MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 6778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014212	CCTTCT	2	12	649439	649450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_014212	TGGG	2	8	649526	649533	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_014212	CGG	2	6	649548	649553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_014212	CTT	2	6	653114	653119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_014212	GAGG	2	8	653128	653135	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014212	AGA	2	6	655558	655563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_014212	CTTC	2	8	655573	655580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_014212	CTT	2	6	655601	655606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_014212	GCT	2	6	655621	655626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_014212	CGA	2	6	657354	657359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_014212	CCT	2	6	657383	657388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_014212	CCT	2	6	658682	658687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_014212	GGA	2	6	659907	659912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014212	ACG	2	6	659996	660001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_014212	GCCTTT	2	12	660019	660030	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_014212	AC	3	6	661016	661021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_014212	AGG	2	6	661772	661777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014212	GTG	2	6	662439	662444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_014212	GCC	2	6	662472	662477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_014212	TGC	2	6	662503	662508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_014212	TGGG	2	8	662527	662534	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_014212	TGC	2	6	662548	662553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_014212	ACC	2	6	662565	662570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_014212	AG	4	8	662574	662581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_014212	GGT	2	6	663749	663754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_014212	CTCC	2	8	663794	663801	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1527	NC_014212	CTT	2	6	663807	663812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_014212	TCGC	2	8	663918	663925	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_014212	GCG	2	6	663945	663950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_014212	CGGGCG	2	12	663979	663990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_014212	C	6	6	664040	664045	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1532	NC_014212	ACCA	2	8	664117	664124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_014212	CTT	2	6	664128	664133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_014212	G	6	6	664174	664179	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_014212	GAG	2	6	664267	664272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_014212	AGCGG	2	10	664341	664350	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1537	NC_014212	CTG	2	6	664417	664422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_014212	GCC	2	6	664433	664438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_014212	CCG	2	6	664448	664453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_014212	CAGGCG	2	12	664459	664470	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_014212	CCT	2	6	664526	664531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_014212	GGA	2	6	664593	664598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_014212	CCG	2	6	664602	664607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_014212	GTG	2	6	664654	664659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_014212	GCT	2	6	664666	664671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_014212	A	6	6	664826	664831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_014212	ATC	2	6	664888	664893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_014212	CGCT	2	8	664958	664965	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_014212	GCC	2	6	665760	665765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_014212	GCCAC	2	10	665769	665778	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1551	NC_014212	GCG	2	6	665782	665787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_014212	CCT	2	6	665806	665811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_014212	GGT	2	6	667112	667117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_014212	ACC	2	6	670959	670964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_014212	GCT	2	6	673062	673067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_014212	CGGG	2	8	673232	673239	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_014212	C	6	6	678357	678362	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1558	NC_014212	G	6	6	678370	678375	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_014212	G	7	7	678378	678384	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_014212	CCCG	2	8	678395	678402	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1561	NC_014212	AGGGG	2	10	678413	678422	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_014212	CAC	2	6	678430	678435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_014212	ACTC	2	8	678480	678487	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_014212	GAG	2	6	678488	678493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_014212	GACC	2	8	680795	680802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_014212	CCGG	2	8	680862	680869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_014212	CGG	2	6	680978	680983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_014212	GCA	2	6	681010	681015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_014212	C	6	6	681018	681023	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1570	NC_014212	GCT	2	6	681077	681082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_014212	GGC	2	6	681093	681098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_014212	C	7	7	681908	681914	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1573	NC_014212	GAG	2	6	682002	682007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_014212	CGC	2	6	683175	683180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_014212	GCC	2	6	683184	683189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_014212	C	6	6	683198	683203	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1577	NC_014212	G	6	6	685411	685416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_014212	TCCC	2	8	685488	685495	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1579	NC_014212	CG	4	8	685496	685503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_014212	C	7	7	685516	685522	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1581	NC_014212	C	6	6	685525	685530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1582	NC_014212	G	6	6	685538	685543	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_014212	CTA	2	6	687154	687159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_014212	GCC	2	6	687285	687290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_014212	ACT	2	6	687402	687407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_014212	AGG	2	6	687423	