MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 10998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015572	TAT	2	6	27	32	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015572	CA	3	6	1459	1464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015572	CAA	2	6	1468	1473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015572	TAA	2	6	1484	1489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015572	T	6	6	1528	1533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015572	GTA	3	9	1540	1548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015572	AATA	2	8	1551	1558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015572	A	6	6	1558	1563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015572	GTTT	2	8	3795	3802	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015572	GCG	2	6	3828	3833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015572	ACA	2	6	3862	3867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015572	A	6	6	6336	6341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015572	CTA	2	6	6361	6366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015572	A	7	7	6390	6396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015572	TGGATT	2	12	6430	6441	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015572	AAC	2	6	6458	6463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015572	AAAATC	2	12	6477	6488	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015572	TTG	2	6	6574	6579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015572	T	6	6	6620	6625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015572	CTTA	2	8	6632	6639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015572	CAA	2	6	6643	6648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015572	GCGAT	2	10	6711	6720	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015572	ATGA	2	8	6791	6798	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015572	AAG	2	6	6844	6849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015572	GTT	2	6	6939	6944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015572	GTT	2	6	9831	9836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015572	GAA	2	6	10008	10013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015572	CTC	2	6	10019	10024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015572	ATG	2	6	10268	10273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015572	TGT	2	6	11598	11603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015572	TAGT	2	8	11641	11648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015572	TTA	2	6	11688	11693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015572	GCATCA	2	12	11761	11772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015572	ATT	2	6	11825	11830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015572	ATT	2	6	11922	11927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015572	A	6	6	11964	11969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015572	CAAAC	2	10	11979	11988	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015572	CAA	2	6	12037	12042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015572	GTT	2	6	12082	12087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015572	T	6	6	12108	12113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015572	ATT	2	6	12150	12155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015572	A	6	6	12160	12165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015572	ACC	2	6	12794	12799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015572	GTT	2	6	12810	12815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015572	AGC	2	6	12825	12830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015572	TGT	2	6	12874	12879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015572	AGT	2	6	12896	12901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015572	ATT	2	6	17959	17964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015572	CGTCCA	2	12	17979	17990	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015572	TGT	2	6	19843	19848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015572	ACCA	2	8	19904	19911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015572	GT	3	6	19983	19988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015572	TTA	2	6	19989	19994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015572	GTT	2	6	20061	20066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015572	GGC	2	6	20115	20120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015572	AGC	2	6	20175	20180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015572	AGCC	2	8	20364	20371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015572	TCAG	2	8	20375	20382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015572	TTAT	2	8	20405	20412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015572	AGC	2	6	20431	20436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015572	ACA	2	6	20466	20471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015572	GCA	2	6	21105	21110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015572	AAC	2	6	21153	21158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015572	CGG	2	6	29560	29565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015572	AGC	2	6	29580	29585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015572	TAA	2	6	29696	29701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015572	TAA	2	6	29759	29764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015572	CCTG	2	8	29797	29804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015572	GAT	2	6	30151	30156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015572	CGAC	2	8	30190	30197	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015572	GCC	2	6	30331	30336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015572	AT	3	6	30810	30815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015572	AAG	2	6	30891	30896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015572	CAA	2	6	30918	30923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015572	GAG	2	6	30937	30942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015572	GAA	2	6	30953	30958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015572	TTTG	2	8	31009	31016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015572	GGC	2	6	31108	31113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015572	TGT	2	6	32026	32031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015572	GAT	2	6	37481	37486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015572	TTA	2	6	38944	38949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015572	GAT	2	6	38962	38967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015572	T	6	6	38967	38972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015572	CAT	2	6	39065	39070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015572	TAT	2	6	39098	39103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015572	ACC	2	6	39105	39110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_015572	TGG	2	6	39121	39126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015572	T	6	6	39169	39174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015572	TTG	2	6	40163	40168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015572	ATTT	2	8	40239	40246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015572	A	6	6	40277	40282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015572	AGCA	2	8	41784	41791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015572	GCA	2	6	41823	41828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015572	GAT	2	6	41868	41873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015572	CCG	