MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 8338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016804	GCA	2	6	2411438	2411443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_016804	CA	3	6	2411491	2411496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_016804	CG	3	6	2411514	2411519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4504	NC_016804	ACC	2	6	2411543	2411548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_016804	CCCGG	2	10	2411555	2411564	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4506	NC_016804	GCC	2	6	2411572	2411577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_016804	GTC	2	6	2411635	2411640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_016804	GCC	2	6	2411672	2411677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4509	NC_016804	GC	3	6	2411682	2411687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4510	NC_016804	CAAC	2	8	2414661	2414668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_016804	CGA	2	6	2414691	2414696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_016804	CGA	2	6	2415417	2415422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_016804	CGA	2	6	2419228	2419233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_016804	GGAA	2	8	2419253	2419260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_016804	CGA	2	6	2419285	2419290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_016804	GGAA	2	8	2419310	2419317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_016804	CGA	2	6	2419342	2419347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_016804	GGAA	2	8	2419367	2419374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_016804	CGA	2	6	2419399	2419404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_016804	GGAA	2	8	2419424	2419431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_016804	CGA	2	6	2419456	2419461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_016804	GGAA	2	8	2419481	2419488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_016804	CG	3	6	2421118	2421123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_016804	TTC	2	6	2421133	2421138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_016804	CCT	2	6	2422769	2422774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_016804	GCG	2	6	2422811	2422816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_016804	TAC	2	6	2422845	2422850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_016804	CGC	2	6	2422864	2422869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_016804	CG	3	6	2422871	2422876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_016804	CGA	2	6	2422879	2422884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_016804	GAG	2	6	2422906	2422911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_016804	GTC	2	6	2422943	2422948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_016804	CCG	2	6	2422954	2422959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_016804	CGG	2	6	2424997	2425002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_016804	CGG	2	6	2425032	2425037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_016804	GCCC	2	8	2426095	2426102	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4537	NC_016804	GCCT	2	8	2426138	2426145	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_016804	TGC	2	6	2426168	2426173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_016804	AGC	2	6	2426203	2426208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_016804	CCA	2	6	2426218	2426223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_016804	TGGG	2	8	2427321	2427328	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_016804	TCA	2	6	2428538	2428543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_016804	ACGC	2	8	2428583	2428590	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_016804	CGC	2	6	2428608	2428613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4545	NC_016804	GCGG	2	8	2429386	2429393	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4546	NC_016804	ACCGA	2	10	2429394	2429403	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4547	NC_016804	GGC	2	6	2431254	2431259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_016804	CCG	2	6	2431287	2431292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_016804	CG	3	6	2431382	2431387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_016804	AT	3	6	2431390	2431395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_016804	CGT	2	6	2431398	2431403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_016804	CCA	2	6	2434036	2434041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_016804	GTG	2	6	2434043	2434048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_016804	GGT	2	6	2436336	2436341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_016804	CCG	2	6	2439790	2439795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_016804	GCC	2	6	2439810	2439815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_016804	CCA	2	6	2439820	2439825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_016804	CGC	2	6	2439829	2439834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4559	NC_016804	TG	3	6	2439843	2439848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_016804	CCGA	2	8	2439942	2439949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4561	NC_016804	CGAT	2	8	2439950	2439957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4562	NC_016804	GAG	2	6	2439959	2439964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_016804	GGC	2	6	2442570	2442575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_016804	GTG	2	6	2445522	2445527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_016804	GGC	2	6	2445528	2445533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_016804	TGAC	2	8	2445564	2445571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4567	NC_016804	GCG	2	6	2447090	2447095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_016804	GGGC	2	8	2447107	2447114	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_016804	GC	3	6	2447152	2447157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4570	NC_016804	ACC	2	6	2447160	2447165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_016804	ATC	2	6	2447231	2447236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_016804	CCG	2	6	2447243	2447248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_016804	CGT	2	6	2447286	2447291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_016804	GTC	2	6	2447303	2447308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_016804	TCG	2	6	2447338	2447343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_016804	GCGG	2	8	2447345	2447352	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_016804	GCGTCG	2	12	2450379	2450390	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_016804	CTGT	2	8	2451769	2451776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4579	NC_016804	GGC	2	6	2451816	2451821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_016804	TTC	2	6	2453458	2453463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_016804	TGC	2	6	2455035	2455040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_016804	CAG	2	6	2455099	2455104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_016804	TCG	2	6	2455128	2455133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_016804	CGG	2	6	2455213	2455218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_016804	CGAT	2	8	2455430	2455437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4586	NC_016804	CTG	2	6	2455460	2455465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_016804	CATG	2	8	2455557	2455564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4588	NC_016804	GAA	2	