MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 plasmid pMsip01

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012970	AACT	2	8	3	10	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012970	TGT	2	6	24	29	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012970	CTG	2	6	95	100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012970	TACA	2	8	137	144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012970	CGTGTA	2	12	177	188	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012970	CGC	2	6	195	200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_012970	CT	3	6	289	294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012970	A	8	8	296	303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012970	GCC	2	6	1710	1715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_012970	GCA	2	6	1725	1730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012970	TTC	2	6	1755	1760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012970	TA	4	8	1763	1770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012970	ATG	2	6	1775	1780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012970	ATTG	2	8	1800	1807	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012970	TTATAT	2	12	1809	1820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012970	ATC	3	9	1840	1848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012970	GTGAT	2	10	2952	2961	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012970	ATT	3	9	2993	3001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012970	CCT	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_012970	TGA	2	6	3340	3345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012970	ATA	2	6	3351	3356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012970	ATT	2	6	3381	3386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012970	TAAG	2	8	3634	3641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012970	A	6	6	3740	3745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012970	TCT	2	6	3786	3791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012970	AT	3	6	3801	3806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012970	CT	3	6	3866	3871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012970	T	6	6	3989	3994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012970	AG	3	6	3996	4001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012970	TC	3	6	4011	4016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012970	ATT	2	6	4120	4125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012970	TA	3	6	5500	5505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012970	AT	3	6	5513	5518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012970	ATT	2	6	5520	5525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012970	TCC	2	6	5554	5559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_012970	T	8	8	5583	5590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012970	A	8	8	5612	5619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012970	TA	3	6	7849	7854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012970	TAA	2	6	8653	8658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012970	ATT	2	6	8668	8673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012970	GAT	2	6	8674	8679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012970	AT	3	6	8704	8709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012970	TA	3	6	8722	8727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012970	AT	3	6	9480	9485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012970	TCG	2	6	9518	9523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012970	CTA	2	6	9572	9577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012970	GCTTC	2	10	9583	9592	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_012970	TCA	2	6	9612	9617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012970	ATT	2	6	9642	9647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012970	TG	3	6	9885	9890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012970	GT	3	6	9894	9899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012970	TC	3	6	9948	9953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012970	AGA	2	6	9974	9979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012970	ATT	2	6	10107	10112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012970	GAA	2	6	10170	10175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012970	AGG	2	6	10176	10181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012970	AGGA	2	8	10381	10388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012970	CATC	2	8	10629	10636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012970	TA	3	6	11111	11116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012970	TA	3	6	12229	12234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012970	CAA	2	6	20130	20135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012970	CTT	2	6	20142	20147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012970	AGC	2	6	20149	20154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012970	GTAG	2	8	20155	20162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012970	ATC	2	6	20176	20181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012970	T	6	6	20495	20500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012970	A	6	6	20502	20507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012970	ATT	2	6	20573	20578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012970	TGT	2	6	21117	21122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012970	ATA	2	6	21129	21134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012970	AGCTA	2	10	21145	21154	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_012970	TAT	2	6	23789	23794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012970	GTT	2	6	24063	24068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012970	GAA	2	6	24095	24100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012970	TA	3	6	32900	32905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012970	TATT	2	8	32932	32939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012970	TGC	2	6	33048	33053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012970	CCT	2	6	33912	33917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_012970	ACT	2	6	33958	33963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012970	AGT	2	6	41620	41625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012970	ATCGAA	2	12	41987	41998	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012970	GTT	2	6	42004	42009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012970	TATT	2	8	42043	42050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012970	CT	3	6	43028	43033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012970	TGA	2	6	44256	44261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012970	TA	3	6	45108	45113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012970	AT	3	6	46230	46235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012970	AGCG	2	8	46264	46271	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012970	TAC	2	6	46378	46383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012970	TAC	2	6	47046	47051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012970	TTA	2	6	47052	47057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012970	TTAA	2	8	47064	47071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012970	T	6	6	47115	47120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012970	ATTT	2	8	47167	47174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012970	CTT	2	6	47208	47213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012970	T	6	6	47236	47241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012970	AATC	2	8	47255	47262	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012970	TCC	2	6	47271	47276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_012970	ATT	2	6	47291	47296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012970	AT	3	6	47301	47306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012970	TTC	2	6	47362	47367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012970	ACTA	2	8	47388	47395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012970	ACC	2	6	47414	47419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_012970	ACAG	2	8	47423	47430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012970	A	7	7	47438	47444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012970	ACA	2	6	47491	47496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012970	C	8	8	47527	47534	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_012970	ACC	2	6	47554	47559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_012970	CAG	2	6	48494	48499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012970	AGG	2	6	48537	48542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012970	T	6	6	48573	48578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012970	ATT	2	6	48770	48775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012970	AT	4	8	50307	50314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012970	TA	3	6	50323	50328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012970	TGT	2	6	51476	51481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012970	ATA	3	9	52509	52517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012970	TTG	2	6	52533	52538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012970	TAA	2	6	52549	52554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012970	TATT	2	8	52563	52570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012970	A	8	8	52634	52641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012970	TCC	2	6	53117	53122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_012970	GCA	2	6	53158	53163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012970	TAG	2	6	53165	53170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012970	TGT	2	6	55422	55427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012970	TTA	2	6	57535	57540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012970	TCA	2	6	57576	57581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012970	TCA	2	6	57633	57638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012970	ACT	2	6	57681	57686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012970	TA	3	6	58477	58482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012970	TA	3	6	58490	58495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012970	AT	3	6	58514	58519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012970	TTC	2	6	62993	62998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012970	G	6	6	63027	63032	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012970	T	7	7	63047	63053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012970	T	7	7	63064	63070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012970	TA	3	6	63114	63119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012970	GTT	2	6	63124	63129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012970	ATG	2	6	72193	72198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012970	TAAA	2	8	73738	73745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012970	A	7	7	75231	75237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012970	TGA	2	6	75260	75265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012970	GTT	2	6	75336	75341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012970	CAT	2	6	75358	75363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_012970	GAT	2	6	75372	75377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012970	CTCATC	2	12	75467	75478	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_012970	TGCA	2	8	76195	76202	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_012970	TCA	2	6	76277	76282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_012970	T	7	7	76305	76311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012970	TGC	2	6	76414	76419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_012970	GTA	2	6	76552	76557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012970	ACA	2	6	76614	76619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_012970	CAC	2	6	76632	76637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_012970	GGCAA	2	10	76671	76680	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.