MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 chromosome

Total Repeats: 12611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017522	CGG	2	6	3473097	3473102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_017522	GTC	2	6	3473126	3473131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_017522	AGG	2	6	3473145	3473150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_017522	GGC	3	9	3473194	3473202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_017522	TTG	2	6	3473208	3473213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_017522	CGG	2	6	3473265	3473270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_017522	GGAGT	2	10	3473308	3473317	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_017522	TGT	2	6	3474245	3474250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_017522	CA	3	6	3474278	3474283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10010	NC_017522	GCC	2	6	3475508	3475513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_017522	GAAT	2	8	3475555	3475562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_017522	AAC	2	6	3475608	3475613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_017522	ATG	2	6	3475627	3475632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_017522	GGCA	2	8	3475634	3475641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10015	NC_017522	TGCAC	2	10	3475694	3475703	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10016	NC_017522	GAGCGG	2	12	3475730	3475741	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10017	NC_017522	GAT	2	6	3475749	3475754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_017522	GCTCA	2	10	3475816	3475825	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10019	NC_017522	GCA	2	6	3475832	3475837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_017522	CGG	2	6	3477367	3477372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_017522	GTA	2	6	3477383	3477388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_017522	GGT	2	6	3477409	3477414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_017522	TGG	2	6	3477430	3477435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_017522	TGA	2	6	3477499	3477504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_017522	TTG	2	6	3477510	3477515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_017522	GTT	2	6	3477611	3477616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_017522	GAA	2	6	3477725	3477730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_017522	CT	3	6	3477773	3477778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10029	NC_017522	TGA	2	6	3478700	3478705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_017522	GAA	2	6	3478755	3478760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_017522	CGC	2	6	3478813	3478818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10032	NC_017522	TCAGC	2	10	3478826	3478835	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10033	NC_017522	TTC	2	6	3478839	3478844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_017522	CCGC	2	8	3479000	3479007	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10035	NC_017522	GCC	2	6	3479430	3479435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10036	NC_017522	CG	3	6	3479495	3479500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10037	NC_017522	ACC	2	6	3479528	3479533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10038	NC_017522	CTT	2	6	3479557	3479562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_017522	CTG	2	6	3479591	3479596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_017522	CG	3	6	3479605	3479610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10041	NC_017522	ACG	2	6	3479643	3479648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_017522	CGA	2	6	3479738	3479743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_017522	AGA	2	6	3479762	3479767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_017522	TCGG	2	8	3479800	3479807	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10045	NC_017522	ACC	2	6	3479814	3479819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_017522	TGA	2	6	3479825	3479830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_017522	GAG	2	6	3481622	3481627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10049	NC_017522	CG	3	6	3481693	3481698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_017522	CAC	2	6	3485116	3485121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10051	NC_017522	GAAT	2	8	3486090	3486097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_017522	CGGC	2	8	3486279	3486286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10053	NC_017522	CCG	2	6	3486309	3486314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10054	NC_017522	GCCC	2	8	3486337	3486344	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10055	NC_017522	CAA	2	6	3486383	3486388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_017522	G	6	6	3486442	3486447	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_017522	GGC	2	6	3488540	3488545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_017522	TTC	2	6	3488576	3488581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_017522	ACC	2	6	3488591	3488596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10060	NC_017522	GTCGAC	2	12	3488626	3488637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_017522	TGA	2	6	3488682	3488687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_017522	CTG	2	6	3488707	3488712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_017522	GCC	2	6	3488713	3488718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10064	NC_017522	CG	3	6	3488784	3488789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10065	NC_017522	TCCCA	2	10	3488852	3488861	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10066	NC_017522	CTG	2	6	3488878	3488883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_017522	TTA	2	6	3488894	3488899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10069	NC_017522	CTG	2	6	3493638	3493643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_017522	TTG	2	6	3495147	3495152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10073	NC_017522	GCT	2	6	3496923	3496928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10077	NC_017522	CCG	2	6	3498219	3498224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10078	NC_017522	GCC	2	6	3498244	3498249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10093	NC_017522	GTCG	2	8	3507775	3507782	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10098	NC_017522	GC	3	6	3514765	3514770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10099	NC_017522	GCC	2	6	3514932	3514937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10100	NC_017522	AAT	2	6	3516885	3516890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10102	NC_017522	CGA	2	6	3516990	3516995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_017522	GC	3	6	3518907	3518912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10104	NC_017522	CGG	2	6	3518932	3518937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_017522	CAC	2	6	3523088	