MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 10998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015572	AGA	2	6	2314666	2314671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_015572	GCA	2	6	2314678	2314683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_015572	ATT	2	6	2314725	2314730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_015572	CAG	2	6	2314898	2314903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_015572	GC	3	6	2314911	2314916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_015572	AGC	2	6	2314968	2314973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_015572	AATCCG	2	12	2315019	2315030	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_015572	GTC	2	6	2315067	2315072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_015572	TTG	2	6	2315103	2315108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_015572	TCA	2	6	2315975	2315980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_015572	GGC	2	6	2315991	2315996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_015572	CGC	2	6	2316004	2316009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_015572	GATAA	2	10	2318709	2318718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_015572	GATA	2	8	2318772	2318779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_015572	AAGC	2	8	2318819	2318826	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5016	NC_015572	AGA	3	9	2319453	2319461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_015572	GTT	2	6	2319476	2319481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_015572	TAAA	2	8	2320202	2320209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_015572	CGC	2	6	2320984	2320989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_015572	AAG	2	6	2320997	2321002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_015572	AAC	2	6	2321017	2321022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_015572	CCG	2	6	2321026	2321031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_015572	TGG	2	6	2321172	2321177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_015572	GGCA	2	8	2321236	2321243	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_015572	GTT	2	6	2321253	2321258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_015572	AGCC	2	8	2321285	2321292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_015572	GCTT	2	8	2323057	2323064	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_015572	GC	3	6	2323779	2323784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_015572	CCG	2	6	2323814	2323819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_015572	ATG	2	6	2323840	2323845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_015572	TCG	2	6	2326497	2326502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_015572	AAG	2	6	2326551	2326556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_015572	TATAG	2	10	2326558	2326567	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_015572	CGG	2	6	2326611	2326616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_015572	CCG	2	6	2327223	2327228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_015572	GGGTT	2	10	2327306	2327315	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_015572	T	6	6	2327990	2327995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_015572	GT	3	6	2328067	2328072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_015572	GTT	2	6	2328151	2328156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_015572	AAT	2	6	2328225	2328230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_015572	ATG	2	6	2328987	2328992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_015572	AAT	2	6	2329012	2329017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_015572	CAAG	2	8	2329028	2329035	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_015572	GAT	2	6	2329054	2329059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_015572	ATG	2	6	2329294	2329299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_015572	TG	3	6	2329302	2329307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_015572	TAA	2	6	2329386	2329391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_015572	CTT	2	6	2329943	2329948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_015572	T	6	6	2332736	2332741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_015572	TA	3	6	2334054	2334059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_015572	CGGAA	2	10	2334087	2334096	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5052	NC_015572	CGG	2	6	2334109	2334114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_015572	AAG	2	6	2334246	2334251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_015572	AGC	2	6	2335017	2335022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_015572	GC	3	6	2335036	2335041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_015572	CAT	2	6	2335201	2335206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_015572	ATC	2	6	2335315	2335320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_015572	TGGAG	2	10	2335383	2335392	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_015572	TGG	2	6	2341581	2341586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_015572	GAA	2	6	2341607	2341612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_015572	ATT	2	6	2341616	2341621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_015572	GATG	2	8	2341665	2341672	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_015572	GCG	2	6	2341783	2341788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_015572	TCT	3	9	2341798	2341806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_015572	CTT	2	6	2341812	2341817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_015572	TGAA	2	8	2341847	2341854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_015572	AAT	2	6	2341862	2341867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_015572	AGG	2	6	2341905	2341910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_015572	TG	3	6	2341929	2341934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_015572	CAGG	2	8	2348332	2348339	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5071	NC_015572	TC	3	6	2348347	2348352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_015572	TGA	2	6	2348366	2348371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_015572	TTTC	2	8	2348395	2348402	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_015572	GCG	2	6	2348407	2348412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_015572	TTTGC	2	10	2348439	2348448	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5076	NC_015572	A	7	7	2348508	2348514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_015572	TCCA	2	8	2348538	2348545	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_015572	A	6	6	2348555	2348560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_015572	T	6	6	2348586	2348591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_015572	AAT	2	6	2348688	2348693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_015572	TA	3	6	2349184	2349189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_015572	ATTT	2	8	2349200	2349207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_015572	GTT	2	6	2356435	2356440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_015572	AAT	2	6	2356507	2356512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_015572	TCC	2	6	2356554	2356559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_015572	TAA	2	6	2356580	2356585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_015572	CCAA	2	8	2356658	