MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 6778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014212	CAACTG	2	12	1145985	1145996	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_014212	GAG	2	6	1146084	1146089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_014212	GCC	2	6	1146090	1146095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_014212	TGGA	2	8	1146100	1146107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_014212	ACC	2	6	1146168	1146173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_014212	GGC	2	6	1146317	1146322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_014212	TGGC	2	8	1146382	1146389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2508	NC_014212	CG	3	6	1146422	1146427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2509	NC_014212	CTT	2	6	1146453	1146458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_014212	GACA	2	8	1146575	1146582	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2511	NC_014212	ATG	2	6	1146601	1146606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_014212	AAG	2	6	1146625	1146630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_014212	CTC	2	6	1146642	1146647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2514	NC_014212	CCT	2	6	1147735	1147740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_014212	GCT	2	6	1149387	1149392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_014212	CGG	2	6	1150989	1150994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_014212	CCG	2	6	1150997	1151002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_014212	TAAGC	2	10	1151019	1151028	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2519	NC_014212	ATC	2	6	1151468	1151473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_014212	GCTCCC	2	12	1151804	1151815	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2521	NC_014212	TGCT	2	8	1151864	1151871	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2522	NC_014212	CCT	2	6	1151978	1151983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2523	NC_014212	CCT	2	6	1160402	1160407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2524	NC_014212	TCC	2	6	1161810	1161815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2525	NC_014212	AGAC	2	8	1161855	1161862	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2526	NC_014212	T	6	6	1161884	1161889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_014212	CACCG	2	10	1161998	1162007	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2528	NC_014212	GTG	2	6	1162020	1162025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_014212	CTC	2	6	1163223	1163228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_014212	ACG	2	6	1163240	1163245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_014212	C	6	6	1163304	1163309	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2532	NC_014212	TGC	2	6	1163311	1163316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_014212	CGG	2	6	1163420	1163425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_014212	AGCG	2	8	1164212	1164219	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2535	NC_014212	CAC	2	6	1164223	1164228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2536	NC_014212	GGGC	2	8	1164234	1164241	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2537	NC_014212	TCC	2	6	1164682	1164687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2538	NC_014212	GTG	2	6	1164776	1164781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_014212	CTG	2	6	1164782	1164787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_014212	AGT	2	6	1164807	1164812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_014212	GAC	2	6	1164859	1164864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_014212	CAG	2	6	1164906	1164911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_014212	ACC	2	6	1164940	1164945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2544	NC_014212	TGA	2	6	1164951	1164956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_014212	GCAGTT	2	12	1165008	1165019	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2546	NC_014212	TTC	2	6	1165029	1165034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_014212	TG	3	6	1165035	1165040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_014212	AGG	2	6	1165043	1165048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_014212	GCC	2	6	1166161	1166166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_014212	CAA	2	6	1166187	1166192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_014212	TGGA	2	8	1166783	1166790	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_014212	CAA	2	6	1166793	1166798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_014212	TCT	2	6	1168853	1168858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_014212	AGG	2	6	1168981	1168986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_014212	GGT	2	6	1171462	1171467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_014212	TG	3	6	1171468	1171473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_014212	G	6	6	1171488	1171493	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_014212	CTGG	2	8	1171687	1171694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2559	NC_014212	TCG	2	6	1171728	1171733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_014212	GAA	2	6	1171742	1171747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_014212	CAA	2	6	1171759	1171764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_014212	ACCCT	2	10	1171797	1171806	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2563	NC_014212	GCC	2	6	1173491	1173496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2564	NC_014212	ATCCC	2	10	1173541	1173550	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2565	NC_014212	GAAGG	2	10	1173552	1173561	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_014212	CTCC	2	8	1173699	1173706	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2567	NC_014212	AAAT	2	8	1174503	1174510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_014212	ACT	2	6	1174512	1174517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_014212	GCGG	2	8	1175025	1175032	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2570	NC_014212	AGGA	2	8	1175036	1175043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_014212	GT	4	8	1175867	1175874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_014212	CTT	2	6	1176531	1176536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_014212	CAC	2	6	1181320	1181325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2574	NC_014212	GTG	2	6	1181326	1181331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_014212	GTG	2	6	1181349	1181354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_014212	GTT	2	6	1181358	1181363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_014212	T	7	7	1181362	1181368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_014212	CAC	2	6	1181396	1181401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2579	NC_014212	CAC	2	6	1181405	1181410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2580	NC_014212	ATTTC	2	10	1181416	1181425	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2581	NC_014212	CG	4	8	1181430	1181437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2582	NC_014212	T	7	7	1181438	1181444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_014212	C	6	6	1181457	1181462	