2	6	41877	41882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015572	CAC	2	6	41942	41947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015572	TTA	2	6	41960	41965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015572	TAAGA	2	10	47483	47492	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015572	TGT	2	6	47504	47509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015572	ATT	2	6	47565	47570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015572	CAA	2	6	47591	47596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015572	CCA	2	6	47597	47602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015572	TGG	2	6	47612	47617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015572	CGG	2	6	47627	47632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015572	CCG	2	6	47639	47644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015572	CGG	2	6	47669	47674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015572	CGGG	2	8	47700	47707	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015572	GCC	2	6	47713	47718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015572	ATA	2	6	47980	47985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015572	GCC	2	6	48015	48020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015572	GCT	2	6	48053	48058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015572	TCAC	2	8	48141	48148	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015572	CAAG	2	8	48224	48231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015572	TAA	2	6	48260	48265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015572	TCCA	2	8	48266	48273	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015572	GCCG	2	8	48283	48290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015572	TTGG	2	8	48446	48453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015572	CAA	2	6	48522	48527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015572	AAC	2	6	50384	50389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015572	GTTG	2	8	53031	53038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015572	TTTG	2	8	53129	53136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015572	GAA	2	6	53209	53214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015572	AAT	2	6	53225	53230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015572	TTTG	2	8	53288	53295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015572	CTAT	2	8	53363	53370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015572	ATT	2	6	53383	53388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015572	GC	3	6	53440	53445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015572	GAA	2	6	53453	53458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015572	CGT	2	6	53464	53469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015572	GA	3	6	53518	53523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015572	GAA	2	6	54929	54934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015572	CGC	2	6	54966	54971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015572	TAA	2	6	55018	55023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015572	CTG	2	6	55277	55282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015572	T	6	6	55294	55299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015572	TAT	2	6	55366	55371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015572	A	6	6	55396	55401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015572	CTA	2	6	55438	55443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015572	CTTT	2	8	55785	55792	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015572	TG	3	6	55821	55826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015572	GGC	2	6	55844	55849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015572	CCG	2	6	55930	55935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_015572	CCA	2	6	55945	55950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_015572	GTT	2	6	55964	55969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015572	T	6	6	56055	56060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015572	GATT	2	8	56093	56100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015572	TAA	2	6	56102	56107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015572	TCA	2	6	56119	56124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015572	TGAAA	2	10	56163	56172	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015572	GGT	2	6	56200	56205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015572	AC	3	6	56229	56234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015572	GT	3	6	56249	56254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015572	CCGA	2	8	56317	56324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_015572	CTC	2	6	56404	56409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_015572	CCTG	2	8	56465	56472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
156	NC_015572	TCC	2	6	56552	56557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_015572	TCGTT	2	10	56562	56571	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
158	NC_015572	AAG	2	6	56714	56719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_015572	CG	3	6	58597	58602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_015572	AGC	2	6	58612	58617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_015572	GGGA	2	8	58623	58630	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015572	GCT	2	6	63413	63418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_015572	GCT	2	6	63450	63455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_015572	GAA	2	6	63764	63769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_015572	TGG	2	6	63827	63832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_015572	AGG	2	6	63923	63928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_015572	CG	3	6	63933	63938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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181	NC_015572	ATT	2	6	64364	64369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015572	TTG	2	6	64399	64404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_015572	T	6	6	65130	65135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015572	ATGC	2	8	65154	65161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
185	NC_015572	AT	3	6	65174	65179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015572	A	7	7	65199	65205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_015572	ATTA	2	8	65268	65275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015572	GC	3	6	65355	65360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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196	NC_015572	TTG	2	6	70012	70017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_015572	CTT	2	6	93109	93114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_015572	A	8	8	93161	93168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_015572	CG	3	6	95189	95194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
282	NC_015572	AAG	2	6	95206	95211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_015572	TGT	2	6	95241	95246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_015572	GTCT	2	8	95257	95264	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
286	NC_015572	GTT	2	6	95277	95282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015572	GCG	2	6	95416	95421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_015572	TTTC	2	8	95425	95432	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
289	NC_015572	GCT	2	6	95499	95504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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