MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 8338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016804	GAA	2	6	908800	908805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016804	CAC	2	6	908809	908814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_016804	GCGGCC	2	12	908829	908840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_016804	CGG	2	6	910126	910131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_016804	GCT	2	6	910158	910163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_016804	TGC	2	6	910169	910174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_016804	CAG	2	6	910194	910199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_016804	ACAGCA	2	12	910202	910213	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_016804	GGC	2	6	910225	910230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_016804	GGC	2	6	911586	911591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_016804	ACG	2	6	911657	911662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_016804	C	7	7	913396	913402	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1513	NC_016804	AAG	2	6	913403	913408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016804	CTC	2	6	913953	913958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_016804	AGC	2	6	914009	914014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_016804	CATCGT	2	12	914022	914033	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_016804	GCA	2	6	914046	914051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_016804	GTGA	2	8	914062	914069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016804	TTC	2	6	914080	914085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_016804	GGC	2	6	914111	914116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_016804	TCT	2	6	914144	914149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_016804	CGT	2	6	914941	914946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_016804	GCA	2	6	917085	917090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_016804	GCA	2	6	917116	917121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_016804	GC	3	6	918353	918358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_016804	TCG	2	6	918365	918370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_016804	CCT	2	6	918393	918398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_016804	GC	3	6	918411	918416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_016804	TCG	2	6	918423	918428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_016804	AT	3	6	919488	919493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016804	CG	3	6	919526	919531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_016804	CAG	2	6	919546	919551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_016804	CGG	2	6	919570	919575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_016804	GTC	2	6	919605	919610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_016804	CAG	2	6	920316	920321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_016804	ACC	2	6	920327	920332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_016804	GCG	2	6	921400	921405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_016804	GTG	2	6	921856	921861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016804	TCAC	2	8	922576	922583	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_016804	GTA	2	6	922614	922619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016804	AGCA	2	8	924414	924421	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_016804	TTGCT	2	10	924430	924439	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1543	NC_016804	GGGA	2	8	924461	924468	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016804	CCA	2	6	924508	924513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_016804	CAC	2	6	924663	924668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_016804	GA	3	6	924684	924689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_016804	CGC	2	6	924725	924730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_016804	CA	3	6	924795	924800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_016804	GC	3	6	924832	924837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_016804	CGG	2	6	924848	924853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_016804	TGC	2	6	924902	924907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_016804	CGG	2	6	924961	924966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_016804	CCA	2	6	924984	924989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_016804	GGC	2	6	925013	925018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_016804	CTGGGT	2	12	925040	925051	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1556	NC_016804	GAT	2	6	925130	925135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_016804	GCCG	2	8	925143	925150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_016804	CGG	2	6	925183	925188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_016804	CTC	2	6	925198	925203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_016804	ACC	2	6	925290	925295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_016804	GGT	2	6	925304	925309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016804	AGA	2	6	925400	925405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016804	CCAT	2	8	925441	925448	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_016804	CG	3	6	925472	925477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_016804	TGGCG	2	10	925494	925503	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1566	NC_016804	GCC	2	6	925508	925513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_016804	GGC	2	6	925545	925550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_016804	CTG	2	6	925572	925577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_016804	TCC	2	6	925580	925585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_016804	GAG	2	6	925638	925643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_016804	CGA	2	6	928407	928412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_016804	CGG	2	6	928446	928451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_016804	CGC	2	6	928467	928472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_016804	ACT	2	6	928504	928509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_016804	GCC	2	6	931365	931370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_016804	CGG	2	6	931388	931393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_016804	GGGC	2	8	931400	931407	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_016804	CGC	2	6	931473	931478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_016804	GCG	2	6	931491	931496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_016804	GCA	2	6	931532	931537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_016804	GGC	2	6	931559	931564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_016804	CGG	2	6	931573	931578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_016804	GC	4	8	931697	931704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_016804	AGC	3	9	932388	932396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_016804	GGC	2	6	932397	932402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_016804	ACG	2	6	932436	932441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_016804	GAA	3	9	932453	932461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_016804	CTG	2	6	932488	932493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_016804	AGC	2	6	932547	932552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_016804	AAC	2	6	932634	932639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_016804	ACG	2	6	932706	932711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_016804	GTT	2	6	932752	932757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_016804	TCT	2	6	932776	932781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_016804	GCC	2	6	932788	932793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_016804	CTTA	2	8	932819	932826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1596	NC_016804	GCC	2	6	932836	932841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_016804	CAGTCG	2	12	932851	932862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_016804	TGC	3	9	932871	932879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_016804	GGC	2	6	932891	932896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_016804	ACC	2	6	932914	932919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_016804	ACG	2	6	933722	933727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_016804	AGG	2	6	933764	933769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016804	CACT	2	8	934908	934915	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_016804	CCT	2	6	934917	934922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_016804	TGA	2	6	934962	934967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016804	GCA	2	6	934974	934979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_016804	CCT	2	6	934992	934997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_016804	GGT	2	6	935032	935037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016804	ACG	2	6	935122	935127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_016804	CAA	2	6	935132	935137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_016804	TGG	2	6	935142	935147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016804	CGG	2	6	935166	935171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_016804	CCG	2	6	935209	935214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_016804	GCG	2	6	935283	935288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_016804	CGA	2	6	935296	935301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_016804	GCC	2	6	935311	935316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_016804	CAG	2	6	935330	935335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_016804	CAA	2	6	935470	935475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_016804	AAAT	2	8	936290	936297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016804	CG	3	6	937186	937191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_016804	CG	3	6	937197	937202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_016804	GTTG	2	8	937203	937210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016804	CGA	2	6	937212	937217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_016804	TCGCC	2	10	938176	938185	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1625	NC_016804	CGG	2	6	938271	938276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_016804	CTG	2	6	938286	938291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_016804	GCCG	2	8	938292	938299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_016804	AGC	2	6	938676	938681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_016804	GCA	2	6	938753	938758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_016804	TCC	2	6	938775	938780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_016804	GGA	2	6	938821	938826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016804	GCG	2	6	938870	938875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_016804	CGGT	2	8	941208	941215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1767	NC_016804	GGGT	2	8	1015300	1015307	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1768	NC_016804	CAGC	2	8	1015316	1015323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1769	NC_016804	ACCGC	2	10	1015367	1015376	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1770	NC_016804	CGGT	2	8	1016097	1016104	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1780	NC_016804	GTT	2	6	1017862	1017867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1782	NC_016804	TGC	2	6	1017943	1017948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1785	NC_016804	CGA	2	6	1020791	1020796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1796	NC_016804	CGGC	2	8	1024815	1024822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1797	NC_016804	CCACG	2	10	1024825	1024834	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1798	NC_016804	CG	3	6	1024855	1024860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1799	NC_016804	GC	3	6	1024861	1024866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1803	NC_016804	CGC	2	6	1026186	1026191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1805	NC_016804	TTTC	2	8	1026241	1026248	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1891	NC_016804	TCGTC	2	10	1074770	1074779	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1893	NC_016804	CGGGC	2	10	1075906	1075915	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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