6	2455665	2455670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_016804	CGA	2	6	2455690	2455695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_016804	CGACC	2	10	2455725	2455734	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4591	NC_016804	ATGC	2	8	2456782	2456789	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_016804	ACCA	2	8	2456799	2456806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_016804	CAT	2	6	2456821	2456826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_016804	CGC	2	6	2458430	2458435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_016804	CGG	2	6	2458450	2458455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_016804	CGG	2	6	2458458	2458463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_016804	CCAT	2	8	2458467	2458474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_016804	AC	3	6	2458479	2458484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4599	NC_016804	CTT	2	6	2458569	2458574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_016804	CCA	2	6	2458657	2458662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4601	NC_016804	CTCGA	2	10	2458755	2458764	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4602	NC_016804	CA	3	6	2458783	2458788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_016804	GCC	2	6	2458807	2458812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_016804	CGA	2	6	2458828	2458833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_016804	GAC	2	6	2458878	2458883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_016804	CGG	2	6	2458906	2458911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_016804	CGG	2	6	2463768	2463773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_016804	TGA	2	6	2463774	2463779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_016804	AGC	2	6	2463791	2463796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_016804	GT	3	6	2463864	2463869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_016804	GCG	2	6	2463886	2463891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_016804	GCG	2	6	2463902	2463907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_016804	GCG	2	6	2463943	2463948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_016804	GGC	2	6	2463992	2463997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_016804	CGT	2	6	2464115	2464120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_016804	TCG	2	6	2464141	2464146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_016804	CCG	2	6	2464179	2464184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4618	NC_016804	CGC	2	6	2464226	2464231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4619	NC_016804	CCG	2	6	2464254	2464259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_016804	GCA	2	6	2464270	2464275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_016804	CGG	2	6	2467491	2467496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_016804	CGG	2	6	2468304	2468309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_016804	GT	3	6	2468311	2468316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_016804	GCC	2	6	2468349	2468354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_016804	AGC	2	6	2468404	2468409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_016804	GC	3	6	2468422	2468427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4627	NC_016804	CGG	2	6	2468496	2468501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_016804	CTGT	2	8	2468504	2468511	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4629	NC_016804	CGCGC	2	10	2468512	2468521	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4630	NC_016804	CACGAC	2	12	2468550	2468561	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4631	NC_016804	CCG	2	6	2468580	2468585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4632	NC_016804	CCG	2	6	2468628	2468633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4633	NC_016804	GT	3	6	2468641	2468646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_016804	CCG	2	6	2468684	2468689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4635	NC_016804	TCG	2	6	2469665	2469670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4637	NC_016804	CCGA	2	8	2470520	2470527	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4644	NC_016804	CTC	2	6	2480191	2480196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4647	NC_016804	GCCG	2	8	2481130	2481137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4648	NC_016804	GGT	2	6	2485847	2485852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4653	NC_016804	CTG	2	6	2487847	2487852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4655	NC_016804	TCGCT	2	10	2489841	2489850	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4656	NC_016804	TCGCT	2	10	2489894	2489903	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4657	NC_016804	TCGCT	2	10	2489947	2489956	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4659	NC_016804	TCGCT	2	10	2490000	2490009	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4661	NC_016804	GC	4	8	2491793	2491800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4662	NC_016804	GCG	2	6	2491816	2491821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4663	NC_016804	CG	3	6	2491839	2491844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4664	NC_016804	CGG	2	6	2496187	2496192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4665	NC_016804	TCG	2	6	2496194	2496199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4709	NC_016804	GACG	2	8	2521597	2521604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4726	NC_016804	CAAGA	2	10	2530251	2530260	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4744	NC_016804	ACG	2	6	2535254	2535259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4746	NC_016804	ATC	2	6	2535309	2535314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4747	NC_016804	CCG	2	6	2535335	2535340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4748	NC_016804	GT	3	6	2535364	2535369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4749	NC_016804	GGC	2	6	2535431	2535436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4750	NC_016804	GTA	2	6	2535478	2535483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4752	NC_016804	CAA	2	6	2535561	2535566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4753	NC_016804	ATC	2	6	2535610	2535615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4754	NC_016804	GTTG	2	8	2536415	2536422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4755	NC_016804	GCGG	2	8	2536428	2536435	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4756	NC_016804	ATG	2	6	2536712	2536717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4757	NC_016804	GTA	2	6	2536728	2536733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4758	NC_016804	CTGG	2	8	2536754	2536761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4890	NC_016804	CGG	2	6	2596363	2596368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4891	NC_016804	CGG	2	6	2596372	2596377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4892	NC_016804	GAC	2	6	2596415	2596420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4895	NC_016804	CGG	2	6	2599533	2599538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4898	NC_016804	CGTT	2	8	2600516	2600523	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4998	NC_016804	GCCA	2	8	2663440	2663447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4999	NC_016804	AGC	2	6	2663457	2663462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5000	NC_016804	GCA	2	6	2663473	2663478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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