MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Metallosphaera cuprina Ar-4 chromosome

Total Repeats: 4457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015435	CTT	2	6	580492	580497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_015435	TAC	2	6	580506	580511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_015435	TA	3	6	580564	580569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015435	TG	3	6	580587	580592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015435	CTAT	2	8	580615	580622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_015435	TCA	2	6	580677	580682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_015435	CAT	2	6	580758	580763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015435	AGGG	2	8	580795	580802	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015435	T	6	6	580805	580810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015435	TG	3	6	580991	580996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015435	GAA	2	6	581029	581034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015435	AT	3	6	581072	581077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015435	TTG	2	6	581111	581116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015435	GCT	2	6	581167	581172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_015435	AAATT	2	10	581231	581240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015435	GAA	2	6	581534	581539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015435	A	7	7	581552	581558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015435	AT	3	6	581591	581596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015435	GTATT	2	10	581612	581621	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015435	CTA	2	6	581629	581634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_015435	TGTA	2	8	581700	581707	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015435	TAA	2	6	581812	581817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015435	TAT	2	6	581879	581884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015435	CCGG	2	8	581934	581941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_015435	TGC	2	6	582488	582493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015435	GAA	2	6	583364	583369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015435	TA	3	6	583397	583402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015435	ATT	2	6	583403	583408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015435	TA	3	6	583414	583419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015435	ATT	2	6	583427	583432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015435	ATTA	2	8	583435	583442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015435	AT	3	6	583466	583471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015435	AAC	2	6	583482	583487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_015435	TAG	2	6	584818	584823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015435	TGG	2	6	585352	585357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015435	ATTG	2	8	585402	585409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015435	CTGC	2	8	585789	585796	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_015435	CCAG	2	8	585821	585828	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_015435	A	6	6	585870	585875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015435	GT	3	6	585918	585923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015435	TAAG	2	8	585975	585982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015435	TCA	2	6	586561	586566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_015435	GAA	2	6	589273	589278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015435	TAA	2	6	589301	589306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015435	AAGG	2	8	590960	590967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015435	ATA	2	6	591978	591983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015435	GAT	2	6	591990	591995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015435	T	6	6	591995	592000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015435	GTT	2	6	592015	592020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015435	TTG	2	6	592606	592611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015435	TTC	2	6	592626	592631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_015435	A	7	7	592736	592742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015435	GTT	2	6	596691	596696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015435	TATT	2	8	596707	596714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015435	GTT	2	6	597384	597389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015435	AAATC	2	10	597448	597457	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1057	NC_015435	TA	3	6	597498	597503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015435	CTTT	2	8	597519	597526	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_015435	ATA	2	6	597592	597597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015435	TA	3	6	597599	597604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015435	ATT	2	6	599143	599148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015435	A	6	6	599183	599188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015435	AAT	2	6	599731	599736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015435	TAA	2	6	600391	600396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015435	GTC	2	6	600476	600481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015435	TTA	2	6	600483	600488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015435	T	6	6	600507	600512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015435	CGT	2	6	600514	600519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_015435	ATT	2	6	600943	600948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015435	A	7	7	600967	600973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015435	TA	4	8	600983	600990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015435	TAT	2	6	601004	601009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015435	TGAACC	2	12	601413	601424	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_015435	TC	3	6	601433	601438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_015435	CAT	2	6	601596	601601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_015435	TC	3	6	602080	602085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_015435	AAC	2	6	602135	602140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_015435	CT	3	6	602149	602154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_015435	CAT	2	6	602184	602189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_015435	TTCA	2	8	602773	602780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_015435	TTAA	2	8	602806	602813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015435	ATG	2	6	602817	602822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015435	ATC	2	6	603299	603304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_015435	TTG	2	6	603351	603356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015435	TAAA	2	8	603411	603418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015435	TTG	2	6	603423	603428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015435	CTT	2	6	603432	603437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_015435	TCA	2	6	603468	603473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_015435	TA	4	8	603533	603540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015435	A	6	6	603540	603545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015435	TA	3	6	609607	609612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015435	AAT	2	6	609623	609628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015435	ATT	2	6	612563	612568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015435	CTTA	2	8	612577	612584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_015435	T	6	6	612587	612592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015435	GA	3	6	612609	612614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015435	TAT	2	6	612644	612649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015435	CAC	2	6	612693	612698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_015435	TTATT	2	10	613414	613423	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015435	T	8	8	613429	613436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015435	ATT	2	6	613464	613469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015435	T	7	7	614351	614357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015435	TAA	2	6	614407	614412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015435	TA	3	6	614419	614424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015435	ATT	2	6	615806	615811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015435	TTA	2	6	615813	615818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015435	GAGAGT	2	12	615829	615840	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015435	T	7	7	616944	616950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015435	TCGT	2	8	616962	616969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_015435	T	6	6	619270	619275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015435	TCG	2	6	619639	619644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_015435	CT	3	6	619670	619675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_015435	TA	3	6	619694	619699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015435	CAT	2	6	619733	619738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_015435	TGT	2	6	622067	622072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015435	ATT	2	6	622089	622094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015435	AT	3	6	622106	622111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015435	CTA	2	6	622214	622219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_015435	AGT	2	6	622262	622267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015435	GTC	2	6	622287	622292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_015435	TACTC	2	10	622300	622309	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1122	NC_015435	TTCAA	2	10	622396	622405	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1123	NC_015435	ATT	2	6	622416	622421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015435	CTT	2	6	622467	622472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_015435	CT	3	6	622484	622489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_015435	CGT	2	6	622509	622514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_015435	TC	3	6	622515	622520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_015435	TG	3	6	622759	622764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015435	CTC	2	6	623049	623054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_015435	AGA	2	6	623296	623301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015435	GAA	2	6	623302	623307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015435	TAT	2	6	623351	623356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_015435	AGG	2	6	623360	623365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015435	TAGA	2	8	623432	623439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015435	TTA	2	6	623442	623447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015435	AAT	2	6	623450	623455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_015435	TAA	2	6	623461	623466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_015435	TCT	2	6	623573	623578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_015435	CAG	2	6	623660	623665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_015435	TAA	2	6	623901	623906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_015435	AAT	2	6	623973	623978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1259	NC_015435	GA	3	6	661484	661489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1260	NC_015435	A	6	6	661528	661533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1261	NC_015435	AT	3	6	661544	661549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_015435	TTGC	2	8	661560	661567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1278	NC_015435	TTGT	2	8	671538	671545	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1279	NC_015435	GTA	2	6	671595	671600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1282	NC_015435	TAA	2	6	672121	672126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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