MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 chromosome

Total Repeats: 12611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017522	ACCAG	2	10	4368673	4368682	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12502	NC_017522	TGC	2	6	4368774	4368779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_017522	GCA	2	6	4368780	4368785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_017522	GCT	2	6	4368884	4368889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_017522	GCC	2	6	4370153	4370158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12506	NC_017522	GC	4	8	4370159	4370166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12507	NC_017522	CAC	2	6	4370310	4370315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12508	NC_017522	GTG	2	6	4370324	4370329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_017522	CGG	2	6	4370352	4370357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_017522	GTC	2	6	4370521	4370526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_017522	CGC	2	6	4370556	4370561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12512	NC_017522	GGA	2	6	4370621	4370626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_017522	CG	3	6	4370629	4370634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12514	NC_017522	GC	3	6	4370683	4370688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12515	NC_017522	GACCA	2	10	4377329	4377338	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12516	NC_017522	ACT	2	6	4377401	4377406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_017522	GCA	2	6	4378502	4378507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_017522	CGC	2	6	4378522	4378527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12519	NC_017522	CGA	2	6	4379315	4379320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_017522	GC	3	6	4379358	4379363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12521	NC_017522	CCG	2	6	4379389	4379394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12522	NC_017522	GC	3	6	4379425	4379430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12523	NC_017522	CGG	2	6	4379461	4379466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_017522	ACG	2	6	4379475	4379480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_017522	G	6	6	4379480	4379485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_017522	CCA	2	6	4379535	4379540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12527	NC_017522	ACC	2	6	4379541	4379546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12528	NC_017522	GCC	2	6	4379559	4379564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12529	NC_017522	CCGGC	2	10	4379566	4379575	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12530	NC_017522	CAC	2	6	4379579	4379584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12531	NC_017522	GTA	2	6	4379604	4379609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_017522	GT	3	6	4379663	4379668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_017522	GGA	2	6	4379724	4379729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_017522	GCG	2	6	4379737	4379742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12535	NC_017522	GC	3	6	4379794	4379799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12536	NC_017522	GCC	2	6	4380746	4380751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12537	NC_017522	AGC	2	6	4380770	4380775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_017522	CGT	2	6	4380790	4380795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_017522	CGC	2	6	4381220	4381225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12540	NC_017522	CGC	2	6	4381284	4381289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12541	NC_017522	CAC	2	6	4381360	4381365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12542	NC_017522	AC	3	6	4381375	4381380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12543	NC_017522	CTG	2	6	4381437	4381442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_017522	GCC	2	6	4381568	4381573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12545	NC_017522	ACA	2	6	4381599	4381604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12546	NC_017522	CGC	2	6	4381619	4381624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12547	NC_017522	GCT	2	6	4381713	4381718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12548	NC_017522	TATCT	2	10	4381749	4381758	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12549	NC_017522	GC	3	6	4384935	4384940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12550	NC_017522	CAT	2	6	4384978	4384983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_017522	GCC	2	6	4385024	4385029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12552	NC_017522	CTC	2	6	4385092	4385097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12553	NC_017522	GCC	2	6	4385519	4385524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12554	NC_017522	CGC	2	6	4385535	4385540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12555	NC_017522	CGGT	2	8	4387559	4387566	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12556	NC_017522	GGA	2	6	4387567	4387572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_017522	GTC	2	6	4387626	4387631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_017522	CG	3	6	4387643	4387648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12559	NC_017522	CGA	2	6	4387831	4387836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_017522	CCCG	2	8	4387869	4387876	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12561	NC_017522	CTA	2	6	4387883	4387888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12562	NC_017522	GCG	2	6	4387938	4387943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_017522	GCG	2	6	4387950	4387955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_017522	CCGG	2	8	4387993	4388000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12565	NC_017522	ACCCCG	2	12	4388008	4388019	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12566	NC_017522	TCG	2	6	4388052	4388057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12567	NC_017522	GC	3	6	4388673	4388678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12568	NC_017522	CGT	2	6	4388696	4388701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12569	NC_017522	GGCC	2	8	4388702	4388709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12570	NC_017522	CGG	2	6	4388734	4388739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12571	NC_017522	AGCCC	2	10	4388761	4388770	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12572	NC_017522	GTG	2	6	4388814	4388819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_017522	CGC	3	9	4388912	4388920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12574	NC_017522	CGT	2	6	4388926	4388931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_017522	CTCG	2	8	4388948	4388955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12576	NC_017522	CGG	2	6	4388957	4388962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12577	NC_017522	GCCG	2	8	4388978	4388985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12578	NC_017522	CCGGG	2	10	4394601	4394610	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12579	NC_017522	GCCA	2	8	4394615	4394622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12580	NC_017522	TCGC	2	8	4396099	4396106	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12581	NC_017522	CAG	2	6	4396116	4396121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12582	NC_017522	CGTT	2	8	4396134	4396141	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12583	NC_017522	AG	3	6	4399701	4399706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12584	NC_017522	CCGG	2	8	4399767	4399774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12585	NC_017522	CCG	2	6	4400798	4400803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12586	NC_017522	CCG	2	6	4402660	4402665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12587	NC_017522	GCG	2	6	4402752	4402757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12588	NC_017522	TCGG	2	8	4402758	4402765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12589	NC_017522	GTC	2	6	4404547	4404552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12590	NC_017522	GTCT	2	8	4404568	4404575	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12591	NC_017522	TCC	2	6	4404619	4404624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12592	NC_017522	ACG	2	6	4404741	4404746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12593	NC_017522	GCG	2	6	4404756	4404761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12594	NC_017522	AGAC	2	8	4404853	4404860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12595	NC_017522	TGC	2	6	4404913	4404918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12596	NC_017522	CCGAG	2	10	4404924	4404933	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12597	NC_017522	GCT	2	6	4404945	4404950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12598	NC_017522	GC	3	6	4404956	4404961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12599	NC_017522	CAC	2	6	4404966	4404971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12600	NC_017522	CG	3	6	4405085	4405090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12601	NC_017522	CCA	2	6	4405110	4405115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12602	NC_017522	GTT	2	6	4405162	4405167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_017522	CGC	2	6	4405335	4405340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12604	NC_017522	GTT	2	6	4405343	4405348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_017522	CACT	2	8	4405419	4405426	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12606	NC_017522	GGT	2	6	4405462	4405467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_017522	GCT	2	6	4405472	4405477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_017522	GCT	2	6	4405616	4405621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12609	NC_017522	CAC	2	6	4405663	4405668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12610	NC_017522	AAC	2	6	4405676	4405681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_017522	CAA	2	6	4405916	4405921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.