MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 10998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015572	CGCT	2	8	2070716	2070723	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_015572	TGAC	2	8	2072004	2072011	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4503	NC_015572	TCG	2	6	2072053	2072058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_015572	T	7	7	2072075	2072081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_015572	AAT	2	6	2072111	2072116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_015572	T	6	6	2073223	2073228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_015572	CGTT	2	8	2073239	2073246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4508	NC_015572	AGT	2	6	2073297	2073302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_015572	GATT	2	8	2073343	2073350	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_015572	CGA	2	6	2073355	2073360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_015572	GAAT	2	8	2073372	2073379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_015572	TAAT	2	8	2073404	2073411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_015572	CTGT	2	8	2073421	2073428	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_015572	TGC	2	6	2078110	2078115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_015572	GCGG	2	8	2078148	2078155	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_015572	AGG	2	6	2078739	2078744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_015572	GC	3	6	2079950	2079955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4518	NC_015572	TAT	2	6	2084831	2084836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_015572	GCTTT	2	10	2088790	2088799	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4520	NC_015572	ATT	2	6	2094721	2094726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_015572	TGT	2	6	2094731	2094736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_015572	T	7	7	2094752	2094758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_015572	CGAG	2	8	2094807	2094814	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_015572	CAAA	2	8	2094824	2094831	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4525	NC_015572	ATT	2	6	2094880	2094885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_015572	AGG	2	6	2094975	2094980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_015572	GAC	2	6	2095352	2095357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_015572	GGT	2	6	2095370	2095375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_015572	ATTG	2	8	2095433	2095440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_015572	T	6	6	2095485	2095490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_015572	TTCGG	2	10	2095503	2095512	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4532	NC_015572	A	6	6	2095533	2095538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_015572	T	6	6	2095623	2095628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_015572	ATTA	2	8	2100764	2100771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_015572	GATA	2	8	2100822	2100829	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_015572	GAC	2	6	2100862	2100867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_015572	ATTCA	2	10	2106828	2106837	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4538	NC_015572	TTTTC	2	10	2106871	2106880	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4539	NC_015572	T	6	6	2106909	2106914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_015572	GGCA	2	8	2109393	2109400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4541	NC_015572	GCG	2	6	2114814	2114819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_015572	T	7	7	2114838	2114844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_015572	AT	3	6	2114890	2114895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_015572	GCGTAA	2	12	2114935	2114946	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4545	NC_015572	T	6	6	2114957	2114962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_015572	CCA	2	6	2116252	2116257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4547	NC_015572	CATC	2	8	2117326	2117333	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_015572	TCAA	2	8	2117367	2117374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_015572	TCT	2	6	2117376	2117381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_015572	TGCT	2	8	2117540	2117547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4551	NC_015572	AACT	2	8	2117626	2117633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4552	NC_015572	AGCCAA	2	12	2117647	2117658	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_015572	ATT	2	6	2117773	2117778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_015572	GAT	2	6	2117845	2117850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_015572	ATT	2	6	2117952	2117957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_015572	T	6	6	2117968	2117973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_015572	GATTG	2	10	2117985	2117994	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_015572	T	6	6	2118026	2118031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_015572	TTTG	2	8	2118086	2118093	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_015572	TTA	2	6	2118109	2118114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_015572	G	6	6	2118115	2118120	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_015572	A	6	6	2118126	2118131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_015572	TGG	2	6	2118168	2118173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_015572	GTAA	2	8	2118177	2118184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_015572	CATA	2	8	2118189	2118196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4566	NC_015572	ATT	2	6	2118197	2118202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_015572	AAT	2	6	2118241	2118246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_015572	GATG	2	8	2121659	2121666	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_015572	TCC	2	6	2121729	2121734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4570	NC_015572	ATT	2	6	2125949	2125954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_015572	T	6	6	2125957	2125962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_015572	AT	3	6	2125963	2125968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_015572	ATT	2	6	2126004	2126009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_015572	T	6	6	2126008	2126013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_015572	A	7	7	2126017	2126023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_015572	CG	3	6	2126082	2126087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_015572	AG	3	6	2130539	2130544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_015572	C	7	7	2130639	2130645	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4579	NC_015572	CAA	2	6	2130666	2130671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_015572	AGG	2	6	2130716	2130721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_015572	TAAGGG	2	12	2131649	2131660	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_015572	GAG	2	6	2131661	2131666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_015572	GGCA	2	8	2132295	2132302	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4584	NC_015572	GA	4	8	2132394	2132401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_015572	T	6	6	2132465	2132470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_015572	