MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 chromosome

Total Repeats: 12611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017522	GCC	2	6	2022394	2022399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_017522	CG	3	6	2022501	2022506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_017522	GGTGAT	2	12	2022524	2022535	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_017522	GCC	2	6	2022631	2022636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_017522	CGC	2	6	2022648	2022653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_017522	GCG	2	6	2022670	2022675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_017522	GA	3	6	2024067	2024072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017522	AGG	2	6	2024150	2024155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017522	GTTG	2	8	2025632	2025639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017522	CAG	2	6	2025669	2025674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_017522	CGG	2	6	2025698	2025703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_017522	CT	3	6	2027790	2027795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5513	NC_017522	GTC	2	6	2028253	2028258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_017522	CG	3	6	2028343	2028348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_017522	CCGG	2	8	2028501	2028508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_017522	GTG	2	6	2028518	2028523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017522	GGT	2	6	2028555	2028560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017522	CTG	2	6	2028561	2028566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_017522	TGTGC	2	10	2028581	2028590	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5520	NC_017522	GAG	2	6	2028618	2028623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_017522	CGA	2	6	2028666	2028671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_017522	TCCGA	2	10	2028681	2028690	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5523	NC_017522	TG	3	6	2028770	2028775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017522	GTC	2	6	2028831	2028836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_017522	TGTC	2	8	2028867	2028874	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_017522	CG	3	6	2028930	2028935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5527	NC_017522	CGG	2	6	2028974	2028979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_017522	GCC	2	6	2029027	2029032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_017522	ATGA	2	8	2029066	2029073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_017522	TCG	2	6	2029079	2029084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_017522	GCC	2	6	2029126	2029131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_017522	CAT	2	6	2029134	2029139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_017522	GAG	2	6	2029154	2029159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_017522	GGGT	2	8	2030388	2030395	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_017522	CG	3	6	2030473	2030478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_017522	GCA	2	6	2030559	2030564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_017522	TGG	2	6	2030636	2030641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017522	GGC	2	6	2030669	2030674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_017522	GGAGA	2	10	2031976	2031985	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017522	TGGC	2	8	2032016	2032023	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5541	NC_017522	GCCA	2	8	2032025	2032032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_017522	CGG	2	6	2033593	2033598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_017522	GGTA	2	8	2033627	2033634	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017522	GCA	2	6	2033690	2033695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_017522	GGT	2	6	2034095	2034100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017522	GGT	2	6	2034105	2034110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017522	GTG	2	6	2034111	2034116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017522	CTG	2	6	2034160	2034165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_017522	GGCG	2	8	2034309	2034316	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5550	NC_017522	GAC	2	6	2036154	2036159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_017522	CGC	4	12	2036170	2036181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_017522	CCT	2	6	2036216	2036221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_017522	CAT	2	6	2036295	2036300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_017522	C	6	6	2036348	2036353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5555	NC_017522	AGC	2	6	2036414	2036419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_017522	TTCGGC	2	12	2036433	2036444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_017522	CGGT	2	8	2036911	2036918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5558	NC_017522	GAT	2	6	2037028	2037033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017522	CCCA	2	8	2037062	2037069	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5560	NC_017522	TCGGT	2	10	2037076	2037085	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5561	NC_017522	TG	3	6	2037102	2037107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017522	ACCG	2	8	2037170	2037177	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5563	NC_017522	AAC	2	6	2037185	2037190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_017522	GTC	2	6	2037220	2037225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_017522	CGG	3	9	2038265	2038273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_017522	CCA	2	6	2038993	2038998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_017522	GT	3	6	2039010	2039015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_017522	GCT	2	6	2039743	2039748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_017522	GGT	2	6	2039813	2039818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_017522	GCC	2	6	2039935	2039940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_017522	GTC	2	6	2040042	2040047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_017522	GA	3	6	2040073	2040078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017522	TCG	2	6	2040096	2040101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_017522	AAGC	2	8	2040183	2040190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5575	NC_017522	GCG	2	6	2040213	2040218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_017522	CGA	2	6	2040236	2040241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_017522	CCGC	2	8	2040255	2040262	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5578	NC_017522	GAG	2	6	2040285	