MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 chromosome

Total Repeats: 12611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017522	GTG	2	6	430527	430532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017522	ATT	2	6	430581	430586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017522	CCTAC	2	10	432638	432647	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1004	NC_017522	CAG	2	6	432649	432654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017522	GAG	2	6	432660	432665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017522	CGA	2	6	434558	434563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017522	CAG	2	6	434622	434627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017522	GGC	2	6	435614	435619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017522	CGG	2	6	435635	435640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017522	TCC	2	6	438118	438123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_017522	GAC	2	6	438125	438130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017522	TC	3	6	441049	441054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_017522	TGG	2	6	448968	448973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017522	GCC	2	6	449022	449027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_017522	GC	3	6	451220	451225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_017522	TGCG	2	8	451313	451320	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_017522	GTG	3	9	451442	451450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017522	GCG	2	6	451512	451517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017522	CGG	2	6	451522	451527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017522	CGG	2	6	451531	451536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017522	GCG	2	6	451539	451544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017522	GCTC	2	8	451693	451700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_017522	CGG	2	6	451724	451729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017522	GAA	2	6	451764	451769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017522	GT	3	6	451792	451797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017522	CAT	2	6	451811	451816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017522	GGC	3	9	451844	451852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017522	GTC	2	6	452646	452651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017522	CGC	2	6	452678	452683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_017522	GC	3	6	452690	452695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_017522	GCC	2	6	453641	453646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_017522	CGC	2	6	454204	454209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_017522	GCG	2	6	454231	454236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017522	GGC	2	6	455147	455152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017522	CCG	3	9	457909	457917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_017522	CGC	2	6	457921	457926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_017522	CTC	2	6	463824	463829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_017522	GCA	2	6	463836	463841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017522	GTC	2	6	463863	463868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_017522	GTCCG	2	10	463901	463910	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1041	NC_017522	TCG	2	6	463919	463924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_017522	GGC	2	6	463965	463970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017522	GGAT	2	8	463986	463993	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017522	TCA	2	6	464004	464009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_017522	CCT	2	6	464052	464057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_017522	AAT	2	6	464107	464112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017522	CGAG	2	8	464129	464136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_017522	GAA	2	6	464166	464171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017522	CAG	2	6	464203	464208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017522	CGG	2	6	464223	464228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017522	CCG	2	6	468415	468420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_017522	TCC	2	6	468455	468460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_017522	GCC	2	6	468569	468574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_017522	TCGGA	2	10	468576	468585	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1055	NC_017522	GGC	2	6	468657	468662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017522	CCGGC	2	10	468693	468702	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1057	NC_017522	TGC	2	6	468762	468767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_017522	TGCGGG	2	12	468866	468877	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1059	NC_017522	GCC	2	6	468906	468911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_017522	GGT	2	6	470716	470721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017522	GAG	2	6	470732	470737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017522	TGC	2	6	471559	471564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017522	TGA	2	6	471566	471571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017522	GTC	2	6	471580	471585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017522	TTC	2	6	471604	471609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017522	CAT	2	6	471623	471628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_017522	TGT	3	9	472051	472059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017522	CCT	2	6	472133	472138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_017522	GCAC	2	8	472209	472216	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_017522	CCGATA	2	12	472292	472303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017522	AT	3	6	472357	472362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017522	CGG	2	6	472373	472378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017522	TG	4	8	472418	472425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017522	CCA	2	6	472460	472465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_017522	CCG	2	6	472481	472486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_017522	CCCGG	2	10	475580	475589	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1077	NC_017522	GTC	2	6	475985	475990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_017522	CAAC	2	8	476078	476085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_017522	CAA	2	6	479493	479498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_017522	GCC	2	6	479499	479504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_017522	A	6	6	479587	479592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017522	GGA	2	6	479688	479693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017522	CGG	2	6	479740	479745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_017522	CGA	2	6	479837	479842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_017522	TGATT	2	10	481761	481770	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017522	AG	4	8	481807	481814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017522	GCA	2	6	481850	481855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_017522	GAA	2	6	481944	481949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017522	ATA	2	6	482042	482047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017522	T	6	6	482050	482055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017522	CCG	2	6	482062	482067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_017522	CAA	2	6	482092	482097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017522	GTT	2	6	482100	482105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017522	ATT	2	6	482143	482148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017522	GTC	2	6	482193	482198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_017522	CTA	2	6	482243	482248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_017522	CGG	2	6	482262	482267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_017522	TTC	2	6	482268	482273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_017522	TAT	2	6	482277	482282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017522	GTCC	2	8	482318	482325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_017522	GGGT	2	8	482454	482461	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017522	GCT	2	6	482492	482497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017522	CCG	2	6	482516	482521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_017522	CTG	2	6	485846	485851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017522	CGC	2	6	485926	485931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_017522	CGA	2	6	485947	485952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017522	GT	3	6	485973	485978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017522	CGG	2	6	486016	486021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017522	CGG	2	6	486028	486033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_017522	GCC	2	6	486071	486076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_017522	GCG	2	6	486077	486082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_017522	GCC	2	6	486115	486120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_017522	GCGCA	2	10	486125	486134	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1114	NC_017522	ACCT	2	8	486179	486186	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_017522	GTGCT	2	10	486210	486219	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1116	NC_017522	GGT	2	6	486247	486252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017522	GC	3	6	486279	486284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_017522	GT	3	6	486295	486300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017522	CAG	2	6	486362	486367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_017522	GTC	2	6	486377	486382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_017522	CGAG	2	8	486414	486421	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_017522	GAGC	2	8	486472	486479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_017522	GCG	2	6	486540	486545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017522	AGAA	2	8	486584	486591	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017522	CCG	2	6	490834	490839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_017522	CGT	2	6	490848	490853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017522	GGC	2	6	490868	490873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017522	CAC	2	6	492591	492596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_017522	CCG	2	6	492646	492651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_017522	CGA	2	6	492686	492691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017522	CAG	2	6	492808	492813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017522	CAC	2	6	492831	492836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1134	NC_017522	CCA	2	6	492890	492895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1402	NC_017522	TAC	2	6	592354	592359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1403	NC_017522	AGG	2	6	592377	592382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_017522	CG	3	6	592411	592416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1405	NC_017522	GAT	2	6	592439	592444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_017522	GCG	2	6	592453	592458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1414	NC_017522	GCA	2	6	596026	596031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1423	NC_017522	CTG	3	9	601995	602003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1426	NC_017522	GCG	2	6	602048	602053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1427	NC_017522	CG	4	8	602052	602059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1429	NC_017522	GCT	3	9	602146	602154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1432	NC_017522	GCC	2	6	604302	604307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1433	NC_017522	AAG	2	6	604322	604327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_017522	TGA	2	6	604414	604419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_017522	GGT	2	6	604427	604432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_017522	GCC	2	6	604441	604446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1437	NC_017522	CAG	2	6	604472	604477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1497	NC_017522	GCAGG	2	10	631233	631242	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1500	NC_017522	ATG	2	6	631734	631739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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