MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 6560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015847	T	7	7	2	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015847	AT	3	6	36	41	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015847	TAAAA	2	10	55	64	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015847	CCA	2	6	90	95	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015847	AGG	2	6	119	124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015847	GGGAT	2	10	142	151	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015847	CTC	2	6	161	166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015847	TTAAA	2	10	190	199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015847	TCT	2	6	324	329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015847	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015847	CAG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015847	CAAC	2	8	532	539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015847	ACG	2	6	547	552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015847	CTG	2	6	608	613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015847	T	6	6	708	713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015847	CAA	2	6	790	795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015847	GGCT	2	8	801	808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015847	CCT	2	6	863	868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015847	AGG	2	6	880	885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015847	GTG	2	6	955	960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015847	CCG	2	6	1225	1230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015847	AC	3	6	1299	1304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015847	AT	3	6	1378	1383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015847	CCT	2	6	1564	1569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015847	TCA	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015847	TTA	2	6	1605	1610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015847	AAG	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015847	CGG	2	6	1819	1824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015847	TAC	3	9	1852	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015847	C	6	6	1924	1929	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_015847	CGG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015847	GCT	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015847	CTG	2	6	2060	2065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015847	CGA	3	9	2186	2194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015847	TTC	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015847	ACC	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015847	AGA	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015847	CAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015847	TTG	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015847	CCTACG	2	12	2515	2526	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015847	CAA	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015847	GAC	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015847	CATAC	2	10	2665	2674	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015847	CG	3	6	2798	2803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015847	AAG	2	6	2919	2924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015847	TAA	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015847	CCAAG	2	10	3165	3174	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015847	ATA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015847	TAG	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015847	T	7	7	3346	3352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015847	AGG	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015847	C	6	6	3404	3409	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_015847	AAGGCC	2	12	3438	3449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015847	GTG	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015847	GT	3	6	3484	3489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015847	TAT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015847	TAC	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015847	TCCT	2	8	3700	3707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015847	GGA	2	6	3749	3754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015847	CAC	2	6	3837	3842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015847	GTC	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015847	TCA	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015847	GGC	2	6	4001	4006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015847	GGT	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015847	CAG	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015847	CCA	2	6	4334	4339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015847	GCT	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015847	C	6	6	4449	4454	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_015847	CTG	2	6	4488	4493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015847	CT	3	6	4542	4547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015847	TGG	2	6	4572	4577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015847	CCA	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015847	TAT	2	6	4674	4679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015847	CGG	2	6	4801	4806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015847	TAG	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015847	ATA	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015847	TA	3	6	5021	5026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015847	TAA	2	6	6442	6447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015847	A	7	7	6446	6452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015847	T	7	7	6462	6468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015847	ATT	2	6	7578	7583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015847	T	6	6	8520	8525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015847	T	6	6	8536	8541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015847	CA	3	6	10162	10167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015847	TTAA	2	8	10188	10195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015847	TAAA	2	8	10199	10206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015847	AT	3	6	10208	10213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015847	T	7	7	11382	11388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015847	A	7	7	11394	11400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015847	TAA	2	6	11401	11406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015847	T	6	6	11618	11623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015847	ATA	2	6	11624	11629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015847	A	6	6	11663	11668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015847	ATT	2	6	11685	11690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015847	AAAT	2	8	11691	11698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015847	ATA	2	6	15456	15461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015847	T	6	6	15907	15912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015847	TAGT	2	8	17536	17543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015847	A	6	6	17551	17556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015847	A	7	7	19019	19025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015847	TAGAT	2	10	21529	21538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015847	TA	4	8	21565	21572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015847	A	6	6	21582	21587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015847	AT	3	6	21629	21634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015847	ATA	2	6	22729	22734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015847	GTT	2	6	22755	22760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015847	ATT	2	6	23623	23628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015847	TTAAA	2	10	23879	23888	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015847	A	6	6	23898	23903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015847	TAA	2	6	23904	23909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015847	TAAAA	2	10	23939	23948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015847	TAA	2	6	24398	24403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015847	ATAG	2	8	24420	24427	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015847	TAA	2	6	24443	24448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015847	TAA	3	9	24478	24486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015847	GAA	2	6	24490	24495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015847	AT	5	10	26602	26611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015847	TACT	2	8	26633	26640	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015847	ATA	2	6	26650	26655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015847	ATT	2	6	26671	26676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015847	ATT	2	6	26685	26690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015847	T	6	6	27833	27838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015847	A	6	6	27847	27852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015847	A	7	7	27861	27867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015847	AATA	2	8	27873	27880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015847	ACC	2	6	28159	28164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015847	T	7	7	28168	28174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015847	AGA	2	6	28190	28195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015847	TA	3	6	28196	28201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015847	AAT	2	6	28212	28217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015847	AT	3	6	31674	31679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015847	TTGT	2	8	31719	31726	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015847	A	6	6	31739	31744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015847	T	7	7	31775	31781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015847	GCCT	2	8	31802	31809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015847	ATTC	2	8	31950	31957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015847	TGGG	2	8	31980	31987	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015847	TCC	2	6	31995	32000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_015847	ATGAA	2	10	32064	32073	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015847	A	8	8	32075	32082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015847	CCA	2	6	32107	32112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_015847	AGG	2	6	32136	32141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015847	GGGAT	2	10	32159	32168	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015847	CTC	2	6	32178	32183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_015847	TTAAA	2	10	32207	32216	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015847	TCT	2	6	32341	32346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015847	GCT	2	6	32438	32443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015847	CAG	2	6	32539	32544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015847	CAAC	2	8	32549	32556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015847	ACG	2	6	32564	32569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015847	CTG	2	6	32625	32630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_015847	ATT	2	6	43786	43791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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