2040290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_017522	CGA	2	6	2040313	2040318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_017522	CCGC	2	8	2040332	2040339	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5581	NC_017522	GAG	2	6	2040362	2040367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_017522	CCT	2	6	2041841	2041846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_017522	CGC	2	6	2041849	2041854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_017522	GCGAC	2	10	2041868	2041877	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5585	NC_017522	CGT	2	6	2041890	2041895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_017522	CA	3	6	2045417	2045422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5587	NC_017522	CGGC	3	12	2047306	2047317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_017522	CCG	2	6	2049770	2049775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5589	NC_017522	GC	3	6	2049781	2049786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5590	NC_017522	TCG	2	6	2049788	2049793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_017522	CTC	2	6	2049817	2049822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_017522	CCG	2	6	2049826	2049831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_017522	GC	3	6	2049837	2049842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5594	NC_017522	TCG	2	6	2049844	2049849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_017522	GA	3	6	2051417	2051422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_017522	GC	3	6	2051471	2051476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_017522	GAGAT	2	10	2051812	2051821	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_017522	GTGA	2	8	2051826	2051833	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_017522	CCG	2	6	2051866	2051871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_017522	ACG	2	6	2051911	2051916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_017522	GTC	2	6	2051929	2051934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_017522	GCG	2	6	2051978	2051983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_017522	CCGGG	2	10	2053201	2053210	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5604	NC_017522	AGT	2	6	2053292	2053297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_017522	ATA	2	6	2053305	2053310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_017522	GCCG	2	8	2053332	2053339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_017522	GAG	2	6	2053374	2053379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_017522	TTCG	2	8	2054624	2054631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5609	NC_017522	CGT	2	6	2054676	2054681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_017522	GCG	2	6	2055229	2055234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_017522	GC	3	6	2055240	2055245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5612	NC_017522	CGG	2	6	2055251	2055256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_017522	GAG	2	6	2055260	2055265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_017522	GC	3	6	2055266	2055271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_017522	GCG	2	6	2055285	2055290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_017522	GC	3	6	2055296	2055301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5617	NC_017522	CGG	2	6	2055307	2055312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_017522	GAG	2	6	2055316	2055321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_017522	GC	3	6	2055322	2055327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5620	NC_017522	GCG	2	6	2055341	2055346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_017522	GC	3	6	2055352	2055357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_017522	ATT	2	6	2055375	2055380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_017522	CT	3	6	2055531	2055536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5624	NC_017522	CTC	2	6	2056297	2056302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_017522	TG	3	6	2056312	2056317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_017522	CG	3	6	2056433	2056438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5627	NC_017522	CCG	2	6	2056487	2056492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5628	NC_017522	TC	3	6	2056536	2056541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_017522	AGAGGG	2	12	2056567	2056578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_017522	CAC	2	6	2057415	2057420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5631	NC_017522	TCG	2	6	2059442	2059447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5632	NC_017522	TGGG	2	8	2059484	2059491	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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5762	NC_017522	CGC	2	6	2120425	2120430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5763	NC_017522	CAT	2	6	2121338	2121343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5765	NC_017522	AAG	2	6	2121424	2121429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5766	NC_017522	GACG	2	8	2121443	2121450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5767	NC_017522	GC	4	8	2121475	2121482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5768	NC_017522	GTC	2	6	2121485	2121490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5770	NC_017522	GGCC	2	8	2122787	2122794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5775	NC_017522	CTG	2	6	2122885	2122890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5777	NC_017522	ACCGTG	2	12	2123042	2123053	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5783	NC_017522	AAAG	2	8	2123257	2123264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5784	NC_017522	TGCG	2	8	2123279	2123286	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5786	NC_017522	TCG	2	6	2123471	2123476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5791	NC_017522	GCCG	2	8	2123653	2123660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5792	NC_017522	CAC	2	6	2123695	2123700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5793	NC_017522	CTG	2	6	2123711	2123716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5797	NC_017522	CG	3	6	2123891	2123896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5886	NC_017522	CCGAC	2	10	2153015	2153024	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5887	NC_017522	TGC	2	6	2153067	2153072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5888	NC_017522	CCGT	2	8	2153092	2153099	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5889	NC_017522	GCCG	2	8	2153100	2153107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5892	NC_017522	CTG	2	6	2155369	2155374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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