A	6	6	2136741	2136746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_015572	ATCC	2	8	2136760	2136767	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_015572	CGC	2	6	2136862	2136867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_015572	CGGC	2	8	2137001	2137008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4590	NC_015572	TCA	2	6	2137035	2137040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_015572	GTG	2	6	2137139	2137144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_015572	GCC	2	6	2137231	2137236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4593	NC_015572	CGG	2	6	2137240	2137245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_015572	CCA	2	6	2137264	2137269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_015572	CGA	2	6	2137312	2137317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_015572	GCG	2	6	2137324	2137329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_015572	GCTG	2	8	2137410	2137417	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4598	NC_015572	TGC	2	6	2137424	2137429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_015572	CGC	3	9	2137467	2137475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4600	NC_015572	GC	3	6	2137489	2137494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4601	NC_015572	T	6	6	2137600	2137605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_015572	T	6	6	2139343	2139348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_015572	AAAT	2	8	2140193	2140200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_015572	CAC	2	6	2141165	2141170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4605	NC_015572	GA	3	6	2141237	2141242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_015572	GTT	2	6	2141251	2141256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_015572	TTAA	2	8	2141284	2141291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_015572	TTA	2	6	2142565	2142570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_015572	T	7	7	2142634	2142640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_015572	CAT	2	6	2143568	2143573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_015572	CCAA	2	8	2143609	2143616	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4612	NC_015572	GAC	2	6	2143628	2143633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_015572	TAT	2	6	2143635	2143640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_015572	GCT	2	6	2143658	2143663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_015572	AATTAC	2	12	2143747	2143758	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4616	NC_015572	A	7	7	2143999	2144005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_015572	TAAA	2	8	2144115	2144122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_015572	TCA	2	6	2144162	2144167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_015572	TCCGA	2	10	2144231	2144240	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4620	NC_015572	AAC	2	6	2144244	2144249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_015572	TCA	2	6	2144328	2144333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_015572	AAC	2	6	2145690	2145695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_015572	A	6	6	2145718	2145723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_015572	CGGA	2	8	2145783	2145790	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_015572	TA	4	8	2146884	2146891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_015572	TGC	2	6	2146943	2146948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_015572	A	6	6	2148485	2148490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_015572	TTC	2	6	2148571	2148576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_015572	AGC	2	6	2149123	2149128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_015572	GTTG	2	8	2149151	2149158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_015572	TAG	2	6	2149216	2149221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_015572	CACTC	2	10	2149286	2149295	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4633	NC_015572	GAC	2	6	2149310	2149315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_015572	TTC	2	6	2149332	2149337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4635	NC_015572	AGG	2	6	2150814	2150819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4768	NC_015572	CTA	2	6	2199780	2199785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4782	NC_015572	TTGAT	2	10	2201243	2201252	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4886	NC_015572	TGCTA	2	10	2245476	2245485	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4892	NC_015572	GGT	2	6	2245809	2245814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4894	NC_015572	GTTC	2	8	2249663	2249670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4896	NC_015572	CGC	2	6	2249720	2249725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4897	NC_015572	GCT	2	6	2249727	2249732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4898	NC_015572	GC	3	6	2249754	2249759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4899	NC_015572	CGC	2	6	2249772	2249777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4900	NC_015572	ATG	2	6	2250776	2250781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4901	NC_015572	ATT	2	6	2250828	2250833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4902	NC_015572	GCGTT	2	10	2250871	2250880	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4903	NC_015572	TTA	2	6	2251566	2251571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4904	NC_015572	TTC	2	6	2251957	2251962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4905	NC_015572	TTAA	2	8	2252030	2252037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4906	NC_015572	CG	3	6	2252051	2252056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4919	NC_015572	T	6	6	2258673	2258678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4920	NC_015572	G	7	7	2258697	2258703	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4927	NC_015572	AAGTTA	2	12	2262287	2262298	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4928	NC_015572	G	12	12	2264186	2264197	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4933	NC_015572	CGCC	2	8	2271315	2271322	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4934	NC_015572	ATACC	2	10	2271397	2271406	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4936	NC_015572	CTA	2	6	2271437	2271442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4938	NC_015572	A	6	6	2271454	2271459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4939	NC_015572	GC	3	6	2271536	2271541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4944	NC_015572	T	6	6	2272921	2272926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4945	NC_015572	GTT	2	6	2272952	2272957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4949	NC_015572	TAAG	2	8	2273636	2273643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4950	NC_015572	TAAAT	2	10	2273705	2273714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4994	NC_015572	AAGG	2	8	2312730	2312737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4995	NC_015572	G	6	6	2312851	2312856	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4996	NC_015572	GT	3	6	2313410	2313415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5000	NC_015572	T	7	7	2314654	2314660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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