MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Micromonospora aurantiaca ATCC 27029 chromosome

Total Repeats: 19327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_014391	G	6	6	6887178	6887183	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19002	NC_014391	GCC	2	6	6887240	6887245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19003	NC_014391	GTC	2	6	6887256	6887261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19004	NC_014391	GCA	2	6	6887303	6887308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19005	NC_014391	GCCG	2	8	6887319	6887326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19006	NC_014391	CGG	2	6	6887330	6887335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19007	NC_014391	CGG	2	6	6888503	6888508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19008	NC_014391	GCGG	2	8	6888540	6888547	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19009	NC_014391	CCGG	2	8	6888548	6888555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19010	NC_014391	ACC	2	6	6888556	6888561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19011	NC_014391	GACG	2	8	6888608	6888615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19012	NC_014391	GTAC	2	8	6889566	6889573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19013	NC_014391	TCG	2	6	6889594	6889599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19014	NC_014391	GCC	2	6	6889636	6889641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19015	NC_014391	AGGG	2	8	6889649	6889656	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_014391	GGAACG	2	12	6891322	6891333	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19017	NC_014391	GGCG	2	8	6891334	6891341	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19018	NC_014391	CGCC	2	8	6891350	6891357	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19019	NC_014391	TCC	2	6	6894345	6894350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19020	NC_014391	GC	3	6	6894415	6894420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19021	NC_014391	CCGG	2	8	6894503	6894510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19022	NC_014391	CGC	2	6	6894541	6894546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19023	NC_014391	GGGC	2	8	6894549	6894556	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19024	NC_014391	GAA	2	6	6894562	6894567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19025	NC_014391	CCG	2	6	6894662	6894667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19026	NC_014391	TCG	2	6	6894748	6894753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19027	NC_014391	GAG	2	6	6900388	6900393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19028	NC_014391	CGCC	2	8	6903833	6903840	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19029	NC_014391	GGT	2	6	6903922	6903927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19030	NC_014391	ACG	2	6	6903928	6903933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19031	NC_014391	TCG	2	6	6904991	6904996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19032	NC_014391	CGGT	2	8	6905098	6905105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19033	NC_014391	CGGG	2	8	6908265	6908272	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19034	NC_014391	CGGAA	2	10	6908279	6908288	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19035	NC_014391	ACG	2	6	6908294	6908299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19036	NC_014391	GCCGG	2	10	6908352	6908361	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19037	NC_014391	CA	3	6	6908756	6908761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19038	NC_014391	TGG	2	6	6908795	6908800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_014391	CGGT	2	8	6909332	6909339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19040	NC_014391	CTT	2	6	6911888	6911893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19041	NC_014391	CCT	2	6	6911919	6911924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19042	NC_014391	TTCG	2	8	6913215	6913222	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19043	NC_014391	CTC	2	6	6913268	6913273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19044	NC_014391	AAG	2	6	6913320	6913325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19045	NC_014391	CATC	2	8	6914280	6914287	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19046	NC_014391	CCGGG	2	10	6914381	6914390	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19047	NC_014391	GGA	2	6	6914458	6914463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19050	NC_014391	GCC	2	6	6921071	6921076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19051	NC_014391	AGC	2	6	6921079	6921084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19052	NC_014391	CG	3	6	6924051	6924056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19053	NC_014391	GGCG	2	8	6924367	6924374	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19054	NC_014391	CTC	2	6	6924919	6924924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19055	NC_014391	GACC	2	8	6924980	6924987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19056	NC_014391	CGC	2	6	6925061	6925066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19057	NC_014391	CGG	3	9	6925068	6925076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19058	NC_014391	GC	3	6	6925095	6925100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19059	NC_014391	GGT	2	6	6925138	6925143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19060	NC_014391	CAC	2	6	6927174	6927179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19061	NC_014391	CCG	2	6	6928220	6928225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19062	NC_014391	GGCCG	2	10	6928266	6928275	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19063	NC_014391	CG	3	6	6929563	6929568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19064	NC_014391	CCA	2	6	6929580	6929585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19065	NC_014391	CCG	2	6	6929596	6929601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19066	NC_014391	C	6	6	6930996	6931001	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19067	NC_014391	G	6	6	6931038	6931043	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19068	NC_014391	CGGG	2	8	6931076	6931083	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19069	NC_014391	CCCG	2	8	6931089	6931096	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19070	NC_014391	GTCCTG	2	12	6931128	6931139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19074	NC_014391	CGG	2	6	6935262	6935267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19077	NC_014391	AAG	2	6	6937489	6937494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19079	NC_014391	CGG	2	6	6937529	6937534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19080	NC_014391	GA	3	6	6937589	6937594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19081	NC_014391	GCCG	2	8	6938416	6938423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19082	NC_014391	CCG	2	6	6938441	6938446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19083	NC_014391	ACCG	2	8	6938448	6938455	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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19092	NC_014391	CGGG	2	8	6941369	6941376	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19093	NC_014391	CTCC	2	8	6941757	6941764	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19094	NC_014391	GCCGT	2	10	6941810	6941819	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19095	NC_014391	GCC	2	6	6942281	6942286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19110	NC_014391	AC	3	6	6947704	6947709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19111	NC_014391	GCC	2	6	6947736	6947741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19112	NC_014391	GGCGT	4	20	6947753	6947772	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19113	NC_014391	GGTAC	2	10	6948623	6948632	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19114	NC_014391	TCCG	2	8	6951320	6951327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19115	NC_014391	CG	3	6	6951367	6951372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19116	NC_014391	CGGC	2	8	6952259	6952266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19117	NC_014391	CGC	2	6	6952334	6952339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19119	NC_014391	CCG	2	6	6952377	6952382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19121	NC_014391	CCG	2	6	6952443	6952448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19122	NC_014391	GTG	2	6	6952451	6952456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19123	NC_014391	ATC	2	6	6952502	6952507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19124	NC_014391	GCCG	2	8	6952517	6952524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19125	NC_014391	GGCC	2	8	6952525	6952532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19126	NC_014391	GTGG	3	12	6952536	6952547	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19127	NC_014391	GCGG	2	8	6952571	6952578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19128	NC_014391	GGC	2	6	6952598	6952603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.