MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 10998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015572	AGA	2	6	445237	445242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015572	CGT	2	6	445247	445252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_015572	T	7	7	445396	445402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015572	CTGT	2	8	447159	447166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_015572	CT	3	6	447238	447243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_015572	T	6	6	447265	447270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015572	CGG	2	6	447352	447357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015572	T	6	6	451544	451549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015572	CAA	2	6	451571	451576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_015572	AGT	2	6	451614	451619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015572	T	7	7	451625	451631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015572	GCA	2	6	451656	451661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_015572	A	6	6	453184	453189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015572	A	7	7	453312	453318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015572	ACG	2	6	453329	453334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_015572	ACT	2	6	453338	453343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015572	AGC	2	6	453354	453359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_015572	CAC	2	6	453370	453375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_015572	CGC	2	6	453600	453605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_015572	CCA	3	9	453608	453616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_015572	T	8	8	453645	453652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015572	ATCCA	2	10	453684	453693	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1023	NC_015572	GGCAA	2	10	453726	453735	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1024	NC_015572	T	6	6	453752	453757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015572	GAA	2	6	453761	453766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015572	TTTC	2	8	453782	453789	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_015572	ATT	2	6	453914	453919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015572	CTT	2	6	453978	453983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_015572	CAA	2	6	454014	454019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_015572	AAAAC	2	10	454120	454129	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1031	NC_015572	T	6	6	454173	454178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015572	TCTT	2	8	454269	454276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_015572	GTT	2	6	454287	454292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015572	TTG	2	6	454360	454365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015572	ACTA	2	8	454410	454417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_015572	GTTA	2	8	454424	454431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015572	CCT	2	6	454459	454464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_015572	TTGA	2	8	454482	454489	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015572	TTCT	2	8	454503	454510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_015572	TATT	2	8	454536	454543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015572	A	6	6	454544	454549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015572	GGCAAA	2	12	454555	454566	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1043	NC_015572	AAT	2	6	454575	454580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015572	TAAT	2	8	454619	454626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015572	CCAG	2	8	456147	456154	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_015572	T	6	6	457087	457092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015572	ACA	2	6	457138	457143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015572	ATT	2	6	457146	457151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015572	ATT	2	6	459664	459669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015572	GTT	2	6	459690	459695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015572	CGG	2	6	459832	459837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_015572	TAA	2	6	459854	459859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015572	GCT	2	6	461576	461581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_015572	ATG	2	6	461626	461631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015572	CCG	2	6	461656	461661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_015572	CGT	2	6	461695	461700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_015572	GTCC	2	8	461723	461730	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_015572	A	6	6	462400	462405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015572	ATC	2	6	462426	462431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015572	T	8	8	462444	462451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015572	ATTCG	2	10	462524	462533	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1062	NC_015572	GC	3	6	462960	462965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_015572	AAT	2	6	462968	462973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015572	CGC	2	6	463007	463012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_015572	AGA	2	6	463032	463037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015572	TGA	2	6	463061	463066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015572	T	6	6	463083	463088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015572	ATTA	2	8	469153	469160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015572	TAA	2	6	469210	469215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015572	GGGA	2	8	472348	472355	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015572	T	6	6	476123	476128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015572	A	6	6	477008	477013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015572	TTA	2	6	477034	477039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015572	GGC	2	6	477055	477060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_015572	CATA	2	8	477111	477118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_015572	GCC	2	6	477155	477160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_015572	TGT	2	6	477188	477193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015572	T	6	6	477254	477259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015572	GAT	2	6	477267	477272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015572	TG	3	6	477281	477286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015572	TTACG	2	10	477385	477394	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1082	NC_015572	TGAT	2	8	477416	477423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015572	GCA	2	6	477492	477497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_015572	AAT	2	6	477672	477677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015572	AATT	2	8	481505	481512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015572	G	7	7	482174	482180	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015572	A	7	7	483941	483947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015572	TGG	2	6	484022	484027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015572	CAT	2	6	484065	484070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_015572	AAT	3	9	484084	484092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015572	AAC	2	6	484102	484107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_015572	TGT	2	6	484781	484786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015572	TATC	2	8	484793	484800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_015572	GTT	2	6	484820	484825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015572	T	6	6	485823	485828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015572	GCA	2	6	492288	492293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_015572	ATT	2	6	495330	495335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015572	A	6	6	499973	499978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015572	TAA	2	6	501354	501359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015572	GTC	2	6	502544	502549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_015572	TCG	2	6	503695	503700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_015572	AAGA	2	8	503817	503824	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015572	CGG	2	6	503898	503903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_015572	AT	3	6	504050	504055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015572	GTT	2	6	504558	504563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015572	CAA	3	9	504594	504602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_015572	GGC	2	6	504700	504705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_015572	TCTGT	2	10	504736	504745	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1109	NC_015572	CCG	2	6	504784	504789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_015572	TTCGGG	2	12	505318	505329	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1111	NC_015572	T	6	6	505372	505377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015572	T	6	6	505379	505384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015572	TA	3	6	505390	505395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015572	TG	3	6	505418	505423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015572	TTAT	2	8	505473	505480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015572	CT	3	6	505521	505526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_015572	TAAT	2	8	505535	505542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015572	AT	3	6	505541	505546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015572	ATT	2	6	505582	505587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015572	CAA	3	9	508029	508037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_015572	CGC	2	6	508056	508061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_015572	ATC	2	6	508172	508177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_015572	CGT	2	6	508221	508226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_015572	ATT	2	6	508246	508251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015572	GCC	2	6	508511	508516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_015572	CCG	2	6	508532	508537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_015572	TCGTCC	2	12	508541	508552	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_015572	AG	3	6	508562	508567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015572	A	6	6	508613	508618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015572	TAGGG	2	10	508638	508647	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015572	TGATT	2	10	508693	508702	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015572	T	6	6	508729	508734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_015572	A	6	6	508747	508752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015572	GTTTT	2	10	508766	508775	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015572	T	6	6	508772	508777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015572	TGT	2	6	508891	508896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_015572	G	7	7	510018	510024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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