MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 3078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014122	A	7	7	803687	803693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_014122	AGA	2	6	803727	803732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_014122	GAA	2	6	803746	803751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_014122	AAG	2	6	803769	803774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_014122	AAG	2	6	803780	803785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014122	AG	3	6	803791	803796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_014122	AGA	3	9	803799	803807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_014122	AAG	2	6	803810	803815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_014122	T	6	6	803835	803840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_014122	AAT	2	6	805588	805593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_014122	TTAG	2	8	805594	805601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_014122	AGT	2	6	805621	805626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_014122	TGAT	2	8	805643	805650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014122	TAA	2	6	805723	805728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_014122	T	6	6	805736	805741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_014122	ATA	2	6	805746	805751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014122	AGG	2	6	805771	805776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014122	ATA	2	6	806635	806640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_014122	T	6	6	806643	806648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_014122	ATA	2	6	806649	806654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_014122	ATA	2	6	808254	808259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_014122	TA	3	6	808275	808280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_014122	AAT	2	6	811520	811525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_014122	AT	3	6	811542	811547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_014122	A	7	7	813325	813331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_014122	TAAA	2	8	813346	813353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_014122	TGTT	2	8	813357	813364	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_014122	AG	3	6	820387	820392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_014122	AAG	2	6	820394	820399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_014122	TCT	2	6	820465	820470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_014122	TAA	2	6	820484	820489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_014122	TTA	2	6	820496	820501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_014122	TAT	2	6	820534	820539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_014122	AG	3	6	820546	820551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_014122	CAA	2	6	820562	820567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_014122	GAA	2	6	820602	820607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_014122	ATG	2	6	820691	820696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_014122	A	7	7	820743	820749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_014122	TAT	2	6	820822	820827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_014122	ATA	3	9	820848	820856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_014122	CTAA	2	8	820896	820903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_014122	AAG	2	6	820929	820934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_014122	TTCT	2	8	820936	820943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_014122	TGT	2	6	820993	820998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_014122	AAG	2	6	821060	821065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_014122	T	6	6	821066	821071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_014122	TATCCA	2	12	821138	821149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_014122	TAT	2	6	821155	821160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_014122	T	7	7	821249	821255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_014122	AAC	2	6	821349	821354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_014122	TTC	2	6	821394	821399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_014122	T	6	6	821418	821423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_014122	AT	4	8	821524	821531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_014122	AT	4	8	821540	821547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_014122	TTA	2	6	821597	821602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_014122	TC	3	6	821625	821630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_014122	TATT	2	8	821682	821689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_014122	GAA	2	6	821690	821695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_014122	ATTG	2	8	821741	821748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_014122	AGA	2	6	821758	821763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_014122	A	7	7	821768	821774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_014122	AGA	2	6	821782	821787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_014122	CT	3	6	821828	821833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_014122	TAA	2	6	821856	821861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_014122	ATA	2	6	821862	821867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_014122	GAA	2	6	821888	821893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_014122	A	6	6	821899	821904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_014122	TTA	2	6	821939	821944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_014122	AG	4	8	821954	821961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_014122	GAAA	2	8	821962	821969	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_014122	TAAA	2	8	821985	821992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_014122	TAA	2	6	822060	822065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_014122	A	6	6	822064	822069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_014122	TCT	2	6	822078	822083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_014122	ATT	2	6	822089	822094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_014122	ATA	2	6	822101	822106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_014122	A	7	7	822121	822127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_014122	ATT	2	6	822145	822150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_014122	AAAAT	2	10	822151	822160	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_014122	A	6	6	822998	823003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_014122	TAA	2	6	823041	823046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_014122	GGT	2	6	823065	823070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_014122	A	7	7	825819	825825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_014122	GAT	3	9	825829	825837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_014122	TGA	2	6	825858	825863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_014122	T	6	6	825883	825888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_014122	GTT	2	6	825903	825908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_014122	T	6	6	825923	825928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_014122	TTTAT	2	10	825935	825944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_014122	CTT	3	9	825950	825958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_014122	AAG	2	6	826061	826066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_014122	ATT	2	6	826073	826078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_014122	TCCC	2	8	826163	826170	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1594	NC_014122	GTT	2	6	826289	826294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_014122	AAGG	2	8	826326	826333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_014122	TTA	2	6	826397	826402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_014122	AC	3	6	826463	826468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_014122	AGA	2	6	826472	826477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_014122	TTC	2	6	826486	826491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_014122	CGT	2	6	826540	826545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_014122	CT	3	6	826677	826682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_014122	CAT	2	6	826698	826703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_014122	TAC	2	6	826735	826740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_014122	TA	3	6	826843	826848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_014122	AGGTT	2	10	826875	826884	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_014122	ATTT	2	8	826890	826897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_014122	CTTT	2	8	826929	826936	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_014122	TAAAA	2	10	826942	826951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_014122	AAAAT	2	10	826988	826997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_014122	A	6	6	827016	827021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_014122	A	6	6	827024	827029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_014122	AAT	2	6	827034	827039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_014122	TAA	2	6	827063	827068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_014122	A	6	6	827112	827117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_014122	ACA	2	6	827130	827135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_014122	AAAAAC	2	12	827143	827154	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1617	NC_014122	ATAA	2	8	827175	827182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_014122	ATTA	2	8	832550	832557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_014122	ATT	2	6	832573	832578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_014122	T	7	7	832577	832583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_014122	TTAG	2	8	832644	832651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_014122	CTA	2	6	832662	832667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_014122	AAG	2	6	832673	832678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_014122	GAA	2	6	832689	832694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_014122	TAA	2	6	832705	832710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_014122	CAAT	2	8	832739	832746	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_014122	CTAT	2	8	832814	832821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_014122	A	6	6	832829	832834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_014122	GGT	2	6	832880	832885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_014122	TTAGA	2	10	832894	832903	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_014122	TA	3	6	832917	832922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_014122	A	6	6	832945	832950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_014122	ACC	2	6	832967	832972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_014122	AGA	2	6	832987	832992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_014122	TA	4	8	833025	833032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_014122	TATT	2	8	834319	834326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_014122	GTTTTT	2	12	834359	834370	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_014122	T	6	6	834395	834400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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