MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Marinitoga piezophila KA3 plasmid pMARPI01

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016748	TCC	2	6	47	52	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_016748	GGA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016748	T	7	7	64	70	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016748	CCT	2	6	790	795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016748	A	7	7	803	809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016748	A	6	6	827	832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016748	TAT	2	6	850	855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016748	ATT	2	6	902	907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016748	TAT	2	6	959	964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016748	TCCT	2	8	980	987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016748	ATC	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016748	TTTTAA	2	12	1012	1023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016748	TA	4	8	1045	1052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016748	CCT	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016748	TAT	2	6	1071	1076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016748	TA	3	6	1082	1087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016748	TA	4	8	1091	1098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016748	TAT	2	6	1124	1129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016748	AT	4	8	1136	1143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016748	TAT	2	6	1150	1155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016748	ATA	2	6	1161	1166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016748	AC	3	6	1174	1179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016748	T	6	6	1225	1230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016748	T	6	6	1239	1244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016748	TTA	2	6	1265	1270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016748	GAAAA	2	10	1324	1333	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016748	AGG	2	6	1335	1340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016748	TAT	2	6	2106	2111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016748	AGA	2	6	2118	2123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016748	TA	3	6	2178	2183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016748	ATTAT	2	10	2840	2849	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016748	A	7	7	3272	3278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016748	GGA	2	6	3279	3284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016748	CAG	2	6	3639	3644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016748	AATT	2	8	3667	3674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016748	GGC	2	6	7379	7384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016748	T	6	6	7386	7391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016748	GCC	2	6	7392	7397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016748	A	6	6	7565	7570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016748	AACT	2	8	7602	7609	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016748	ATT	2	6	7619	7624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016748	TC	3	6	7634	7639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016748	A	7	7	7679	7685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016748	TAA	2	6	7693	7698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016748	ATA	2	6	7809	7814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016748	AG	3	6	7833	7838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016748	A	6	6	7842	7847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016748	AAG	2	6	7856	7861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016748	T	6	6	8083	8088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016748	T	7	7	8121	8127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016748	AT	3	6	8148	8153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016748	GTTG	2	8	8157	8164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016748	A	7	7	8196	8202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016748	AT	3	6	8214	8219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016748	AAG	2	6	8269	8274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016748	CGT	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016748	TTA	2	6	8303	8308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016748	AGGA	2	8	8325	8332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016748	AAC	2	6	8404	8409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016748	A	7	7	8444	8450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016748	TCC	2	6	8700	8705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_016748	A	6	6	8711	8716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016748	T	8	8	8743	8750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016748	T	8	8	8752	8759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016748	ATA	2	6	8761	8766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016748	CCT	2	6	8815	8820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_016748	ATTTA	2	10	8824	8833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016748	TAA	2	6	8887	8892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016748	AAT	2	6	8925	8930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016748	ATG	2	6	8941	8946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016748	AT	3	6	8958	8963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016748	ATTTA	2	10	8971	8980	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016748	AG	4	8	8988	8995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016748	T	7	7	9013	9019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016748	GAA	2	6	9056	9061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016748	AAG	2	6	9698	9703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016748	TGAA	2	8	9828	9835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016748	T	8	8	9882	9889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016748	T	6	6	9945	9950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016748	TAA	2	6	9952	9957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016748	TAT	2	6	9971	9976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016748	TAT	2	6	10079	10084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016748	TAG	2	6	10103	10108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016748	A	9	9	10114	10122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016748	TTA	2	6	10128	10133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016748	T	8	8	10154	10161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016748	ATT	2	6	10252	10257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016748	TTTC	2	8	10398	10405	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016748	AT	3	6	10504	10509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016748	AACA	2	8	10517	10524	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016748	AAT	2	6	10583	10588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016748	TA	5	10	10603	10612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016748	GTT	2	6	10646	10651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016748	ATTT	2	8	10653	10660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016748	T	7	7	10697	10703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016748	AAT	2	6	10752	10757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016748	T	7	7	10772	10778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016748	T	6	6	10795	10800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016748	ATA	3	9	10821	10829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016748	TAT	2	6	10833	10838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016748	ATC	2	6	10868	10873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016748	TAG	2	6	10894	10899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016748	AAG	2	6	10922	10927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016748	A	6	6	10942	10947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016748	AAG	2	6	10949	10954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016748	TAAT	2	8	10962	10969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016748	A	8	8	10977	10984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016748	A	7	7	10986	10992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016748	A	6	6	11011	11016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016748	TTTA	2	8	11054	11061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016748	TTA	3	9	11072	11080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016748	GTA	2	6	11089	11094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016748	TTTG	2	8	11099	11106	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016748	AAG	2	6	11135	11140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016748	GA	3	6	11166	11171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016748	AGA	2	6	11184	11189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016748	GAA	2	6	11221	11226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016748	CTC	2	6	11244	11249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_016748	GCT	2	6	11260	11265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016748	ATA	2	6	11266	11271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016748	AT	3	6	11278	11283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016748	TTA	2	6	11361	11366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016748	TGA	2	6	11410	11415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016748	A	7	7	11443	11449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016748	ATTA	2	8	11459	11466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016748	T	7	7	11652	11658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016748	TG	3	6	11670	11675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016748	TA	3	6	11681	11686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016748	ATA	2	6	11806	11811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016748	AT	4	8	11850	11857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016748	AAT	2	6	12509	12514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016748	AAG	2	6	12553	12558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016748	TACT	2	8	12582	12589	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016748	GAAAG	2	10	12630	12639	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016748	CAT	2	6	12640	12645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016748	AGAT	2	8	12652	12659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016748	A	8	8	12666	12673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016748	ATA	2	6	12756	12761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016748	TAAAA	2	10	12765	12774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016748	A	6	6	12771	12776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.