MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 15277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015574	TAT	2	6	41	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015574	GGA	2	6	101	106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015574	A	6	6	1529	1534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015574	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015574	TAGAT	2	10	1545	1554	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015574	AAT	2	6	1560	1565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015574	T	8	8	1579	1586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015574	GTT	2	6	2753	2758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015574	ATA	3	9	2837	2845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015574	A	9	9	2865	2873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015574	AAT	2	6	2878	2883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015574	A	6	6	2895	2900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015574	GTA	2	6	3492	3497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015574	CTT	2	6	5374	5379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015574	T	9	9	5378	5386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015574	T	8	8	5409	5416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015574	T	7	7	5424	5430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015574	TTA	2	6	5466	5471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015574	ACAAA	2	10	5472	5481	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015574	A	6	6	5490	5495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015574	CAA	2	6	5502	5507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015574	TAC	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015574	TA	3	6	6920	6925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015574	ATT	2	6	6939	6944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015574	ATTT	2	8	6949	6956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015574	ATTA	2	8	6974	6981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015574	AT	3	6	8104	8109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015574	ATT	2	6	8129	8134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015574	T	8	8	8155	8162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015574	ATTT	2	8	8182	8189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015574	A	6	6	8279	8284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015574	A	6	6	8292	8297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015574	ATT	2	6	8308	8313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015574	ATG	2	6	8323	8328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015574	TCC	2	6	9173	9178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015574	GCT	2	6	9194	9199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015574	T	7	7	9199	9205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015574	T	6	6	9207	9212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015574	ATTT	2	8	9227	9234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015574	T	8	8	9239	9246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015574	T	7	7	9267	9273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015574	ATTA	2	8	9324	9331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015574	TTAA	2	8	9369	9376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015574	ATTT	2	8	9404	9411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015574	ATG	2	6	9470	9475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015574	T	7	7	10823	10829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015574	TTTC	2	8	10838	10845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015574	T	8	8	10857	10864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015574	A	6	6	10871	10876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015574	ATA	2	6	11489	11494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015574	T	6	6	11557	11562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015574	TTG	2	6	11590	11595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015574	AGAA	2	8	11601	11608	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015574	CCTT	2	8	11640	11647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015574	T	9	9	11646	11654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015574	TAGT	2	8	11701	11708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015574	TATAT	2	10	11709	11718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015574	TAT	2	6	11736	11741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015574	ATA	2	6	11832	11837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015574	TGA	2	6	13870	13875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015574	TAA	2	6	13878	13883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015574	CTT	2	6	13892	13897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015574	T	6	6	13900	13905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015574	AAC	2	6	14793	14798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015574	T	8	8	14807	14814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015574	CTTA	2	8	14846	14853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015574	ACC	2	6	15628	15633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015574	T	8	8	15674	15681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015574	TTA	2	6	15684	15689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015574	CTT	2	6	15697	15702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015574	CAT	2	6	15717	15722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015574	TAA	2	6	16586	16591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015574	TCT	2	6	16594	16599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015574	CT	3	6	16598	16603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015574	A	6	6	16643	16648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015574	ATTTA	2	10	16693	16702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015574	GTT	2	6	16730	16735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015574	CTA	2	6	17362	17367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015574	AAT	2	6	17387	17392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015574	AGA	2	6	17410	17415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015574	ATT	2	6	17420	17425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015574	ATA	2	6	17429	17434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015574	A	6	6	17470	17475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015574	ATTT	2	8	17516	17523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015574	AAG	2	6	17527	17532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015574	A	7	7	17542	17548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015574	ATT	2	6	18819	18824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015574	TCC	2	6	18826	18831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015574	TAAA	2	8	18865	18872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015574	ATT	2	6	18899	18904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015574	T	8	8	18978	18985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015574	ATAG	2	8	19021	19028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015574	A	6	6	19045	19050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015574	TAAA	2	8	19051	19058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015574	A	6	6	19056	19061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015574	T	7	7	20370	20376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015574	CTT	2	6	20439	20444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015574	T	7	7	20466	20472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015574	A	7	7	20488	20494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015574	G	7	7	20500	20506	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015574	TAA	2	6	20551	20556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015574	TTTATA	2	12	20586	20597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015574	TCT	2	6	20641	20646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015574	TAA	2	6	21753	21758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015574	GAT	2	6	21770	21775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015574	ATTG	2	8	22442	22449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015574	TTA	2	6	22474	22479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015574	ATT	2	6	22494	22499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015574	TTAA	2	8	22513	22520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015574	T	7	7	22534	22540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015574	T	8	8	22549	22556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015574	ATTT	2	8	22569	22576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015574	ATTT	2	8	22579	22586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015574	T	6	6	22584	22589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015574	TCT	2	6	22605	22610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015574	TC	3	6	22624	22629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015574	TAA	2	6	22637	22642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015574	TAATA	2	10	22647	22656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015574	TTGT	2	8	22677	22684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015574	ATT	2	6	22747	22752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015574	TAA	2	6	22766	22771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015574	TAA	2	6	22798	22803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015574	A	8	8	22828	22835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015574	ATTT	2	8	23708	23715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015574	GCA	2	6	25294	25299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015574	A	8	8	25335	25342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015574	T	6	6	26235	26240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015574	T	7	7	26279	26285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015574	TATAA	2	10	26293	26302	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015574	T	9	9	26342	26350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015574	TCT	3	9	26376	26384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015574	A	7	7	26410	26416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015574	TTCA	2	8	27647	27654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015574	ACC	2	6	27723	27728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_015574	AAG	2	6	27740	27745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015574	TAAAA	2	10	27797	27806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015574	T	8	8	28148	28155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015574	T	6	6	28168	28173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015574	TAC	2	6	28202	28207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015574	TAT	2	6	28229	28234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015574	TTTAA	2	10	28355	28364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015574	AT	3	6	28389	28394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015574	AT	3	6	28402	28407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015574	ATAAA	2	10	28440	28449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015574	A	7	7	28458	28464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015574	AATTA	2	10	28476	28485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015574	A	8	8	28485	28492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015574	A	7	7	28499	28505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015574	TCA	2	6	29835	29840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015574	ATT	2	6	29846	29851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015574	ATTTTT	2	12	29858	29869	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015574	T	8	8	29902	29909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_015574	TAA	2	6	91822	91827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_015574	TTA	2	6	91861	91866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_015574	AAATA	2	10	95917	95926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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