2356665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_015572	AGT	2	6	2356691	2356696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_015572	GTT	2	6	2356717	2356722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_015572	GTT	3	9	2356808	2356816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_015572	T	7	7	2356824	2356830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_015572	TA	3	6	2356836	2356841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_015572	TTA	2	6	2359894	2359899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_015572	ATT	2	6	2359938	2359943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_015572	TTGTT	2	10	2359947	2359956	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_015572	CTAAA	2	10	2359959	2359968	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5097	NC_015572	A	6	6	2359982	2359987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_015572	TA	4	8	2359999	2360006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_015572	GCT	2	6	2368235	2368240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_015572	AAT	2	6	2368253	2368258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_015572	TTAT	2	8	2370808	2370815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_015572	TGCG	2	8	2370899	2370906	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5103	NC_015572	T	6	6	2370967	2370972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_015572	CAA	2	6	2376172	2376177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_015572	CCG	2	6	2378017	2378022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_015572	AT	3	6	2378776	2378781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_015572	TTG	2	6	2378851	2378856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_015572	AAT	2	6	2378860	2378865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_015572	AATT	2	8	2379885	2379892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_015572	T	6	6	2379921	2379926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_015572	A	7	7	2380779	2380785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_015572	T	6	6	2380802	2380807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_015572	GCG	2	6	2382134	2382139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_015572	GAA	2	6	2382160	2382165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_015572	TCG	2	6	2382176	2382181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_015572	GCC	2	6	2382208	2382213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_015572	AGCT	2	8	2382219	2382226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_015572	TG	3	6	2382236	2382241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_015572	G	6	6	2386323	2386328	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_015572	TTA	2	6	2386645	2386650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_015572	TTGT	2	8	2386676	2386683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_015572	ATT	2	6	2387521	2387526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_015572	ATCT	2	8	2387533	2387540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5124	NC_015572	AAT	2	6	2387567	2387572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_015572	CCT	2	6	2387622	2387627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_015572	CCAA	2	8	2387636	2387643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_015572	CG	3	6	2387751	2387756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5128	NC_015572	TTA	2	6	2387855	2387860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_015572	AAT	2	6	2387892	2387897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_015572	TGC	2	6	2387915	2387920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_015572	GCA	2	6	2388170	2388175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_015572	TGGC	2	8	2388268	2388275	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5133	NC_015572	TTA	2	6	2388286	2388291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_015572	GTC	2	6	2389970	2389975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_015572	AGT	2	6	2390003	2390008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_015572	GCT	2	6	2390040	2390045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5137	NC_015572	AAT	2	6	2390049	2390054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_015572	A	6	6	2390765	2390770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_015572	TGCC	2	8	2390827	2390834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5148	NC_015572	CATTT	2	10	2395551	2395560	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5149	NC_015572	CGG	2	6	2395575	2395580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5150	NC_015572	AGCA	2	8	2396612	2396619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5153	NC_015572	ATA	2	6	2398539	2398544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5154	NC_015572	TTGC	2	8	2398662	2398669	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5155	NC_015572	GGC	2	6	2398701	2398706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5156	NC_015572	AATA	2	8	2398756	2398763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_015572	A	7	7	2402400	2402406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5162	NC_015572	AATC	2	8	2403183	2403190	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5163	NC_015572	T	6	6	2403258	2403263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5164	NC_015572	A	6	6	2404555	2404560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_015572	CCG	2	6	2404568	2404573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5167	NC_015572	GGT	2	6	2407362	2407367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5168	NC_015572	TTTG	2	8	2407402	2407409	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5204	NC_015572	AT	3	6	2419603	2419608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5205	NC_015572	TTA	2	6	2423567	2423572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5220	NC_015572	TCG	2	6	2431650	2431655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5250	NC_015572	A	6	6	2451588	2451593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_015572	CTA	2	6	2451609	2451614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5253	NC_015572	GAT	2	6	2453981	2453986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_015572	TGA	2	6	2454536	2454541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_015572	CCGT	2	8	2454578	2454585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5256	NC_015572	GGC	2	6	2454652	2454657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5257	NC_015572	A	7	7	2454692	2454698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_015572	CTG	2	6	2455311	2455316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_015572	AAT	2	6	2456643	2456648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_015572	GCG	3	9	2456686	2456694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5261	NC_015572	A	7	7	2461386	2461392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5263	NC_015572	CAG	2	6	2461418	2461423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5397	NC_015572	AT	3	6	2506797	2506802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5398	NC_015572	T	8	8	2506802	2506809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5399	NC_015572	C	6	6	2506912	2506917	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5425	NC_015572	TGG	2	6	2509784	2509789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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