3523093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10106	NC_017522	TGCC	2	8	3523103	3523110	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10107	NC_017522	GGTT	2	8	3523127	3523134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_017522	GCCG	2	8	3526158	3526165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10109	NC_017522	ACG	2	6	3526181	3526186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10111	NC_017522	CGC	2	6	3528549	3528554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10112	NC_017522	GCC	2	6	3528578	3528583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10113	NC_017522	TTAC	2	8	3528613	3528620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10114	NC_017522	AAT	2	6	3528656	3528661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_017522	AGT	2	6	3528709	3528714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10119	NC_017522	GGC	2	6	3528800	3528805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10121	NC_017522	CTC	2	6	3528833	3528838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10122	NC_017522	GTG	2	6	3528852	3528857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_017522	CCCG	2	8	3528865	3528872	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10124	NC_017522	TCG	2	6	3528905	3528910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_017522	GTA	2	6	3529018	3529023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_017522	CGA	2	6	3529050	3529055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_017522	AGC	2	6	3529079	3529084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_017522	GCC	2	6	3529115	3529120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10129	NC_017522	CCAT	2	8	3529153	3529160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10130	NC_017522	G	6	6	3529744	3529749	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_017522	GTT	2	6	3529754	3529759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_017522	CGG	2	6	3529768	3529773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_017522	ACA	2	6	3529801	3529806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10135	NC_017522	GCCA	2	8	3532863	3532870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10136	NC_017522	CAG	2	6	3532899	3532904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10137	NC_017522	CG	3	6	3532918	3532923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10138	NC_017522	GCG	2	6	3532926	3532931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10142	NC_017522	CG	3	6	3533032	3533037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10143	NC_017522	ACC	2	6	3534053	3534058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10152	NC_017522	CGG	2	6	3534772	3534777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10158	NC_017522	ATC	2	6	3535472	3535477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10160	NC_017522	ATC	2	6	3536475	3536480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10161	NC_017522	TG	3	6	3536513	3536518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10162	NC_017522	CGA	2	6	3536583	3536588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10165	NC_017522	CG	3	6	3538119	3538124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10166	NC_017522	CCA	2	6	3538158	3538163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10172	NC_017522	TGA	2	6	3540316	3540321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10173	NC_017522	TCGA	2	8	3540344	3540351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10175	NC_017522	TGCG	2	8	3540444	3540451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10186	NC_017522	CGGT	2	8	3541725	3541732	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10231	NC_017522	TCACC	2	10	3546781	3546790	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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10234	NC_017522	CGA	2	6	3546810	3546815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10238	NC_017522	CAG	2	6	3546945	3546950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10239	NC_017522	GCAA	2	8	3546987	3546994	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10240	NC_017522	CAAGC	2	10	3547004	3547013	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10241	NC_017522	GCT	2	6	3547159	3547164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10242	NC_017522	CGATG	2	10	3547284	3547293	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10243	NC_017522	GCG	2	6	3547766	3547771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10244	NC_017522	GAC	2	6	3547812	3547817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10245	NC_017522	CGA	2	6	3547835	3547840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10246	NC_017522	GCG	2	6	3550812	3550817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10247	NC_017522	CTGG	2	8	3550853	3550860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10248	NC_017522	GCA	2	6	3550906	3550911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10249	NC_017522	CGC	2	6	3551945	3551950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10250	NC_017522	GTC	2	6	3554363	3554368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10251	NC_017522	GAT	2	6	3554472	3554477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_017522	CGT	2	6	3554501	3554506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10254	NC_017522	GTT	2	6	3554646	3554651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10255	NC_017522	CGG	2	6	3556039	3556044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10257	NC_017522	CAC	2	6	3556134	3556139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10261	NC_017522	GTCT	2	8	3556310	3556317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10271	NC_017522	C	6	6	3556655	3556660	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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10365	NC_017522	GCCA	2	8	3587384	3587391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10366	NC_017522	GAACC	2	10	3587403	3587412	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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10373	NC_017522	CCG	2	6	3588638	3588643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10378	NC_017522	CG	3	6	3593394	3593399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10474	NC_017522	GAAC	2	8	3651536	3651543	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10475	NC_017522	AGTG	2	8	3651546	3651553	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10493	NC_017522	GGT	2	6	3663551	3663556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10496	NC_017522	ACC	4	12	3663599	3663610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10497	NC_017522	TG	3	6	3673568	3673573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10498	NC_017522	CT	3	6	3675179	3675184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10499	NC_017522	GTC	2	6	3675193	3675198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10500	NC_017522	GTG	2	6	3675201	3675206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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