MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 chromosome

Total Repeats: 12611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017522	CGGA	2	8	1836745	1836752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_017522	CGT	2	6	1836807	1836812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_017522	GGT	2	6	1836820	1836825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017522	TCG	2	6	1836832	1836837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_017522	TTG	2	6	1838341	1838346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017522	GACG	2	8	1838364	1838371	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_017522	TGG	2	6	1841691	1841696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017522	CGAG	2	8	1841698	1841705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5009	NC_017522	CGC	2	6	1841856	1841861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_017522	TCCCAC	2	12	1841899	1841910	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_017522	CGGTC	2	10	1841951	1841960	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5012	NC_017522	GGC	2	6	1841997	1842002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_017522	TCGG	2	8	1842014	1842021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5014	NC_017522	T	7	7	1842046	1842052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017522	GT	3	6	1842066	1842071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017522	CCGG	2	8	1842085	1842092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_017522	CAA	2	6	1842096	1842101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_017522	CAG	2	6	1842119	1842124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_017522	GAGG	2	8	1842130	1842137	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017522	G	7	7	1842205	1842211	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017522	GTG	2	6	1842941	1842946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017522	CGT	2	6	1842972	1842977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_017522	CCG	2	6	1842997	1843002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_017522	CG	3	6	1845372	1845377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_017522	CCG	2	6	1845394	1845399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_017522	CCT	2	6	1845423	1845428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_017522	GTGC	2	8	1845481	1845488	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_017522	TGC	2	6	1845596	1845601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_017522	GCC	2	6	1846579	1846584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_017522	GTC	2	6	1846636	1846641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_017522	CAC	2	6	1846660	1846665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_017522	GC	3	6	1846710	1846715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_017522	CGA	2	6	1846717	1846722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_017522	CCGA	2	8	1848434	1848441	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_017522	TCCGC	2	10	1848509	1848518	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5036	NC_017522	GCGG	2	8	1848525	1848532	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_017522	GAC	2	6	1852153	1852158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_017522	GC	3	6	1852168	1852173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_017522	CGC	2	6	1852187	1852192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_017522	GCG	2	6	1852205	1852210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_017522	GCC	2	6	1855398	1855403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_017522	CGG	2	6	1855404	1855409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_017522	CGG	2	6	1865178	1865183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_017522	C	6	6	1871575	1871580	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5045	NC_017522	CGA	2	6	1885262	1885267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_017522	GAG	2	6	1885289	1885294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017522	CG	3	6	1885296	1885301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_017522	CGA	2	6	1885319	1885324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_017522	GAG	2	6	1885346	1885351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017522	CG	3	6	1885353	1885358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_017522	CGA	2	6	1885376	1885381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_017522	GAG	2	6	1885403	1885408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017522	CG	3	6	1885410	1885415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5054	NC_017522	CGA	2	6	1885433	1885438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_017522	GAG	2	6	1885460	1885465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017522	CG	3	6	1885467	1885472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_017522	GGC	2	6	1885488	1885493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_017522	GCAGT	2	10	1885500	1885509	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5059	NC_017522	GGC	2	6	1885515	1885520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_017522	GGGTG	2	10	1885531	1885540	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017522	GCT	2	6	1885676	1885681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_017522	GGC	2	6	1885685	1885690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_017522	CGT	2	6	1885701	1885706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_017522	CCAG	2	8	1885719	1885726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5065	NC_017522	GACT	2	8	1885737	1885744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_017522	CCA	2	6	1885759	1885764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_017522	GTC	2	6	1885819	1885824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_017522	GCCG	2	8	1885840	1885847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_017522	TGG	2	6	1885877	1885882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017522	CTGA	2	8	1885916	1885923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5071	NC_017522	AGG	2	6	1886006	1886011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017522	CAT	2	6	1888142	1888147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5074	NC_017522	ATTG	2	8	1889857	1889864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017522	GCT	2	6	1889887	1889892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_017522	CGC	2	6	1889900	1889905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_017522	CCGCGG	2	12	1889947	1889958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_017522	GCGCC	2	10	1889976	1889985	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5079	NC_017522	TCC	2	6	1890004	1890009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_017522	ACC	2	6	1890034	1890039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_017522	GC	3	6	1890065	1890070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_017522	CCT	2	6	1890880	1890885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_017522	TGC	2	6	1890910	1890915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_017522	GC	3	6	1890925	1890930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_017522	TGCG	2	8	1890937	1890944	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_017522	TCGA	2	8	1890973	1890980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5087	NC_017522	GGTAT	2	10	1891062	1891071	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017522	ACGCC	2	10	1892200	1892209	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5089	NC_017522	CGA	2	6	1892252	1892257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_017522	GCCG	2	8	1896153	1896160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_017522	TGA	2	6	1896180	1896185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017522	AAC	2	6	1896228	1896233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_017522	CGG	2	6	1896295	1896300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_017522	CGG	2	6	1896345	1896350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_017522	ATG	2	6	1897337	1897342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017522	GAG	3	9	1897391	1897399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017522	GAG	3	9	1897447	1897455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017522	GCT	2	6	1900500	1900505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_017522	CGG	2	6	1900523	1900528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_017522	GCG	2	6	1900590	1900595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_017522	CTG	2	6	1900627	1900632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_017522	CGA	2	6	1900635	1900640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_017522	CGA	2	6	1900653	1900658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_017522	CGCC	2	8	1900668	1900675	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5105	NC_017522	CGG	2	6	1901254	1901259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_017522	TGT	2	6	1901281	1901286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017522	GCC	2	6	1901292	1901297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_017522	TGA	2	6	1902822	1902827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017522	TGGGG	2	10	1904893	1904902	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017522	C	6	6	1904916	1904921	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5111	NC_017522	G	6	6	1904957	1904962	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017522	TGA	2	6	1904972	1904977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017522	CGG	2	6	1905012	1905017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_017522	AAC	2	6	1905032	1905037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_017522	TCA	2	6	1905092	1905097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_017522	GCG	2	6	1905118	1905123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_017522	CCA	2	6	1905246	1905251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_017522	C	6	6	1905277	1905282	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5119	NC_017522	CA	3	6	1905298	1905303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_017522	CTGTG	2	10	1905343	1905352	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5121	NC_017522	TTG	2	6	1905363	1905368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017522	TGT	2	6	1905374	1905379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017522	ACA	2	6	1905407	1905412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_017522	GCA	2	6	1905823	1905828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_017522	CGA	2	6	1905854	1905859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_017522	CGA	2	6	1905882	1905887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_017522	GCC	2	6	1905900	1905905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_017522	CCG	2	6	1905942	1905947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_017522	CGCCGA	2	12	1907721	1907732	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_017522	CGT	2	6	1907770	1907775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_017522	GTT	2	6	1907796	1907801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_017522	GCC	2	6	1907803	1907808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5133	NC_017522	CGG	2	6	1907816	1907821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_017522	GC	3	6	1911397	1911402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5135	NC_017522	C	6	6	1911436	1911441	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5136	NC_017522	GGGT	2	8	1913636	1913643	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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5257	NC_017522	CCTCT	2	10	1958154	1958163	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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5393	NC_017522	GTT	2	6	1993980	1993985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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