MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 8338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_016804	ACA	2	6	3720644	3720649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_016804	CAA	2	6	3720682	3720687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_016804	TG	3	6	3721200	3721205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_016804	GC	3	6	3721997	3722002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7005	NC_016804	CCG	2	6	3722020	3722025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7006	NC_016804	CGC	3	9	3722026	3722034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7007	NC_016804	TGC	2	6	3722043	3722048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_016804	CGA	2	6	3722077	3722082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_016804	CAA	2	6	3722217	3722222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_016804	CGCAGC	2	12	3722319	3722330	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7011	NC_016804	TGC	2	6	3722332	3722337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_016804	AGT	2	6	3722389	3722394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_016804	ATG	2	6	3722433	3722438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_016804	ACC	2	6	3722502	3722507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7015	NC_016804	ACG	2	6	3722513	3722518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_016804	CGC	3	9	3722523	3722531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7017	NC_016804	ACC	2	6	3722557	3722562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7018	NC_016804	GCG	2	6	3722577	3722582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_016804	AAC	2	6	3722617	3722622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_016804	TCCT	2	8	3722653	3722660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7021	NC_016804	CGT	2	6	3722809	3722814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_016804	CCG	2	6	3722834	3722839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7023	NC_016804	CA	3	6	3722840	3722845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7024	NC_016804	ACC	2	6	3722853	3722858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7025	NC_016804	GAC	2	6	3722942	3722947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_016804	ACA	2	6	3722958	3722963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_016804	GC	3	6	3722968	3722973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7028	NC_016804	AGC	2	6	3723063	3723068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_016804	CCG	2	6	3723129	3723134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7030	NC_016804	GAA	2	6	3723149	3723154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_016804	CGA	2	6	3723158	3723163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_016804	CCG	2	6	3723198	3723203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7033	NC_016804	GTG	2	6	3723237	3723242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_016804	CGGG	2	8	3723295	3723302	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7035	NC_016804	GCC	2	6	3723350	3723355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7036	NC_016804	CGC	2	6	3723505	3723510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7037	NC_016804	GAA	2	6	3723536	3723541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_016804	CGGG	2	8	3723616	3723623	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7039	NC_016804	CGG	2	6	3723667	3723672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_016804	ATGG	2	8	3723690	3723697	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_016804	ACCG	2	8	3723734	3723741	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7042	NC_016804	GCA	2	6	3723781	3723786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_016804	CGC	2	6	3723805	3723810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7044	NC_016804	CGC	2	6	3723883	3723888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7045	NC_016804	AGCC	2	8	3723984	3723991	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7046	NC_016804	TGC	2	6	3724000	3724005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_016804	TGC	2	6	3724114	3724119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_016804	AAC	2	6	3724164	3724169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_016804	GAA	2	6	3724193	3724198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_016804	AAC	2	6	3724224	3724229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_016804	GCC	2	6	3724256	3724261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7052	NC_016804	TGCCGG	2	12	3724303	3724314	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_016804	GCCCAC	2	12	3724334	3724345	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7054	NC_016804	GTT	2	6	3724361	3724366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_016804	GCC	2	6	3724367	3724372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7056	NC_016804	GC	3	6	3724507	3724512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7057	NC_016804	CCG	2	6	3724623	3724628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7058	NC_016804	AGC	2	6	3724632	3724637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_016804	TGG	2	6	3724647	3724652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_016804	GCCC	2	8	3724784	3724791	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7061	NC_016804	CCA	2	6	3724817	3724822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7062	NC_016804	CCCG	2	8	3724862	3724869	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7063	NC_016804	GAA	2	6	3724880	3724885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_016804	CGA	2	6	3724889	3724894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_016804	TGC	2	6	3724951	3724956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_016804	CGC	2	6	3724988	3724993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7067	NC_016804	CGC	2	6	3725026	3725031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7068	NC_016804	CGG	2	6	3725038	3725043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_016804	CAG	2	6	3725057	3725062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_016804	ACC	2	6	3725084	3725089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7071	NC_016804	GAAT	2	8	3725273	3725280	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_016804	ATT	2	6	3725364	3725369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_016804	CGG	2	6	3725390	3725395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_016804	GGC	2	6	3725426	3725431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_016804	CGGC	2	8	3725524	3725531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7076	NC_016804	GGA	2	6	3725545	3725550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_016804	GCC	2	6	3725564	3725569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7078	NC_016804	C	6	6	3725777	3725782	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7079	NC_016804	TGC	2	6	3725875	3725880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_016804	GAA	2	6	3725954	3725959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7083	NC_016804	TGCCGG	2	12	3726064	3726075	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7084	NC_016804	GGCC	2	8	3726160	3726167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7085	NC_016804	CGG	2	6	3726172	3726177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7087	NC_016804	GC	3	6	3726559	3726564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7088	NC_016804	CGC	2	6	3726566	3726571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7089	NC_016804	CCA	2	6	3726578	3726583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7090	NC_016804	GAA	2	6	3726640	3726645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_016804	CGA	2	6	3726649	3726654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_016804	GTG	2	6	3726665	3726670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_016804	CGG	2	6	3726688	3726693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_016804	GAT	2	6	3726700	3726705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7097	NC_016804	ACCC	2	8	3726771	3726778	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7098	NC_016804	GC	3	6	3726801	3726806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7099	NC_016804	ATCG	2	8	3726814	3726821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7100	NC_016804	ACC	2	6	3726883	3726888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7101	NC_016804	TGGG	2	8	3727010	3727017	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_016804	CGC	2	6	3727048	3727053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7103	NC_016804	TGA	2	6	3727095	3727100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7105	NC_016804	CGA	2	6	3727275	3727280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7107	NC_016804	TGC	2	6	3727374	3727379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_016804	GTT	2	6	3727444	3727449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_016804	CGC	2	6	3727557	3727562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7110	NC_016804	AAC	2	6	3727646	3727651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_016804	TCCCGG	2	12	3727719	3727730	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7112	NC_016804	GAA	2	6	3727735	3727740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_016804	AAC	2	6	3727766	3727771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_016804	GCC	2	6	3727798	3727803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7115	NC_016804	CCCGAT	2	12	3727831	3727842	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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7117	NC_016804	GCTGCC	2	12	3727903	3727914	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7118	NC_016804	C	6	6	3727943	3727948	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7119	NC_016804	TGC	2	6	3728046	3728051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7120	NC_016804	CCG	2	6	3728141	3728146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7121	NC_016804	TGC	2	6	3728183	3728188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_016804	GAT	2	6	3728209	3728214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_016804	CCG	2	6	3728319	3728324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7124	NC_016804	GTG	2	6	3728327	3728332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_016804	CCA	2	6	3728433	3728438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7126	NC_016804	CCG	3	9	3728504	3728512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7128	NC_016804	CGA	2	6	3728533	3728538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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