6056	NC_017524	AGC	2	6	2895655	2895660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_017524	ATT	2	6	2898437	2898442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_017524	AAC	2	6	2898445	2898450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_017524	CGAC	2	8	2899474	2899481	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_017524	CG	3	6	2899490	2899495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_017524	GGT	2	6	2899524	2899529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_017524	CAC	2	6	2899563	2899568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_017524	TCT	2	6	2899600	2899605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_017524	GCC	2	6	2899657	2899662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_017524	GCG	2	6	2899716	2899721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_017524	GCCC	2	8	2902683	2902690	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6067	NC_017524	CGG	2	6	2902711	2902716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_017524	TCG	2	6	2905860	2905865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_017524	TCG	2	6	2910720	2910725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_017524	GTATTG	2	12	2911109	2911120	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_017524	CAG	2	6	2911208	2911213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_017524	GAG	2	6	2911251	2911256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_017524	CAG	3	9	2912662	2912670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_017524	AT	3	6	2912685	2912690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_017524	GCGCC	2	10	2912724	2912733	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6076	NC_017524	GCC	2	6	2916289	2916294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_017524	GCG	2	6	2916295	2916300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_017524	AGC	2	6	2916312	2916317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_017524	AAG	2	6	2916351	2916356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_017524	ATC	2	6	2916403	2916408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_017524	TCC	2	6	2918089	2918094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_017524	CCGTTG	2	12	2921045	2921056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_017524	GT	3	6	2921058	2921063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_017524	CCGG	2	8	2921140	2921147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_017524	GA	3	6	2922826	2922831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_017524	GGC	2	6	2924875	2924880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_017524	GCA	2	6	2924896	2924901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_017524	GCG	2	6	2926522	2926527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_017524	TCG	2	6	2928060	2928065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_017524	CCT	2	6	2928977	2928982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6091	NC_017524	TACGA	2	10	2928994	2929003	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6092	NC_017524	GCA	2	6	2929082	2929087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_017524	TCG	2	6	2929775	2929780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_017524	GAC	2	6	2929874	2929879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_017524	CGC	2	6	2929898	2929903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_017524	GGT	2	6	2929904	2929909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_017524	GGTC	2	8	2938172	2938179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6098	NC_017524	CGA	2	6	2938233	2938238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_017524	TCC	2	6	2939893	2939898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_017524	GCGG	2	8	2939920	2939927	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6101	NC_017524	CCG	2	6	2939942	2939947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_017524	TGG	2	6	2940020	2940025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_017524	GTG	2	6	2940029	2940034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_017524	GCA	2	6	2940069	2940074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_017524	CG	3	6	2940084	2940089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6106	NC_017524	AGC	2	6	2940109	2940114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_017524	GC	3	6	2940161	2940166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6108	NC_017524	TG	3	6	2940185	2940190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_017524	CG	3	6	2940193	2940198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_017524	GGCGCC	2	12	2940733	2940744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_017524	ACA	2	6	2941213	2941218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_017524	CTTC	2	8	2941298	2941305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_017524	TCG	2	6	2943466	2943471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_017524	CCT	2	6	2944399	2944404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6116	NC_017524	CGT	2	6	2944430	2944435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6118	NC_017524	CGG	2	6	2947444	2947449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_017524	TCC	2	6	2947901	2947906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_017524	CTG	2	6	2947931	2947936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_017524	CGT	2	6	2947952	2947957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_017524	GC	3	6	2948012	2948017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_017524	GGC	2	6	2948113	2948118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_017524	AAC	2	6	2948171	2948176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_017524	CGGAAG	2	12	2948202	2948213	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6126	NC_017524	GGC	2	6	2948338	2948343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_017524	GT	3	6	2948353	2948358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_017524	CCA	2	6	2948364	2948369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_017524	CAGC	2	8	2948384	2948391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_017524	GCA	2	6	2949652	2949657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_017524	ACG	2	6	2949676	2949681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_017524	CCG	2	6	2949699	2949704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6133	NC_017524	TG	3	6	2949714	2949719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_017524	GTG	3	9	2949717	2949725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6260	NC_017524	CCG	2	6	2989660	2989665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6261	NC_017524	CGA	2	6	2989667	2989672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6262	NC_017524	GAG	3	9	2989689	2989697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6460	NC_017524	GACA	2	8	3111849	3111856	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6500	NC_017524	CATCGA	2	12	3116937	3116948	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

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