MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium intracellulare MOTT-02 chromosome

Total Repeats: 10106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016947	GC	3	6	1558	1563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016947	CG	3	6	1584	1589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016947	CA	3	6	1633	1638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016947	TCGT	2	8	1683	1690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016947	CGA	2	6	1728	1733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016947	TCG	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016947	TTC	2	6	1826	1831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016947	CGT	2	6	1880	1885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016947	GGA	2	6	1931	1936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016947	GTT	2	6	1943	1948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016947	GTC	3	9	1966	1974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016947	G	6	6	2019	2024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016947	TGAAGG	2	12	2053	2064	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016947	GCC	2	6	5002	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016947	TGA	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016947	CCGC	2	8	5210	5217	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_016947	GACC	2	8	7311	7318	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016947	CGCGG	2	10	11150	11159	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_016947	GAG	2	6	11163	11168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016947	TGC	2	6	12156	12161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016947	GGC	2	6	12176	12181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016947	TCG	2	6	12195	12200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016947	TCC	2	6	12280	12285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_016947	ACG	2	6	12376	12381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016947	ACC	2	6	12424	12429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_016947	GCA	2	6	13147	13152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016947	TCG	2	6	14882	14887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016947	G	6	6	14918	14923	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016947	GCC	2	6	14954	14959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016947	GC	3	6	14995	15000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016947	GGCC	2	8	15003	15010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016947	CGG	2	6	15043	15048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016947	TCG	2	6	15072	15077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016947	GC	3	6	15107	15112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016947	CCCG	2	8	15675	15682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_016947	CG	3	6	15681	15686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016947	ACA	2	6	15971	15976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016947	C	6	6	15982	15987	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_016947	CGCC	2	8	15995	16002	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_016947	CGG	2	6	16014	16019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016947	CAA	2	6	16050	16055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016947	TGC	2	6	16111	16116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016947	CAC	2	6	16137	16142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_016947	GGT	2	6	16204	16209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016947	ATTC	2	8	16251	16258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016947	GTCG	2	8	16260	16267	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016947	TGC	2	6	16268	16273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016947	CGC	2	6	17429	17434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_016947	GC	3	6	17445	17450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016947	AGG	2	6	24125	24130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016947	CGG	2	6	24143	24148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016947	CTC	2	6	25677	25682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_016947	CCGG	2	8	25687	25694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016947	CAT	2	6	25712	25717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016947	CGT	2	6	26222	26227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016947	GGT	2	6	26280	26285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016947	GCG	2	6	28111	28116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016947	AGGGC	2	10	28117	28126	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016947	GCG	2	6	28150	28155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016947	GTT	2	6	28194	28199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016947	TAC	2	6	28298	28303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016947	A	6	6	28368	28373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016947	CGG	2	6	28831	28836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016947	GGCC	2	8	29230	29237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016947	GT	3	6	29258	29263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016947	GGC	2	6	29713	29718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016947	CAT	2	6	29772	29777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016947	TGG	2	6	29800	29805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016947	CG	3	6	29822	29827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016947	TCG	2	6	29858	29863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016947	GGC	2	6	29897	29902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016947	CCT	2	6	29995	30000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016947	AGCT	2	8	32627	32634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016947	AGGG	2	8	32636	32643	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016947	GC	3	6	32651	32656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016947	TGC	2	6	32684	32689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016947	GCG	2	6	32690	32695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016947	TCC	2	6	34593	34598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_016947	CTT	2	6	34609	34614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016947	CGA	2	6	34647	34652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016947	TCA	2	6	34701	34706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016947	CTA	2	6	34755	34760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016947	ACG	2	6	34824	34829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016947	CGT	2	6	34837	34842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016947	CGTGG	2	10	34858	34867	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016947	AGC	2	6	34893	34898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016947	GAA	2	6	34931	34936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016947	CGC	2	6	34980	34985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016947	TG	3	6	35010	35015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016947	GAT	2	6	35079	35084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016947	CCGG	2	8	35106	35113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016947	TCC	2	6	36463	36468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_016947	GC	3	6	37903	37908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016947	CAA	2	6	37962	37967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016947	ACG	2	6	40192	40197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016947	