MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Moraxella catarrhalis RH4 chromosome

Total Repeats: 6089

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014147	AAG	2	6	105	110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014147	CAT	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014147	A	6	6	220	225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014147	TGA	2	6	454	459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014147	ATA	2	6	519	524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014147	T	6	6	535	540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014147	AATT	2	8	549	556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014147	TTAAAT	2	12	563	574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014147	T	6	6	593	598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014147	T	6	6	616	621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014147	TAA	2	6	625	630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014147	TGA	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014147	GCC	2	6	688	693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_014147	TTA	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014147	CTTAAA	2	12	706	717	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014147	TAA	4	12	720	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014147	A	7	7	735	741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014147	ATT	2	6	761	766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014147	ATT	2	6	856	861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014147	TAA	2	6	895	900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014147	T	6	6	973	978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014147	CAAC	2	8	2408	2415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014147	A	8	8	4851	4858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014147	T	7	7	4876	4882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014147	AAT	2	6	4886	4891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014147	TG	3	6	7454	7459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014147	A	6	6	7511	7516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014147	TTGAT	2	10	7545	7554	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014147	A	6	6	9216	9221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014147	TCA	3	9	9234	9242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014147	A	6	6	10531	10536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014147	T	6	6	10557	10562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014147	A	6	6	10576	10581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014147	AGAC	2	8	10584	10591	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014147	ATT	2	6	10690	10695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014147	CCA	2	6	10736	10741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014147	TAA	2	6	11682	11687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014147	AAGC	2	8	11692	11699	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014147	T	6	6	11700	11705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014147	A	6	6	11751	11756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014147	ATAA	2	8	12972	12979	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014147	GATG	2	8	13047	13054	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014147	TGG	3	9	13098	13106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014147	CAG	2	6	13133	13138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014147	CAA	2	6	13156	13161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014147	CGC	2	6	13208	13213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014147	TTG	2	6	13241	13246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014147	T	6	6	13249	13254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014147	TATT	2	8	13327	13334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014147	TTTG	2	8	13338	13345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014147	ATG	2	6	13357	13362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014147	AAT	2	6	15948	15953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014147	TGAC	2	8	15983	15990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014147	AGC	2	6	16075	16080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014147	ATT	2	6	16104	16109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014147	TAT	2	6	16115	16120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014147	TTGA	2	8	16237	16244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014147	TTG	2	6	18180	18185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014147	GATG	2	8	18186	18193	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014147	TGT	2	6	20198	20203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014147	TAA	2	6	20233	20238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014147	ATG	2	6	21743	21748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014147	TAAT	2	8	21773	21780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014147	TAAT	2	8	21790	21797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014147	AAT	3	9	21795	21803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014147	GAT	2	6	21813	21818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014147	ATG	2	6	23657	23662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014147	ATA	2	6	23684	23689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014147	ATC	2	6	24570	24575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014147	ATG	2	6	24597	24602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014147	AT	3	6	24603	24608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014147	AGATA	2	10	24921	24930	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014147	CAT	2	6	25003	25008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014147	CAA	2	6	25031	25036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014147	ATT	2	6	26968	26973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014147	ATT	2	6	26985	26990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014147	ATTTA	2	10	27012	27021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014147	TAC	2	6	27025	27030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014147	ATT	2	6	27076	27081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014147	T	6	6	27086	27091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014147	A	6	6	27093	27098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014147	TTTAT	2	10	27099	27108	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014147	AATA	2	8	27129	27136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014147	GAA	2	6	27990	27995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014147	CAAGC	2	10	27996	28005	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014147	AAT	2	6	28046	28051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014147	CCAC	2	8	28065	28072	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_014147	CGTG	2	8	28124	28131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014147	GAA	2	6	28230	28235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014147	CTA	2	6	28237	28242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014147	TTTC	2	8	28442	28449	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014147	TGCT	2	8	28601	28608	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014147	GCT	2	6	28718	28723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014147	GAA	2	6	28770	28775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014147	GAA	2	6	28777	28782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014147	GCC	2	6	28833	28838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014147	GT	5	10	28854	28863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014147	AATTT	2	10	28903	28912	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014147	TGGC	2	8	29076	29083	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014147	GTT	2	6	29133	29138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014147	CAAA	2	8	29146	29153	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014147	GTG	2	6	29253	29258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014147	TA	3	6	29262	29267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014147	AGTA	2	8	29269	29276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014147	TTA	2	6	29513	29518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014147	GAA	2	6	29671	29676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014147	CCA	2	6	30165	30170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014147	A	7	7	30240	30246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014147	GTG	2	6	30289	30294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014147	GAA	2	6	30453	30458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014147	GAT	2	6	30460	30465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014147	GAA	2	6	30513	30518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014147	CCA	2	6	30519	30524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_014147	T	6	6	30606	30611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014147	T	6	6	30650	30655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014147	TGA	2	6	30776	30781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014147	GAA	2	6	30814	30819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014147	GAA	2	6	30874	30879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014147	GTG	2	6	30944	30949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014147	ATA	2	6	31015	31020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014147	A	7	7	31115	31121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014147	ATG	2	6	31251	31256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014147	ATG	2	6	35817	35822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014147	TAGGG	2	10	37236	37245	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014147	ATCAA	2	10	39857	39866	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014147	T	6	6	39936	39941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014147	TAA	2	6	39945	39950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014147	GAT	2	6	40259	40264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014147	A	6	6	41098	41103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014147	ATTG	2	8	41114	41121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014147	TAGG	2	8	42546	42553	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014147	TGG	2	6	42557	42562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014147	TAA	2	6	42582	42587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014147	GTGA	2	8	43122	43129	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014147	AAT	2	6	43139	43144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014147	AT	3	6	43158	43163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014147	ATG	2	6	43169	43174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014147	TGA	2	6	45291	45296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014147	GTT	2	6	45350	45355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014147	TGA	2	6	48575	48580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014147	GGTG	2	8	48590	48597	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014147	AATA	2	8	51257	51264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014147	CATA	2	8	51276	51283	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014147	GCA	2	6	51285	51290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014147	TGGC	2	8	51307	51314	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014147	T	7	7	51319	51325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014147	A	6	6	51338	51343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014147	TCA	2	6	51385	51390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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299	NC_014147	GT	3	6	107127	107132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_014147	CGG	2	6	107289	107294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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424	NC_014147	GAT	2	6	119126	119131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_014147	TTA	2	6	119229	119234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_014147	ATG	2	6	119246	119251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_014147	TTG	2	6	120489	120494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
431	NC_014147	TAAA	2	8	120517	120524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_014147	CAG	2	6	120529	120534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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435	NC_014147	TAA	2	6	125815	125820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_014147	ACC	2	6	125876	125881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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439	NC_014147	ATT	2	6	129997	130002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_014147	AAC	2	6	130023	130028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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444	NC_014147	TAA	2	6	132866	132871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_014147	AATA	2	8	133675	133682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_014147	A	6	6	136487	136492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_014147	ATGG	2	8	138973	138980	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
454	NC_014147	TTA	2	6	138991	138996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_014147	TTGG	2	8	139071	139078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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458	NC_014147	GCGT	2	8	139932	139939	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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461	NC_014147	TAT	3	9	140084	140092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_014147	TTA	2	6	140187	140192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_014147	TCA	2	6	140198	140203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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482	NC_014147	GTTT	2	8	144721	144728	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
483	NC_014147	TAT	2	6	144736	144741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_014147	CAT	2	6	145541	145546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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494	NC_014147	TGGT	2	8	145606	145613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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