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2584	NC_014212	TTAA	2	8	1181466	1181473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_014212	TAG	2	6	1181491	1181496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_014212	G	7	7	1181496	1181502	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_014212	TCT	2	6	1181523	1181528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_014212	GTG	2	6	1181546	1181551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_014212	GTG	2	6	1181555	1181560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_014212	A	6	6	1181591	1181596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_014212	CAC	2	6	1181601	1181606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2592	NC_014212	CAC	2	6	1181613	1181618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2593	NC_014212	CAC	2	6	1181624	1181629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2594	NC_014212	G	6	6	1181639	1181644	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_014212	TAGC	2	8	1182544	1182551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2596	NC_014212	GCG	2	6	1182561	1182566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_014212	GAG	2	6	1182578	1182583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_014212	A	6	6	1187127	1187132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_014212	CTC	2	6	1187133	1187138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2600	NC_014212	AGT	2	6	1187162	1187167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_014212	GCT	2	6	1187178	1187183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_014212	TGA	2	6	1187252	1187257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_014212	CCCGGA	2	12	1187273	1187284	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2604	NC_014212	ACC	2	6	1187325	1187330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2605	NC_014212	GATC	2	8	1187363	1187370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2606	NC_014212	T	6	6	1187379	1187384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_014212	CAA	2	6	1187412	1187417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_014212	GGT	2	6	1187437	1187442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_014212	AG	3	6	1187472	1187477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_014212	GC	3	6	1187492	1187497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2611	NC_014212	CGA	2	6	1187567	1187572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_014212	TTG	2	6	1187628	1187633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_014212	ACC	2	6	1187654	1187659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_014212	GGA	2	6	1187687	1187692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_014212	GCGA	2	8	1187701	1187708	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2616	NC_014212	GGT	2	6	1188882	1188887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_014212	AAAC	2	8	1188896	1188903	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2618	NC_014212	CTATA	2	10	1188920	1188929	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2619	NC_014212	AGG	2	6	1188984	1188989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_014212	CGT	2	6	1189324	1189329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_014212	GGT	2	6	1189354	1189359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_014212	ACC	2	6	1189373	1189378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2623	NC_014212	GCACC	2	10	1189426	1189435	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2624	NC_014212	GCA	2	6	1189444	1189449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_014212	GAGGTG	3	18	1189529	1189546	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_014212	AG	3	6	1189648	1189653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_014212	CTA	2	6	1189660	1189665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_014212	CGG	2	6	1189716	1189721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_014212	GGT	2	6	1189780	1189785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_014212	CGACG	2	10	1189819	1189828	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2631	NC_014212	CAC	2	6	1189847	1189852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2632	NC_014212	GAC	2	6	1191018	1191023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_014212	CGCA	2	8	1191027	1191034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2634	NC_014212	TCCAG	2	10	1209567	1209576	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2635	NC_014212	CTC	2	6	1209653	1209658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2636	NC_014212	CGA	2	6	1209767	1209772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2639	NC_014212	TCT	2	6	1209888	1209893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2640	NC_014212	T	6	6	1209910	1209915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2641	NC_014212	GCT	2	6	1209923	1209928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2644	NC_014212	CTC	2	6	1211113	1211118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2646	NC_014212	GAA	2	6	1211129	1211134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2650	NC_014212	CTC	2	6	1221090	1221095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2652	NC_014212	C	6	6	1221271	1221276	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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2657	NC_014212	G	7	7	1221454	1221460	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2664	NC_014212	CG	3	6	1221916	1221921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2665	NC_014212	GGC	2	6	1221933	1221938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2670	NC_014212	CTC	2	6	1222124	1222129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2672	NC_014212	G	6	6	1223397	1223402	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2673	NC_014212	TGG	2	6	1223408	1223413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2691	NC_014212	TGA	2	6	1234088	1234093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2702	NC_014212	ACC	2	6	1235935	1235940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2748	NC_014212	CGG	2	6	1243947	1243952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2750	NC_014212	GT	3	6	1243992	1243997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2751	NC_014212	CCT	2	6	1245278	1245283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2754	NC_014212	GTG	2	6	1248915	1248920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2755	NC_014212	ATCG	2	8	1248932	1248939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2756	NC_014212	CTC	2	6	1248947	1248952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2757	NC_014212	CTGG	2	8	1248964	1248971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2758	NC_014212	TTTAG	2	10	1249011	1249020	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2759	NC_014212	GA	3	6	1249021	1249026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2760	NC_014212	TCG	2	6	1250031	1250036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2761	NC_014212	G	6	6	1250190	1250195	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2763	NC_014212	CGG	2	6	1251393	1251398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2898	NC_014212	G	6	6	1316840	1316845	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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