MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis MCLD chromosome

Total Repeats: 3766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017519	CCAT	2	8	1506	1513	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017519	ATGTA	2	10	1519	1528	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017519	CAT	2	6	1534	1539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017519	GAA	2	6	1587	1592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017519	TGT	2	6	1617	1622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017519	A	6	6	1834	1839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017519	GTT	2	6	1855	1860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017519	TTA	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017519	CTT	2	6	1891	1896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017519	TCA	2	6	1897	1902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017519	A	6	6	1974	1979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017519	TAA	2	6	2015	2020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017519	TGG	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017519	TA	3	6	2123	2128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017519	ATT	2	6	2141	2146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017519	GGT	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017519	GAAA	2	8	2338	2345	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017519	ATA	2	6	2352	2357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017519	AAG	2	6	4131	4136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017519	CAAAAT	2	12	4149	4160	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017519	TTTA	2	8	4165	4172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017519	T	6	6	4185	4190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017519	TTA	2	6	4221	4226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017519	AGA	2	6	4258	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017519	TTA	2	6	4284	4289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017519	ATTCTA	2	12	4298	4309	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017519	CTG	2	6	4323	4328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017519	TTA	3	9	4456	4464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017519	ACA	2	6	4479	4484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017519	ATT	2	6	4506	4511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017519	A	6	6	4531	4536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017519	TA	4	8	4542	4549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017519	AATTTT	2	12	4555	4566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017519	TAG	2	6	4602	4607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017519	TAT	2	6	4617	4622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017519	T	6	6	4622	4627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017519	TTTA	2	8	4636	4643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017519	A	15	15	4657	4671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017519	AAAT	2	8	4697	4704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017519	TAAA	2	8	4756	4763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017519	A	6	6	4761	4766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017519	TAA	2	6	4775	4780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017519	ATT	2	6	4781	4786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017519	A	7	7	4790	4796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017519	AAT	2	6	4821	4826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017519	T	7	7	4845	4851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017519	AAATTT	2	12	4865	4876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017519	GTG	2	6	4897	4902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017519	ATA	2	6	4905	4910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017519	ATG	2	6	4936	4941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017519	ATT	2	6	4968	4973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017519	TTG	2	6	4978	4983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017519	T	6	6	5001	5006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017519	ATC	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017519	TTC	2	6	5044	5049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017519	A	6	6	5054	5059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017519	A	6	6	5064	5069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017519	ATTTA	2	10	5099	5108	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017519	TC	3	6	5171	5176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017519	TA	3	6	5222	5227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017519	A	6	6	5235	5240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017519	ATG	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017519	GATT	2	8	5357	5364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017519	AAAC	2	8	5375	5382	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017519	ATA	2	6	5434	5439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017519	GAA	2	6	5451	5456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017519	AAATT	2	10	5493	5502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017519	ATAAAA	2	12	5515	5526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017519	AAG	2	6	5536	5541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017519	ATG	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017519	A	6	6	5604	5609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017519	TAA	2	6	5617	5622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017519	TAT	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017519	CAT	2	6	5718	5723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017519	ACA	2	6	5728	5733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017519	TA	3	6	5754	5759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017519	ATTT	2	8	5760	5767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017519	ATAA	2	8	5770	5777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017519	T	7	7	5799	5805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017519	TTA	2	6	6737	6742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017519	TTC	2	6	6765	6770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017519	TTTTA	2	10	6776	6785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017519	GAA	2	6	6835	6840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017519	ATT	2	6	7060	7065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017519	GAA	2	6	7076	7081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017519	AGA	2	6	7087	7092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017519	GAA	2	6	7097	7102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017519	AAAC	2	8	7124	7131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017519	ATA	2	6	7138	7143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017519	TA	3	6	7187	7192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017519	T	8	8	7736	7743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017519	T	7	7	7809	7815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017519	T	6	6	7825	7830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017519	T	6	6	7837	7842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017519	T	6	6	7893	7898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017519	T	6	6	7907	7912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017519	AGAA	2	8	7925	7932	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017519	T	6	6	8799	8804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017519	T	6	6	8825	8830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017519	A	6	6	8831	8836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017519	TAA	2	6	8865	8870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017519	T	7	7	8888	8894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017519	AATTA	2	10	9115	9124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017519	TCA	2	6	9136	9141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017519	A	6	6	9162	9167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017519	CTA	2	6	9205	9210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017519	TAC	2	6	9253	9258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017519	ATT	2	6	9271	9276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017519	T	6	6	9297	9302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017519	TTC	2	6	9344	9349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017519	TCTAA	2	10	9936	9945	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017519	ATT	2	6	9970	9975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017519	TTTAA	2	10	9987	9996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017519	A	7	7	10767	10773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017519	T	8	8	10801	10808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017519	ATT	2	6	10809	10814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017519	A	6	6	10820	10825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017519	T	6	6	13551	13556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017519	TAA	2	6	13560	13565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017519	A	6	6	13614	13619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017519	T	6	6	13623	13628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017519	TAA	2	6	13647	13652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017519	A	6	6	13651	13656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017519	A	7	7	13658	13664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017519	TAA	2	6	13666	13671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017519	A	6	6	13670	13675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017519	A	6	6	13710	13715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017519	AAAT	2	8	15582	15589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017519	TAA	2	6	15619	15624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017519	GT	3	6	15634	15639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017519	T	7	7	15639	15645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017519	A	7	7	15654	15660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017519	TAT	2	6	31555	31560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017519	AAAG	2	8	31582	31589	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017519	TTA	2	6	33479	33484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017519	TCC	2	6	34414	34419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017519	CA	4	8	34429	34436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017519	GAA	2	6	34451	34456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017519	ATT	2	6	34479	34484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017519	A	6	6	34486	34491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017519	AG	3	6	34515	34520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017519	T	6	6	34524	34529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017519	TTA	2	6	35884	35889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017519	TAA	2	6	35910	35915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017519	TAAA	2	8	35922	35929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017519	TGT	3	9	35940	35948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017519	AATT	2	8	37126	37133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017519	TA	3	6	37136	37141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017519	TAT	2	6	38524	38529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017519	AT	3	6	38528	38533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017519	T	8	8	38554	38561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017519	T	8	8	38565	38572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017519	TAAC	2	8	38601	38608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_017519	T	7	7	38617	38623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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