MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Metallosphaera cuprina Ar-4 chromosome

Total Repeats: 4457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015435	ATT	2	6	328065	328070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015435	TCTTT	2	10	333548	333557	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
503	NC_015435	CTA	2	6	333582	333587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_015435	AAAT	2	8	333641	333648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015435	GATT	2	8	333695	333702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015435	TTA	2	6	333716	333721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015435	TGG	2	6	333785	333790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015435	CGG	2	6	333807	333812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_015435	AAG	2	6	333857	333862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015435	TAA	2	6	333890	333895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015435	AGA	2	6	333897	333902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015435	ACG	2	6	333953	333958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015435	AT	3	6	333971	333976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015435	GATA	2	8	334006	334013	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015435	TAT	2	6	334191	334196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015435	AT	3	6	334201	334206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015435	TA	3	6	334210	334215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015435	TATC	2	8	334227	334234	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_015435	AATATT	2	12	334235	334246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015435	CT	3	6	334283	334288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_015435	AGA	2	6	334289	334294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015435	AC	3	6	334422	334427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_015435	GATCAC	2	12	334483	334494	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015435	CT	3	6	334512	334517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_015435	AT	3	6	334527	334532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015435	AGTA	2	8	334566	334573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015435	AGA	2	6	334654	334659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015435	A	6	6	334681	334686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015435	ACC	2	6	339261	339266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_015435	CCA	2	6	339272	339277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_015435	CTA	2	6	339293	339298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_015435	AGTA	2	8	339313	339320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015435	ATT	2	6	339496	339501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015435	GAA	2	6	345257	345262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015435	A	6	6	345274	345279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015435	TA	3	6	347447	347452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015435	A	6	6	347457	347462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015435	TAT	2	6	348249	348254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015435	T	6	6	348258	348263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015435	ATT	2	6	348293	348298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015435	CT	3	6	348319	348324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_015435	ATT	2	6	348344	348349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015435	A	6	6	348352	348357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015435	TAAAA	2	10	348726	348735	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015435	ATT	2	6	349899	349904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015435	GAA	2	6	351684	351689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015435	TTTC	2	8	352365	352372	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_015435	AT	3	6	352414	352419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015435	A	7	7	352436	352442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015435	TTA	2	6	352478	352483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015435	ATC	2	6	354617	354622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_015435	TAT	2	6	354653	354658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015435	AGG	2	6	354693	354698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015435	CCG	2	6	354704	354709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_015435	ATT	2	6	358937	358942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015435	TAA	2	6	359033	359038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015435	AAC	2	6	359108	359113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_015435	ATT	2	6	359162	359167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015435	TTA	2	6	359173	359178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015435	TC	3	6	362247	362252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_015435	TGA	2	6	362267	362272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015435	A	6	6	362282	362287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015435	TGT	2	6	362314	362319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015435	GA	3	6	367170	367175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015435	CTTCAG	2	12	367210	367221	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_015435	CGT	2	6	367246	367251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_015435	GA	3	6	367340	367345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015435	AAAG	2	8	370997	371004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015435	A	6	6	371978	371983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015435	TAA	2	6	372014	372019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015435	TAG	2	6	372053	372058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015435	ATT	2	6	372059	372064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015435	ACT	2	6	372080	372085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_015435	TA	3	6	374834	374839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015435	GAA	2	6	374847	374852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015435	CT	3	6	377932	377937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_015435	GTT	2	6	377958	377963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015435	CCT	2	6	378011	378016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_015435	T	6	6	378063	378068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015435	AAGG	2	8	378130	378137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015435	C	6	6	378169	378174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
582	NC_015435	TC	3	6	378235	378240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_015435	CTT	2	6	379759	379764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_015435	CTCG	2	8	379782	379789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
585	NC_015435	A	7	7	381859	381865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015435	TA	3	6	383115	383120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015435	TTC	2	6	387234	387239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_015435	ATA	2	6	387252	387257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015435	ATA	2	6	387262	387267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015435	TGCAA	2	10	389536	389545	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
591	NC_015435	ATA	2	6	389549	389554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015435	TCAG	2	8	389574	389581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
593	NC_015435	ATC	2	6	389609	389614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_015435	TC	3	6	389616	389621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_015435	GT	3	6	391051	391056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015435	GCC	2	6	391070	391075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_015435	CTC	2	6	391081	391086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_015435	CT	3	6	391126	391131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_015435	TAA	2	6	392067	392072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015435	CTCTC	2	10	392095	392104	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
601	NC_015435	CTC	2	6	392130	392135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_015435	CAT	2	6	392274	392279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_015435	AAG	2	6	392313	392318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015435	GTT	2	6	392373	392378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015435	TTA	2	6	392429	392434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015435	TAAA	2	8	395392	395399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015435	TGT	2	6	395745	395750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015435	TCG	2	6	397621	397626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_015435	CCT	2	6	398408	398413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_015435	ACC	2	6	402179	402184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_015435	A	6	6	402206	402211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015435	AGAGA	2	10	404862	404871	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015435	AGA	2	6	404941	404946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015435	GGA	2	6	404987	404992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015435	ACC	2	6	405000	405005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_015435	TGG	2	6	405013	405018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015435	CGG	2	6	405035	405040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_015435	TA	3	6	405088	405093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015435	TCA	2	6	405099	405104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_015435	ACA	2	6	409909	409914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_015435	CAA	2	6	409932	409937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_015435	TCT	2	6	409963	409968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_015435	TTGAG	2	10	409988	409997	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015435	A	6	6	410095	410100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015435	GAGCT	2	10	410150	410159	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
626	NC_015435	TGA	2	6	410467	410472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015435	AT	3	6	411144	411149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015435	ATTT	2	8	411151	411158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015435	TAA	2	6	411208	411213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015435	A	6	6	411212	411217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015435	CTGT	2	8	412542	412549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
632	NC_015435	GAA	2	6	412703	412708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015435	GTG	2	6	412790	412795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015435	CCT	2	6	412802	412807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_015435	AGC	2	6	414186	414191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015435	CCCCA	2	10	414467	414476	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
637	NC_015435	CCG	2	6	414533	414538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_015435	GGC	2	6	414684	414689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_015435	CTC	2	6	414695	414700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
640	NC_015435	CGGG	2	8	414759	414766	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
641	NC_015435	CGA	2	6	414858	414863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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643	NC_015435	GCC	2	6	415066	415071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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670	NC_015435	TCC	2	6	416581	416586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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762	NC_015435	ATA	2	6	451086	451091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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766	NC_015435	AAAT	2	8	451173	451180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
767	NC_015435	ATT	2	6	451184	451189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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773	NC_015435	CTC	2	6	451595	451600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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