MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 chromosome

Total Repeats: 13069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015636	TAA	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015636	TAT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015636	TAAAT	2	10	49	58	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015636	ATT	2	6	78	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015636	ATT	2	6	577	582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015636	ACC	2	6	592	597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_015636	ATA	2	6	598	603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015636	TTAA	2	8	604	611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015636	ATTA	2	8	618	625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015636	ATT	2	6	629	634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015636	AT	3	6	659	664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015636	A	6	6	672	677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015636	ATT	2	6	1298	1303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015636	ATT	3	9	1311	1319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015636	ATT	2	6	1322	1327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015636	ATA	2	6	1343	1348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015636	TAA	2	6	1365	1370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015636	A	6	6	1369	1374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015636	ATA	2	6	3105	3110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015636	ATA	2	6	3117	3122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015636	TAA	2	6	3133	3138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015636	A	6	6	3137	3142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015636	TAA	2	6	3143	3148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015636	ATT	2	6	3160	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015636	CTT	2	6	3174	3179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015636	TAT	2	6	3182	3187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015636	ATT	3	9	3188	3196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015636	TAT	3	9	3197	3205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015636	ATT	4	12	3215	3226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015636	AT	4	8	3233	3240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015636	TGGA	2	8	3268	3275	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015636	A	6	6	4763	4768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015636	TAA	2	6	4775	4780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015636	AAAATA	2	12	4781	4792	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015636	A	6	6	4811	4816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015636	ATT	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015636	ATG	2	6	4842	4847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015636	T	6	6	6008	6013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015636	T	8	8	6023	6030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015636	AATT	2	8	6039	6046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015636	ATT	2	6	6060	6065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015636	ATA	2	6	6083	6088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015636	TTC	2	6	6114	6119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015636	TAT	2	6	6201	6206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015636	TAT	2	6	6213	6218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015636	TTA	2	6	6219	6224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015636	ATA	2	6	6488	6493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015636	ATT	3	9	6522	6530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015636	AT	4	8	6549	6556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015636	TGG	2	6	6566	6571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015636	TA	3	6	8106	8111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015636	TA	3	6	8122	8127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015636	TTA	2	6	8908	8913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015636	TA	3	6	8912	8917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015636	T	6	6	8918	8923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015636	TATT	2	8	8948	8955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015636	ATA	2	6	8970	8975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015636	AAT	2	6	8980	8985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015636	TAAT	2	8	8992	8999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015636	A	6	6	9018	9023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015636	TA	4	8	9024	9031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015636	ATATA	2	10	9042	9051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015636	TA	3	6	9054	9059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015636	GTA	2	6	9087	9092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015636	ATATA	2	10	10294	10303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015636	A	6	6	10325	10330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015636	A	6	6	10335	10340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015636	TGG	2	6	10375	10380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015636	TAAAA	2	10	10428	10437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015636	A	7	7	10441	10447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015636	TAAAA	2	10	10448	10457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015636	A	6	6	10474	10479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015636	A	7	7	10488	10494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015636	ATAA	2	8	10510	10517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015636	A	6	6	10516	10521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015636	TGT	2	6	10564	10569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015636	A	6	6	10581	10586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015636	T	7	7	10976	10982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015636	TTTAA	2	10	10987	10996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015636	TAA	2	6	11026	11031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015636	TA	3	6	11032	11037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015636	ATA	3	9	11059	11067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015636	A	6	6	11072	11077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015636	TAA	3	9	11921	11929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015636	TAA	2	6	11940	11945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015636	ATA	2	6	11962	11967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015636	TAA	2	6	11985	11990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015636	AAT	2	6	11991	11996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015636	ATTAAA	2	12	12041	12052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015636	ATAA	2	8	12063	12070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015636	AT	4	8	12072	12079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015636	ATGT	2	8	12081	12088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015636	TTAA	2	8	12915	12922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015636	T	6	6	14010	14015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015636	AATA	2	8	14031	14038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015636	ATA	2	6	14044	14049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015636	