687428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_014212	GAAG	2	8	687479	687486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_014212	GTCC	2	8	687519	687526	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_014212	ACG	2	6	687560	687565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_014212	GAA	2	6	687570	687575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_014212	GGA	2	6	687584	687589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_014212	G	6	6	687612	687617	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_014212	GGTGG	2	10	687662	687671	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_014212	AGG	2	6	687674	687679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_014212	CTGGAG	2	12	687769	687780	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1596	NC_014212	G	6	6	687809	687814	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_014212	GAGG	2	8	687822	687829	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_014212	GGTG	2	8	687884	687891	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_014212	CTGG	2	8	687909	687916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1600	NC_014212	TTG	2	6	687997	688002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_014212	CCT	2	6	688030	688035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_014212	GGA	2	6	688038	688043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_014212	ACA	2	6	688049	688054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_014212	TGG	2	6	688148	688153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_014212	GGT	2	6	688198	688203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_014212	AAG	2	6	688257	688262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_014212	ACCCC	2	10	688333	688342	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1608	NC_014212	T	6	6	693933	693938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_014212	G	6	6	698201	698206	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_014212	ACGGG	2	10	698255	698264	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1611	NC_014212	CAAA	2	8	698286	698293	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1612	NC_014212	GGCCAG	2	12	698324	698335	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_014212	GCC	2	6	698337	698342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_014212	CAAA	2	8	698363	698370	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1615	NC_014212	CAAC	2	8	698390	698397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_014212	GAG	2	6	698405	698410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_014212	CAAA	2	8	698440	698447	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_014212	CGG	2	6	698471	698476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_014212	CAAA	2	8	698517	698524	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_014212	CAA	2	6	698544	698549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_014212	TCC	2	6	698552	698557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_014212	A	7	7	698573	698579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_014212	CAAA	2	8	698589	698596	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_014212	CGT	2	6	698619	698624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_014212	CAAA	2	8	698665	698672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_014212	GAAGT	2	10	698708	698717	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_014212	TA	3	6	698726	698731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_014212	CAAA	2	8	698739	698746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_014212	CAA	2	6	698766	698771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_014212	GT	3	6	698807	698812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_014212	CAAA	2	8	698815	698822	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_014212	CAAA	2	8	698888	698895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_014212	TCG	2	6	698945	698950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_014212	CAAA	2	8	698964	698971	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1635	NC_014212	AAG	2	6	699075	699080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_014212	CAAA	2	8	699116	699123	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1638	NC_014212	AGG	2	6	700670	700675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1807	NC_014212	CTT	2	6	805179	805184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1808	NC_014212	CCG	2	6	805269	805274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1905	NC_014212	CCT	2	6	859110	859115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1906	NC_014212	CGG	2	6	859138	859143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1907	NC_014212	CGG	2	6	860379	860384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1908	NC_014212	GTCA	2	8	862056	862063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1910	NC_014212	AT	3	6	863874	863879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1911	NC_014212	CTT	2	6	864457	864462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1912	NC_014212	CTCC	2	8	864468	864475	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1913	NC_014212	CTT	2	6	864491	864496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1914	NC_014212	GTT	2	6	865230	865235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1915	NC_014212	GT	3	6	865466	865471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1926	NC_014212	CCT	2	6	869267	869272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1930	NC_014212	GTTC	2	8	871829	871836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1933	NC_014212	CT	3	6	873336	873341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1934	NC_014212	TGA	2	6	874746	874751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1937	NC_014212	CGCC	2	8	879136	879143	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1938	NC_014212	GA	3	6	879168	879173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1942	NC_014212	ATGC	2	8	879274	879281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1943	NC_014212	CGGA	2	8	879302	879309	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1944	NC_014212	CGC	2	6	879324	879329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1945	NC_014212	CGC	2	6	879351	879356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1946	NC_014212	TGC	2	6	879379	879384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1947	NC_014212	CTT	2	6	879412	879417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1948	NC_014212	CGC	2	6	879419	879424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1949	NC_014212	CGG	2	6	879459	879464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1950	NC_014212	AAG	2	6	879468	879473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1951	NC_014212	GTC	2	6	879490	879495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1953	NC_014212	AGT	3	9	879580	879588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1955	NC_014212	GAC	2	6	881946	881951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1959	NC_014212	CCT	2	6	882088	882093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2000	NC_014212	AAAG	2	8	906759	906766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

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