MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 6385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013887	CACC	2	8	1117057	1117064	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4002	NC_013887	AGT	2	6	1117964	1117969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_013887	A	7	7	1117977	1117983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_013887	A	6	6	1117992	1117997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_013887	A	7	7	1120138	1120144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_013887	A	7	7	1120154	1120160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_013887	ACC	2	6	1122646	1122651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_013887	TCG	2	6	1122675	1122680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_013887	G	6	6	1122688	1122693	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_013887	CAA	2	6	1122709	1122714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_013887	CTTT	2	8	1122717	1122724	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_013887	AT	3	6	1122747	1122752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_013887	A	6	6	1122775	1122780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_013887	ATT	2	6	1122837	1122842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_013887	TAA	2	6	1122888	1122893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_013887	T	6	6	1122920	1122925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_013887	TA	3	6	1122931	1122936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_013887	AAAG	2	8	1123027	1123034	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_013887	GAT	2	6	1123056	1123061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_013887	AT	3	6	1123073	1123078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_013887	ATT	2	6	1123121	1123126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_013887	ATT	2	6	1123146	1123151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_013887	ATG	2	6	1123176	1123181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_013887	TAAA	2	8	1123237	1123244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_013887	TAA	2	6	1123262	1123267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_013887	A	8	8	1123273	1123280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_013887	AT	3	6	1123369	1123374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_013887	A	6	6	1123386	1123391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_013887	TTA	2	6	1123398	1123403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_013887	A	6	6	1123416	1123421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_013887	ATT	2	6	1123758	1123763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_013887	TCT	2	6	1123768	1123773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_013887	CT	3	6	1123772	1123777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_013887	TCT	2	6	1123805	1123810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_013887	CAA	2	6	1123816	1123821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_013887	TTC	2	6	1123831	1123836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_013887	TCA	2	6	1124152	1124157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4039	NC_013887	TAT	3	9	1124379	1124387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_013887	A	6	6	1124388	1124393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_013887	AAT	2	6	1124404	1124409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_013887	TTC	2	6	1124424	1124429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_013887	TCT	2	6	1124464	1124469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_013887	T	6	6	1124491	1124496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_013887	TAA	2	6	1124503	1124508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_013887	T	6	6	1124519	1124524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_013887	CT	3	6	1124533	1124538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_013887	TTC	2	6	1124542	1124547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_013887	ATCA	2	8	1124576	1124583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4050	NC_013887	GTTT	2	8	1124631	1124638	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_013887	T	6	6	1124636	1124641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_013887	AAT	2	6	1124657	1124662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_013887	AAAT	2	8	1124664	1124671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_013887	AGA	2	6	1124701	1124706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4056	NC_013887	T	6	6	1124832	1124837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_013887	TCT	2	6	1124857	1124862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_013887	T	7	7	1124870	1124876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_013887	CAT	2	6	1124935	1124940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4061	NC_013887	ATC	2	6	1124958	1124963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_013887	ATTC	2	8	1124971	1124978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4063	NC_013887	ATT	2	6	1124997	1125002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_013887	GATA	2	8	1125015	1125022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4066	NC_013887	TA	3	6	1125277	1125282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_013887	TAA	2	6	1125291	1125296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_013887	ATA	2	6	1125744	1125749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_013887	T	6	6	1126759	1126764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_013887	TA	4	8	1126949	1126956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_013887	A	7	7	1127889	1127895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4074	NC_013887	TAA	2	6	1127958	1127963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_013887	TA	3	6	1127970	1127975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_013887	CCA	3	9	1128060	1128068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4079	NC_013887	A	6	6	1128121	1128126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4081	NC_013887	TCA	2	6	1128212	1128217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4083	NC_013887	CAAT	2	8	1128581	1128588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4084	NC_013887	TAAAA	2	10	1128673	1128682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_013887	TAA	2	6	1128702	1128707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4087	NC_013887	GATG	2	8	1128757	1128764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_013887	TAAAA	2	10	1128773	1128782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_013887	TAA	2	6	1128794	1128799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_013887	ATT	2	6	1128857	1128862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_013887	AAT	2	6	1128870	1128875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_013887	AAT	2	6	1130351	1130356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_013887	T	6	6	1130368	1130373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4095	NC_013887	TAT	2	6	1130410	1130415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4097	NC_013887	AAT	4	12	1130502	1130513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_013887	TA	3	6	1130559	1130564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_013887	AT	3	6	1130573	1130578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_013887	ATT	2	6	1130580	1130585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_013887	ATT	2	6	1130616	1130621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_013887	ATA	2	6	1130646	1130651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_013887	TAAAT	2	10	1131999	1132008	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_013887	A	6	6	1132012	1132017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_013887	T	6	6	1132019	1132024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_013887	TAT	2	6	1132055	1132060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_013887	TTA	2	6	1132068	1132073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_013887	TA	3	6	1132532	1132537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_013887	TA	3	6	1132549	1132554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_013887	AT	3	6	1132559	1132564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_013887	CAT	2	6	1132579	1132584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4114	NC_013887	T	7	7	1133117	1133123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_013887	ATA	2	6	1133136	1133141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_013887	T	6	6	1133155	1133160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_013887	CTA	2	6	1133169	1133174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_013887	AT	3	6	1133181	1133186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_013887	TTA	2	6	1133193	1133198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4121	NC_013887	CTA	2	6	1133270	1133275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_013887	T	7	7	1133317	1133323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_013887	TG	3	6	1133365	1133370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4129	NC_013887	AAC	2	6	1133824	1133829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_013887	TTA	2	6	1133846	1133851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_013887	A	6	6	1133851	1133856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_013887	TC	3	6	1133880	1133885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_013887	A	6	6	1133927	1133932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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