MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 plasmid pMETVU01

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013408	C	7	7	59	65	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_013408	ATGT	2	8	73	80	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013408	ACC	2	6	105	110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013408	CTA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013408	CATA	2	8	181	188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013408	CCCTCC	2	12	197	208	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
7	NC_013408	AAC	2	6	228	233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013408	CCG	2	6	246	251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013408	AAG	2	6	263	268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013408	CCT	2	6	279	284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_013408	TCT	2	6	303	308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013408	CCCCCT	2	12	316	327	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
13	NC_013408	ATT	3	9	330	338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013408	AG	3	6	391	396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013408	CTA	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013408	ACCT	2	8	502	509	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013408	AC	3	6	519	524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013408	AAGG	2	8	546	553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013408	TAAT	2	8	599	606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013408	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_013408	GAA	2	6	668	673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013408	T	6	6	706	711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013408	T	6	6	713	718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013408	TA	4	8	727	734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013408	CCA	2	6	740	745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013408	GGT	2	6	754	759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013408	TGA	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013408	CCA	2	6	1497	1502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_013408	TTA	2	6	1530	1535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013408	AGT	2	6	1552	1557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013408	AGG	2	6	1652	1657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013408	CTC	2	6	2921	2926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013408	TTA	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013408	TAA	2	6	3019	3024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013408	CATA	2	8	3050	3057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013408	ACA	2	6	3058	3063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013408	TA	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013408	T	6	6	4024	4029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013408	CTTTT	2	10	4053	4062	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013408	AAGA	2	8	4117	4124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013408	TCC	2	6	4142	4147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013408	GCT	2	6	4164	4169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013408	ACCC	2	8	4210	4217	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_013408	AAG	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013408	T	6	6	4249	4254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013408	TG	3	6	4262	4267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013408	T	6	6	4283	4288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013408	ATTT	2	8	4328	4335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013408	CTA	2	6	4351	4356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013408	TC	3	6	4362	4367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013408	C	6	6	4380	4385	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_013408	T	6	6	4388	4393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013408	TAGTA	2	10	4405	4414	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013408	AT	3	6	4483	4488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013408	A	6	6	4498	4503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013408	TC	3	6	4697	4702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013408	AGTAA	2	10	4736	4745	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013408	CCA	2	6	4771	4776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013408	CCA	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013408	TAGGA	2	10	4975	4984	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013408	ACT	2	6	5021	5026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013408	ACT	2	6	5099	5104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013408	CGA	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013408	TTTA	2	8	5119	5126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013408	ATG	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013408	ATA	2	6	5169	5174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013408	GGA	2	6	9436	9441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013408	AT	4	8	9940	9947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013408	TTA	2	6	10034	10039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013408	CCA	2	6	10074	10079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013408	A	6	6	10079	10084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013408	AAAAC	2	10	10119	10128	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.