MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 8338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016804	TCC	2	6	294005	294010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_016804	CCA	2	6	294067	294072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_016804	AT	3	6	294087	294092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016804	AACT	2	8	294137	294144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_016804	AACC	2	8	294145	294152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_016804	GCG	2	6	294196	294201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_016804	GGC	2	6	294235	294240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_016804	ATC	2	6	294258	294263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_016804	GC	3	6	294298	294303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_016804	ACA	2	6	294892	294897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016804	ATG	2	6	294930	294935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016804	AGT	2	6	294959	294964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016804	GC	3	6	295011	295016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_016804	GAT	2	6	295036	295041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016804	GCC	2	6	295056	295061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_016804	CCG	2	6	295104	295109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_016804	ATGC	2	8	295135	295142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
518	NC_016804	G	6	6	300085	300090	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016804	GACG	2	8	300453	300460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
520	NC_016804	CGG	2	6	300496	300501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_016804	CGGCC	2	10	300508	300517	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
522	NC_016804	CA	3	6	301141	301146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_016804	GGA	2	6	303799	303804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016804	AGG	2	6	303808	303813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016804	GGC	2	6	304732	304737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_016804	CGG	2	6	307913	307918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_016804	CCG	2	6	307923	307928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_016804	GTC	2	6	307937	307942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_016804	AGC	2	6	307951	307956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_016804	CAG	2	6	307969	307974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_016804	GTG	3	9	307976	307984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016804	TTGC	2	8	308093	308100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
533	NC_016804	GAA	2	6	308207	308212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016804	GGTC	2	8	308265	308272	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
535	NC_016804	TGC	2	6	311071	311076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_016804	TTG	2	6	312580	312585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016804	GGC	2	6	312652	312657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_016804	AGCGG	2	10	312663	312672	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
539	NC_016804	GCT	2	6	314133	314138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_016804	TCC	2	6	314139	314144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_016804	TCGGC	2	10	314826	314835	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
542	NC_016804	CG	4	8	315882	315889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_016804	GC	3	6	319607	319612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_016804	CGG	3	9	321094	321102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_016804	CG	3	6	324620	324625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_016804	AAC	2	6	326877	326882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_016804	TTA	2	6	326894	326899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016804	AGATTC	2	12	328728	328739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
549	NC_016804	GCC	2	6	328753	328758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_016804	ATC	2	6	330028	330033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_016804	CAT	2	6	331808	331813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_016804	CGC	2	6	331840	331845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_016804	AAG	2	6	334694	334699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016804	G	6	6	334725	334730	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016804	GGTA	2	8	334744	334751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016804	GCCG	2	8	334831	334838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_016804	TGGC	2	8	334843	334850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
558	NC_016804	CGG	2	6	334851	334856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_016804	AAG	2	6	337653	337658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016804	ACA	2	6	337675	337680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_016804	G	6	6	337684	337689	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016804	GT	3	6	337736	337741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016804	GCCG	2	8	337781	337788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_016804	TGGC	2	8	337793	337800	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
565	NC_016804	CGG	2	6	340400	340405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_016804	GCA	2	6	340499	340504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_016804	GCG	2	6	340555	340560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_016804	GTG	2	6	340565	340570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016804	TCA	2	6	340597	340602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_016804	GTG	2	6	340610	340615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016804	GGTCGC	2	12	343323	343334	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_016804	GA	3	6	352777	352782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016804	CTG	2	6	353088	353093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_016804	GAT	2	6	362502	362507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016804	GCG	2	6	364520	364525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_016804	TAG	2	6	364543	364548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016804	ATC	2	6	365122	365127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_016804	G	7	7	365807	365813	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016804	CTGT	2	8	365825	365832	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_016804	TTG	2	6	370975	370980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016804	TTG	2	6	371005	371010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016804	TGT	2	6	371033	371038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016804	AATC	2	8	377019	377026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_016804	CTA	2	6	377029	377034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_016804	TCG	2	6	377145	377150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_016804	CTTGA	2	10	379151	379160	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
587	NC_016804	CGT	2	6	379895	379900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_016804	ACC	2	6	381708	381713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_016804	CGC	2	6	381764	381769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_016804	GTA	2	6	383719	383724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016804	GAG	2	6	383740	383745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016804	CGG	2	6	384823	384828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_016804	CAC	2	6	384829	384834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_016804	TCA	2	6	387225	387230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_016804	GCC	2	6	387252	387257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_016804	GCA	2	6	387277	387282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_016804	CGA	2	6	387364	387369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_016804	GGCC	2	8	387379	387386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_016804	GCC	2	6	387411	387416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_016804	AAGG	2	8	388395	388402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016804	CGG	2	6	389089	389094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_016804	TCT	2	6	389095	389100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_016804	TTC	2	6	389117	389122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_016804	GCG	2	6	389820	389825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_016804	TCG	2	6	389836	389841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_016804	AC	3	6	390509	390514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_016804	GGA	2	6	392526	392531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016804	GC	3	6	392537	392542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_016804	GCC	2	6	392552	392557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_016804	GGC	2	6	395307	395312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_016804	GAC	2	6	396585	396590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_016804	ATA	2	6	397355	397360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016804	TGAC	2	8	397364	397371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_016804	GTCA	2	8	397375	397382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
615	NC_016804	GCG	2	6	397405	397410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_016804	AT	3	6	397429	397434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016804	CGG	2	6	400789	400794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_016804	CGG	2	6	401331	401336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_016804	GTA	2	6	401415	401420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016804	TTG	2	6	402998	403003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016804	GTT	2	6	403011	403016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016804	GCG	2	6	403052	403057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_016804	CGC	3	9	403067	403075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_016804	CGC	2	6	407177	407182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_016804	CGG	3	9	409717	409725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_016804	CGG	2	6	409805	409810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_016804	AGG	2	6	409883	409888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_016804	CGG	2	6	410482	410487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_016804	CTT	2	6	410598	410603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_016804	GTG	2	6	415524	415529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016804	TGG	2	6	415538	415543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016804	CAACG	2	10	415547	415556	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
633	NC_016804	CG	3	6	416243	416248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_016804	GCG	2	6	416724	416729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_016804	TGG	2	6	418241	418246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016804	CTT	2	6	418247	418252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_016804	CG	3	6	418257	418262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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