MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 9995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015416	GAA	2	6	839125	839130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_015416	GGC	2	6	839151	839156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_015416	GC	3	6	839200	839205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_015416	GTGC	2	8	839231	839238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_015416	GTC	2	6	839240	839245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_015416	GTAG	2	8	839277	839284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_015416	GGA	2	6	839309	839314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015416	TCC	2	6	839397	839402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_015416	CGG	2	6	839439	839444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_015416	CCG	2	6	839507	839512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_015416	TCG	2	6	839513	839518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_015416	GAC	2	6	839521	839526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_015416	CAG	2	6	839527	839532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_015416	G	6	6	839541	839546	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_015416	AAC	2	6	839641	839646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_015416	AGC	2	6	839664	839669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_015416	TAG	2	6	839774	839779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015416	GTAGCA	2	12	839848	839859	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3019	NC_015416	TGA	2	6	840103	840108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_015416	GCTA	2	8	840214	840221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3021	NC_015416	GTG	2	6	840260	840265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_015416	TAA	2	6	840314	840319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015416	GGA	2	6	840404	840409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_015416	CGG	2	6	840422	840427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_015416	GTA	2	6	840455	840460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_015416	GGC	2	6	840476	840481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_015416	TAGG	2	8	840638	840645	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_015416	TAC	2	6	840692	840697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_015416	GCC	3	9	840707	840715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_015416	TGGG	2	8	840753	840760	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_015416	CAA	2	6	840823	840828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_015416	CT	3	6	840914	840919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_015416	GTC	2	6	840966	840971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_015416	GCA	2	6	841039	841044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_015416	GTT	2	6	841060	841065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_015416	CGT	2	6	841101	841106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_015416	GGTT	2	8	841156	841163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_015416	AGC	2	6	841227	841232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_015416	GT	3	6	841332	841337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_015416	CTA	2	6	841371	841376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_015416	GGC	2	6	841519	841524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_015416	AGA	2	6	841563	841568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015416	TTA	2	6	841653	841658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_015416	GCT	2	6	841766	841771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_015416	GGC	2	6	841785	841790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_015416	CGGA	2	8	841791	841798	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3047	NC_015416	CTTT	2	8	841819	841826	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_015416	T	7	7	841824	841830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_015416	TAT	2	6	841865	841870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_015416	CAT	2	6	841942	841947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_015416	TTC	2	6	841979	841984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_015416	TTCC	2	8	842010	842017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_015416	ATG	2	6	842031	842036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_015416	TTA	2	6	842335	842340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_015416	TGG	2	6	842352	842357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_015416	GCA	2	6	842383	842388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_015416	GCT	2	6	842400	842405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_015416	CGG	2	6	846994	846999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_015416	CGC	2	6	847040	847045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_015416	TAC	2	6	847056	847061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_015416	TAAAAA	2	12	847134	847145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_015416	CATTCG	2	12	849515	849526	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_015416	CGG	2	6	849596	849601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_015416	TCT	2	6	849971	849976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_015416	TCC	2	6	850006	850011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_015416	ATT	2	6	850115	850120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_015416	TA	3	6	850121	850126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_015416	TA	3	6	850150	850155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_015416	AT	3	6	850167	850172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_015416	TCA	2	6	850283	850288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_015416	A	6	6	851023	851028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_015416	GCT	2	6	851098	851103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_015416	TTA	2	6	853830	853835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_015416	AGA	2	6	853849	853854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_015416	GCA	2	6	854071	854076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_015416	T	7	7	854082	854088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_015416	TG	3	6	855226	855231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_015416	GGT	2	6	855235	855240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_015416	ATA	2	6	859315	859320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_015416	ATTT	2	8	859342	859349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_015416	TGG	2	6	859355	859360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_015416	A	6	6	859399	859404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_015416	TGC	2	6	859411	859416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_015416	GGA	2	6	859432	859437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_015416	AGG	2	6	859633	859638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015416	GAA	2	6	861238	861243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_015416	GCAATA	2	12	861246	861257	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3088	NC_015416	TGC	2	6	861305	861310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_015416	GCT	2	6	861312	861317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_015416	AG	4	8	861350	861357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_015416	GAA	2	6	861425	861430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_015416	TATCA	2	10	861431	861440	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3093	NC_015416	AT	3	6	861442	861447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_015416	CAATC	2	10	861450	861459	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3095	NC_015416	A	6	6	861555	861560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_015416	ATA	2	6	861586	861591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_015416	GAA	2	6	861641	861646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_015416	TGG	3	9	861682	861690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_015416	TGG	2	6	861697	861702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_015416	GCG	2	6	861754	861759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_015416	CAT	2	6	861776	861781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_015416	ATCT	2	8	861810	861817	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_015416	AAG	2	6	862383	862388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_015416	AT	3	6	862961	862966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_015416	CTT	2	6	862985	862990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_015416	GTT	2	6	863010	863015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_015416	AAC	2	6	863025	863030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_015416	TGC	2	6	863304	863309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_015416	GCCA	2	8	863317	863324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_015416	GGA	2	6	863556	863561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_015416	CGA	2	6	863601	863606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_015416	T	8	8	863792	863799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015416	ACG	2	6	863845	863850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_015416	CGATC	2	10	863877	863886	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3115	NC_015416	C	6	6	863906	863911	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3116	NC_015416	ATC	2	6	863929	863934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_015416	AC	3	6	863975	863980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_015416	CTAT	2	8	864008	864015	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_015416	TA	4	8	864024	864031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015416	AGA	2	6	864120	864125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_015416	GTT	2	6	864163	864168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015416	TC	3	6	864231	864236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_015416	GTT	2	6	865222	865227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_015416	TC	3	6	865290	865295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_015416	CTG	2	6	865341	865346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_015416	TCCC	2	8	866516	866523	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3127	NC_015416	CGA	2	6	866531	866536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_015416	GAA	2	6	866570	866575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_015416	TA	3	6	867743	867748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015416	GATT	2	8	867757	867764	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_015416	GAA	2	6	867815	867820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_015416	GACA	2	8	868743	868750	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3133	NC_015416	CA	3	6	868803	868808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3134	NC_015416	GCC	2	6	868818	868823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3135	NC_015416	T	6	6	868859	868864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_015416	TGC	2	6	869551	869556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3138	NC_015416	GGT	2	6	869581	869586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3142	NC_015416	TGA	2	6	871167	871172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3144	NC_015416	AG	3	6	871278	871283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3252	NC_015416	TTCA	2	8	923872	923879	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3253	NC_015416	ATG	2	6	923905	923910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3255	NC_015416	AGG	2	6	923986	923991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_015416	ATA	2	6	924379	924384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_015416	GCA	2	6	924463	924468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3260	NC_015416	AAGC	2	8	924641	924648	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3261	NC_015416	ATT	2	6	924680	924685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_015416	GTA	2	6	928166	928171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3264	NC_015416	GAA	2	6	928210	928215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_015416	T	7	7	928241	928247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3266	NC_015416	ATC	2	6	928255	928260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3268	NC_015416	GAT	2	6	928340	928345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3269	NC_015416	TAA	2	6	929460	929465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3403	NC_015416	GAC	2	6	977201	977206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3405	NC_015416	GCCC	2	8	977242	977249	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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3413	NC_015416	GCT	2	6	979352	979357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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