TGC	2	6	40595	40600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016947	CGCC	2	8	40622	40629	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_016947	ACT	2	6	40630	40635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016947	CGG	2	6	42187	42192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016947	CGG	2	6	42595	42600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016947	CGA	2	6	44881	44886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016947	CG	3	6	45234	45239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016947	C	7	7	45255	45261	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_016947	GTC	2	6	45277	45282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016947	TC	3	6	45281	45286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016947	CTG	2	6	45302	45307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016947	CGG	2	6	45345	45350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016947	CG	3	6	45465	45470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016947	GCCG	2	8	46260	46267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016947	CGG	2	6	46268	46273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016947	CGT	2	6	46286	46291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016947	CAA	2	6	47651	47656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016947	CGA	2	6	47698	47703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016947	GAT	2	6	47716	47721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016947	GCC	2	6	48717	48722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016947	GCC	2	6	48749	48754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_016947	GC	3	6	50051	50056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016947	CAG	2	6	53755	53760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016947	CGG	3	9	56917	56925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016947	CG	4	8	57753	57760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016947	CGG	2	6	57795	57800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016947	ACG	2	6	59822	59827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016947	GTC	2	6	60878	60883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016947	CGT	2	6	60896	60901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016947	CGC	2	6	60920	60925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_016947	TCGGC	2	10	60954	60963	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_016947	CGT	2	6	60977	60982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016947	CGT	2	6	60991	60996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016947	CGGC	2	8	61012	61019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016947	GTC	2	6	61052	61057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016947	CAG	2	6	61076	61081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016947	CAC	2	6	61136	61141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_016947	GCA	2	6	61213	61218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016947	GAC	2	6	61233	61238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016947	CGA	2	6	61282	61287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016947	TCG	2	6	61353	61358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016947	GCC	2	6	61375	61380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016947	GGTC	2	8	61405	61412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016947	GA	3	6	66668	66673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016947	GTT	2	6	66792	66797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016947	GCG	2	6	66808	66813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016947	CGC	2	6	66817	66822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_016947	AAC	2	6	66823	66828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016947	AAG	2	6	66845	66850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_016947	G	6	6	68697	68702	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_016947	ATCCT	2	10	118638	118647	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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285	NC_016947	CAAC	2	8	121889	121896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
286	NC_016947	CAA	2	6	121908	121913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_016947	GTG	2	6	121948	121953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
288	NC_016947	TTAG	2	8	122888	122895	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
289	NC_016947	TCGAC	2	10	122908	122917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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291	NC_016947	GGT	2	6	122942	122947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_016947	GCCCG	2	10	123436	123445	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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295	NC_016947	TCG	2	6	123645	123650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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297	NC_016947	ATG	2	6	126151	126156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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300	NC_016947	GC	3	6	127299	127304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
301	NC_016947	CGG	2	6	127312	127317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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423	NC_016947	CCG	2	6	186797	186802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
424	NC_016947	TTC	2	6	187449	187454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_016947	GCG	2	6	187490	187495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_016947	GC	4	8	187524	187531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
427	NC_016947	C	6	6	187754	187759	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
428	NC_016947	GTGA	2	8	187773	187780	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
429	NC_016947	GCG	2	6	187823	187828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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432	NC_016947	CGGGA	2	10	187896	187905	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
433	NC_016947	GCG	2	6	187912	187917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_016947	GCC	2	6	188401	188406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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445	NC_016947	CGC	2	6	188481	188486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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447	NC_016947	CGG	2	6	191289	191294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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449	NC_016947	GCG	2	6	192170	192175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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451	NC_016947	CGC	2	6	194065	194070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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457	NC_016947	CGC	2	6	199060	199065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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460	NC_016947	CCT	2	6	199796	199801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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466	NC_016947	GT	3	6	208352	208357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
467	NC_016947	GAC	2	6	208376	208381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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485	NC_016947	AGCGA	2	10	211089	211098	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
486	NC_016947	GAG	3	9	211100	211108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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