MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 9171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017524	GC	3	6	2611623	2611628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_017524	ACC	2	6	2611639	2611644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5503	NC_017524	TCG	2	6	2614640	2614645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_017524	CGG	2	6	2616075	2616080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_017524	CAT	2	6	2616089	2616094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_017524	TCG	2	6	2616205	2616210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_017524	CTG	2	6	2616219	2616224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_017524	TCG	2	6	2616250	2616255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_017524	GCCGG	2	10	2616271	2616280	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5510	NC_017524	TCA	2	6	2616374	2616379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_017524	GGA	2	6	2616437	2616442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_017524	GAC	2	6	2616537	2616542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_017524	GCA	2	6	2616607	2616612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_017524	AAC	2	6	2617123	2617128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_017524	CGT	2	6	2617147	2617152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_017524	GC	3	6	2617230	2617235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5517	NC_017524	GGAT	2	8	2617256	2617263	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017524	CGC	2	6	2620799	2620804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_017524	CCG	2	6	2620815	2620820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_017524	CTT	2	6	2622884	2622889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_017524	TCG	2	6	2622898	2622903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_017524	TGC	2	6	2623228	2623233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_017524	TTG	2	6	2623555	2623560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017524	TGT	2	6	2623601	2623606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_017524	GCCG	2	8	2623611	2623618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_017524	CCG	2	6	2623633	2623638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5527	NC_017524	CCAGG	2	10	2624014	2624023	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5528	NC_017524	ACC	2	6	2624059	2624064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_017524	CAC	2	6	2625742	2625747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_017524	CCT	2	6	2627373	2627378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_017524	CGTGT	2	10	2627449	2627458	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5532	NC_017524	GCCT	2	8	2627468	2627475	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_017524	GGGC	2	8	2627480	2627487	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5534	NC_017524	GCAA	2	8	2627522	2627529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_017524	CT	3	6	2627622	2627627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_017524	TGA	2	6	2628549	2628554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_017524	GGT	2	6	2629022	2629027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017524	G	6	6	2629397	2629402	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017524	GAA	2	6	2629415	2629420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017524	GCC	2	6	2629421	2629426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_017524	TGA	2	6	2629720	2629725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_017524	ATG	2	6	2629791	2629796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017524	TGC	2	6	2629809	2629814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_017524	CGG	2	6	2629861	2629866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_017524	CAG	2	6	2629916	2629921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_017524	CAG	2	6	2629961	2629966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_017524	GTA	2	6	2629994	2629999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017524	GGT	2	6	2630033	2630038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_017524	CAC	2	6	2630068	2630073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_017524	CCAGG	2	10	2630078	2630087	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5551	NC_017524	CCCA	2	8	2630094	2630101	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5552	NC_017524	GTG	2	6	2630151	2630156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017524	CGGAA	2	10	2630163	2630172	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5554	NC_017524	CGG	2	6	2630182	2630187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_017524	TTG	2	6	2630222	2630227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017524	CTGCGC	2	12	2630410	2630421	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_017524	GAG	2	6	2630459	2630464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017524	CTCAG	2	10	2630498	2630507	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5559	NC_017524	GAC	2	6	2630521	2630526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_017524	GCAACC	2	12	2630582	2630593	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_017524	A	6	6	2630692	2630697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017524	CCGG	2	8	2630745	2630752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5563	NC_017524	CGC	2	6	2630838	2630843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_017524	TGG	2	6	2630890	2630895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_017524	TTGC	2	8	2630945	2630952	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5566	NC_017524	CCA	2	6	2631066	2631071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_017524	GCT	2	6	2631106	2631111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_017524	CT	3	6	2631181	2631186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_017524	ACG	2	6	2631257	2631262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_017524	CGC	3	9	2631264	2631272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_017524	GGA	2	6	2631302	2631307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_017524	CGC	4	12	2631344	2631355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5573	NC_017524	AAC	2	6	2631360	2631365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_017524	CGG	2	6	2631410	2631415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_017524	ATC	2	6	2631435	2631440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_017524	CCAG	2	8	2631452	2631459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_017524	GAA	2	6	2631549	2631554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_017524	CG	3	6	2631566	2631571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_017524	C	6	6	2631616	2631621	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5580	NC_017524	TCA	2	6	2632312	2632317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_017524	CCAG	2	8	2633536	2633543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_017524	CCG	2	6	2633685	2633690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_017524	CGC	2	6	2633750	2633755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_017524	A	6	6	2633850	2633855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_017524	GGC	2	6	2633859	2633864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_017524	ACC	2	6	2633946	2633951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5587	NC_017524	CTC	2	6	2635830	2635835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5588	NC_017524	CG	3	6	2635862	2635867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5589	NC_017524	CAC	2	6	2635896	2635901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_017524	GCC	2	6	2635905	2635910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_017524	CCA	2	6	2635921	2635926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_017524	CG	3	6	2637373	2637378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_017524	CAT	3	9	2637455	2637463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_017524	TCCT	2	8	2637492	2637499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_017524	ACC	2	6	2638332	2638337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5596	NC_017524	GGC	2	6	2638375	2638380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_017524	CGC	2	6	2638395	2638400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5598	NC_017524	T	6	6	2643004	2643009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_017524	CCG	2	6	2643010	2643015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_017524	CAC	2	6	2647876	2647881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_017524	GTG	2	6	2647919	2647924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_017524	ATT	2	6	2647953	2647958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_017524	CGG	2	6	2647980	2647985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_017524	GTC	2	6	2648008	2648013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_017524	AGG	2	6	2648028	2648033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_017524	CGG	2	6	2648262	2648267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_017524	CGG	2	6	2648271	2648276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_017524	GAC	2	6	2648314	2648319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_017524	GCA	2	6	2650333	2650338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_017524	CTCAC	2	10	2651386	2651395	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5611	NC_017524	CGG	2	6	2651432	2651437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_017524	TCG	2	6	2651513	2651518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_017524	TTC	2	6	2652409	2652414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_017524	CGTT	2	8	2652415	2652422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5615	NC_017524	GAGC	2	8	2652491	2652498	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5616	NC_017524	GCA	2	6	2663491	2663496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_017524	TCG	2	6	2663511	2663516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_017524	GGCG	2	8	2663518	2663525	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5619	NC_017524	CGG	2	6	2663533	2663538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_017524	C	6	6	2672201	2672206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5621	NC_017524	CAA	2	6	2673927	2673932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_017524	CGCGG	2	10	2673991	2674000	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5623	NC_017524	C	6	6	2676331	2676336	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5624	NC_017524	GTC	2	6	2676340	2676345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_017524	GAA	2	6	2676368	2676373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_017524	TCG	2	6	2676379	2676384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_017524	GCG	2	6	2676407	2676412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_017524	ACCC	2	8	2676418	2676425	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5629	NC_017524	GCAG	2	8	2676472	2676479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5630	NC_017524	GCTA	2	8	2676565	2676572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5631	NC_017524	TCAC	2	8	2676611	2676618	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5632	NC_017524	CGA	2	6	2676640	2676645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5633	NC_017524	AG	3	6	2676729	2676734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5634	NC_017524	CGA	2	6	2676739	2676744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5641	NC_017524	G	6	6	2676910	2676915	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5672	NC_017524	CCGG	2	8	2688875	2688882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5750	NC_017524	CGGC	2	8	2722370	2722377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5753	NC_017524	TGA	3	9	2722486	2722494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5755	NC_017524	GTT	2	6	2724241	2724246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5759	NC_017524	GTT	2	6	2724636	2724641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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