MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 6778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014212	TA	3	6	1638703	1638708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_014212	A	6	6	1641055	1641060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_014212	AT	3	6	1642015	1642020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_014212	CCT	2	6	1642068	1642073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_014212	TTTGA	2	10	1643334	1643343	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_014212	AGA	2	6	1643354	1643359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_014212	GTCC	2	8	1644392	1644399	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_014212	G	7	7	1644437	1644443	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_014212	GAT	2	6	1647477	1647482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_014212	TCGG	2	8	1647501	1647508	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_014212	CTG	2	6	1647515	1647520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_014212	GCG	2	6	1647531	1647536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_014212	CCG	2	6	1647550	1647555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_014212	ACCAAA	2	12	1647599	1647610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_014212	GGC	2	6	1647721	1647726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_014212	TTG	2	6	1652145	1652150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_014212	G	7	7	1652185	1652191	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_014212	CCG	2	6	1652269	1652274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_014212	GCG	2	6	1652284	1652289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_014212	CGC	2	6	1652803	1652808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_014212	TAGA	2	8	1652809	1652816	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_014212	GTA	2	6	1654307	1654312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_014212	CT	4	8	1655797	1655804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_014212	CCG	2	6	1658511	1658516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_014212	CGG	2	6	1658537	1658542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_014212	GAG	2	6	1658585	1658590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_014212	ACC	2	6	1660034	1660039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_014212	TTAG	2	8	1660146	1660153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_014212	TC	3	6	1661901	1661906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_014212	GCT	2	6	1661910	1661915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_014212	CGG	2	6	1662522	1662527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_014212	GGA	2	6	1663797	1663802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_014212	CTG	2	6	1664930	1664935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_014212	GGA	2	6	1666077	1666082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_014212	GGT	2	6	1667874	1667879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_014212	A	7	7	1667957	1667963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3540	NC_014212	TTTTC	2	10	1670665	1670674	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3541	NC_014212	CGG	2	6	1670826	1670831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_014212	GCCG	2	8	1670853	1670860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_014212	CTCG	2	8	1674447	1674454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_014212	A	7	7	1674458	1674464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_014212	CTG	2	6	1675337	1675342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3547	NC_014212	GGT	2	6	1675350	1675355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_014212	A	6	6	1686134	1686139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_014212	TG	3	6	1686140	1686145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_014212	GGAG	2	8	1686148	1686155	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_014212	GTT	2	6	1686192	1686197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3553	NC_014212	TGT	2	6	1686509	1686514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_014212	TCC	2	6	1686520	1686525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3557	NC_014212	CCAG	2	8	1686647	1686654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3559	NC_014212	CCCT	2	8	1686733	1686740	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3560	NC_014212	C	6	6	1686749	1686754	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3561	NC_014212	ACC	2	6	1686770	1686775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_014212	CCCAC	2	10	1686883	1686892	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3563	NC_014212	C	6	6	1686938	1686943	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3564	NC_014212	TCC	2	6	1686966	1686971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_014212	CTT	2	6	1686979	1686984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_014212	CGT	2	6	1686990	1686995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_014212	GACG	2	8	1687026	1687033	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3568	NC_014212	GCCT	2	8	1687063	1687070	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_014212	CCT	2	6	1687127	1687132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_014212	AGT	2	6	1687148	1687153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3572	NC_014212	TAG	2	6	1687396	1687401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_014212	GATGG	2	10	1687543	1687552	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_014212	TGA	2	6	1687562	1687567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3583	NC_014212	TGG	2	6	1687854	1687859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3587	NC_014212	GAGG	2	8	1687998	1688005	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_014212	GCC	2	6	1688067	1688072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_014212	TGCA	2	8	1689423	1689430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3590	NC_014212	CTGT	2	8	1689438	1689445	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3591	NC_014212	CGA	2	6	1689488	1689493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_014212	TAT	2	6	1690094	1690099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_014212	GCT	2	6	1690253	1690258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_014212	TTG	2	6	1690266	1690271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_014212	CAGTCG	2	12	1691389	1691400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_014212	AG	3	6	1694655	1694660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_014212	C	6	6	1694674	1694679	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3598	NC_014212	G	6	6	1694692	1694697	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_014212	AGG	2	6	1697528	1697533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_014212	CTC	2	6	1699945	1699950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_014212	CA	3	6	1699955	1699960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_014212	GAA	2	6	1699961	1699966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_014212	CAACTG	2	12	1699975	1699986	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_014212	AT	3	6	1699999	1700004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_014212	AGTC	2	8	1700007	1700014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3606	NC_014212	CCT	2	6	1700172	1700177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_014212	AAAG	2	8	1700268	1700275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_014212	GCT	2	6	1700346	1700351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_014212	CCT	2	6	1701898	1701903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_014212	T	6	6	1701926	1701931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_014212	AGG	2	6	1701935	1701940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_014212	G	6	6	1702030	1702035	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_014212	CCG	2	6	1703963	1703968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_014212	A	6	6	1705762	1705767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_014212	G	6	6	1705774	1705779	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_014212	C	6	6	1705787	1705792	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3617	NC_014212	CAAT	2	8	1705797	1705804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_014212	CTT	2	6	1706505	1706510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_014212	AAACC	2	10	1706522	1706531	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3620	NC_014212	CCT	2	6	1708045	1708050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3623	NC_014212	T	6	6	1713093	1713098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_014212	CGG	2	6	1713720	1713725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_014212	GCA	2	6	1713801	1713806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_014212	CTTCG	2	10	1713833	1713842	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3627	NC_014212	ACCA	2	8	1714780	1714787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_014212	TTC	2	6	1717474	1717479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_014212	GGTG	2	8	1717491	1717498	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_014212	CAA	2	6	1719210	1719215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3632	NC_014212	TCGG	2	8	1719949	1719956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3898	NC_014212	TG	3	6	1860940	1860945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3996	NC_014212	GCTC	2	8	1918652	1918659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3997	NC_014212	TA	3	6	1918713	1918718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_014212	CCCG	2	8	1918722	1918729	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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4000	NC_014212	G	6	6	1918806	1918811	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

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