TAA	3	9	14057	14065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015636	TAA	2	6	14082	14087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015636	AAT	2	6	14088	14093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015636	AAT	2	6	14108	14113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015636	TATT	2	8	14114	14121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015636	AT	3	6	14136	14141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015636	ATTA	2	8	14146	14153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015636	ATC	3	9	15109	15117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015636	T	6	6	15137	15142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015636	T	7	7	15150	15156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015636	T	6	6	15161	15166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015636	ATT	2	6	15173	15178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015636	A	6	6	15193	15198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015636	TAA	2	6	15210	15215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015636	AATTC	2	10	15222	15231	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015636	AT	4	8	15270	15277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015636	ATTT	2	8	15302	15309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015636	ATATT	2	10	15326	15335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015636	ATTT	2	8	15353	15360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015636	ATA	2	6	15363	15368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015636	TAT	2	6	15372	15377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015636	A	6	6	16110	16115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015636	AAT	2	6	16131	16136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015636	A	6	6	16147	16152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015636	AAT	2	6	16155	16160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015636	A	6	6	16168	16173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015636	TAA	2	6	16174	16179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015636	A	7	7	16184	16190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015636	T	6	6	16526	16531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015636	T	7	7	16541	16547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015636	TA	3	6	16559	16564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015636	TTA	2	6	16569	16574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015636	TAG	2	6	16577	16582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015636	TTA	2	6	16606	16611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015636	AGG	2	6	16687	16692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015636	CTA	2	6	18374	18379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015636	ATA	2	6	18388	18393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015636	TA	3	6	18392	18397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015636	TAA	2	6	18404	18409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015636	TAA	2	6	18412	18417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015636	TA	3	6	18433	18438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015636	A	7	7	18453	18459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015636	TTTC	2	8	18807	18814	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015636	T	7	7	18815	18821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015636	TAA	3	9	18847	18855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015636	ATA	2	6	18856	18861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015636	TA	3	6	18864	18869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015636	AT	3	6	18879	18884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015636	TA	3	6	18891	18896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015636	TTTTA	2	10	20087	20096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015636	T	7	7	20120	20126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015636	ATT	2	6	21037	21042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015636	TAT	2	6	21045	21050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015636	ATT	3	9	21056	21064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015636	TTA	3	9	21065	21073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015636	TTA	2	6	21076	21081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015636	ATT	2	6	21085	21090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015636	ATTTT	2	10	21093	21102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015636	ATT	2	6	21105	21110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015636	T	7	7	21120	21126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015636	T	6	6	21129	21134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015636	TA	3	6	21150	21155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015636	ATT	2	6	21167	21172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_015636	ATT	2	6	21215	21220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015636	TA	3	6	21235	21240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015636	TA	4	8	21249	21256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015636	T	6	6	22862	22867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015636	T	6	6	22877	22882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015636	T	6	6	22927	22932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_015636	ATT	2	6	22951	22956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_015636	A	6	6	25310	25315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_015636	TAA	2	6	25391	25396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_015636	TA	3	6	26045	26050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_015636	TA	3	6	26120	26125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_015636	TTATT	2	10	26153	26162	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015636	TTTA	2	8	26163	26170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_015636	T	6	6	27329	27334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_015636	ATT	2	6	27395	27400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_015636	TAT	2	6	27412	27417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_015636	TAT	2	6	27437	27442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_015636	AT	4	8	36920	36927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_015636	TTAT	2	8	36990	36997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_015636	TAT	2	6	44121	44126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_015636	ATT	2	6	54770	54775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_015636	ATT	2	6	54781	54786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015636	ACC	2	6	55660	55665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_015636	TA	4	8	55681	55688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015636	TTG	2	6	55689	55694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015636	TAT	2	6	55695	55700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015636	CATTAT	2	12	55717	55728	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
295	NC_015636	AACTA	2	10	55737	55746	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
296	NC_015636	TAT	2	6	55749	55754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_015636	A	6	6	55760	55765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_015636	TA	5	10	55791	55800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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