MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 8881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012207	TTC	2	6	854827	854832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_012207	CCGC	2	8	854988	854995	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1503	NC_012207	CGG	2	6	855007	855012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_012207	CCT	2	6	855016	855021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_012207	ACC	2	6	855028	855033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_012207	ATCGG	2	10	855866	855875	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1507	NC_012207	GAG	2	6	855882	855887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_012207	TCG	2	6	857663	857668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_012207	TGA	2	6	857703	857708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_012207	C	8	8	857754	857761	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1511	NC_012207	AGG	2	6	864237	864242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_012207	CGCGA	2	10	864283	864292	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1513	NC_012207	GAT	2	6	864378	864383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_012207	CCGGCG	2	12	866658	866669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_012207	GCG	2	6	866746	866751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_012207	CCAA	2	8	870913	870920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_012207	CGC	2	6	870933	870938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_012207	GCA	2	6	871897	871902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_012207	ACCGGG	2	12	873379	873390	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_012207	ACT	2	6	873463	873468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_012207	CGT	2	6	876816	876821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_012207	GCG	2	6	876822	876827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_012207	CCG	2	6	879965	879970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_012207	GCA	2	6	879989	879994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_012207	CAG	2	6	880042	880047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_012207	AGC	2	6	880058	880063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_012207	GCG	2	6	880101	880106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_012207	GCT	2	6	880120	880125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_012207	CCG	2	6	880161	880166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_012207	GCC	2	6	880169	880174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_012207	GC	3	6	880181	880186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_012207	GGC	2	6	880192	880197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_012207	CGG	2	6	880227	880232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_012207	CGA	2	6	880285	880290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_012207	CG	3	6	881963	881968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_012207	GCCGA	2	10	882016	882025	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1537	NC_012207	CTG	2	6	882066	882071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_012207	TCG	2	6	883417	883422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_012207	GCC	2	6	885934	885939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_012207	GGC	2	6	885975	885980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_012207	GCG	2	6	885995	886000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_012207	GAG	3	9	886010	886018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_012207	CGG	2	6	887552	887557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_012207	CGT	2	6	887561	887566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_012207	CAC	2	6	890172	890177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_012207	GCGT	2	8	890183	890190	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_012207	AGC	2	6	890198	890203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_012207	GAA	2	6	890205	890210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_012207	CCG	2	6	890582	890587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_012207	ACC	2	6	890591	890596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_012207	C	6	6	890602	890607	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1552	NC_012207	GCG	2	6	890617	890622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_012207	CGG	3	9	890623	890631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_012207	TCG	2	6	892150	892155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_012207	CG	3	6	892175	892180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_012207	CCA	2	6	892213	892218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_012207	TG	4	8	892278	892285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_012207	GGTG	2	8	892292	892299	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_012207	GGT	2	6	892326	892331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_012207	CCGG	2	8	892425	892432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_012207	CCG	2	6	892477	892482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_012207	AGG	2	6	892514	892519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_012207	ACC	2	6	892522	892527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_012207	GTT	3	9	892531	892539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_012207	CGA	2	6	892581	892586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_012207	CCA	2	6	892622	892627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_012207	CAT	2	6	892647	892652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1569	NC_012207	CAG	2	6	892750	892755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_012207	GTG	2	6	892756	892761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_012207	CCA	2	6	892769	892774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_012207	GC	3	6	892801	892806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_012207	CGAT	2	8	892826	892833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_012207	GCGG	2	8	892848	892855	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_012207	TGC	2	6	892856	892861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1577	NC_012207	GTT	2	6	892914	892919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_012207	CAG	2	6	893043	893048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1583	NC_012207	CCAG	2	8	893071	893078	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_012207	CG	4	8	893095	893102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_012207	CAT	2	6	893116	893121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1598	NC_012207	GCCC	2	8	897798	897805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1599	NC_012207	CTAG	2	8	897903	897910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1601	NC_012207	CGC	2	6	900912	900917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_012207	CAAT	2	8	900942	900949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_012207	GTT	2	6	903649	903654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_012207	AGTTC	2	10	903672	903681	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1609	NC_012207	CGG	2	6	904234	904239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_012207	ACGC	2	8	905838	905845	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_012207	ACGCC	2	10	906990	906999	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1612	NC_012207	G	6	6	907025	907030	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_012207	GTG	2	6	907038	907043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_012207	GGC	2	6	907269	907274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_012207	GCC	2	6	907319	907324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_012207	GGC	2	6	907338	907343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_012207	CCG	2	6	907348	907353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1619	NC_012207	TCG	2	6	910161	910166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1621	NC_012207	CAC	2	6	910247	910252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_012207	GCGGCC	2	12	910267	910278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_012207	CGG	2	6	911564	911569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_012207	GCT	2	6	911596	911601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_012207	TGC	2	6	911607	911612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1627	NC_012207	ACAGCA	2	12	911640	911651	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_012207	GGC	2	6	911663	911668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_012207	GGC	2	6	913024	913029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_012207	ACG	2	6	913095	913100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_012207	C	7	7	914834	914840	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1632	NC_012207	AAG	2	6	914841	914846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1634	NC_012207	AGC	2	6	915447	915452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1899	NC_012207	GTT	2	6	1019300	1019305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1900	NC_012207	CGG	2	6	1019306	1019311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1901	NC_012207	TGC	2	6	1019381	1019386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1902	NC_012207	CTA	2	6	1022167	1022172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1903	NC_012207	CG	3	6	1022222	1022227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1904	NC_012207	CGA	2	6	1022229	1022234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1905	NC_012207	ACC	2	6	1023841	1023846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1906	NC_012207	TCT	2	6	1023879	1023884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1908	NC_012207	TGT	2	6	1023932	1023937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1909	NC_012207	CGG	2	6	1023989	1023994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1918	NC_012207	GC	3	6	1026299	1026304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1922	NC_012207	CGC	2	6	1027624	1027629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1924	NC_012207	TTTC	2	8	1027679	1027686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1931	NC_012207	GT	3	6	1029257	1029262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1932	NC_012207	GT	3	6	1029277	1029282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_012207	GGC	2	6	1029290	1029295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1935	NC_012207	CAACGG	2	12	1031550	1031561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1942	NC_012207	CCTG	2	8	1034838	1034845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1943	NC_012207	TCG	2	6	1034849	1034854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1996	NC_012207	GGA	2	6	1067255	1067260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1997	NC_012207	CG	3	6	1068197	1068202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1998	NC_012207	TGG	2	6	1069654	1069659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_012207	ACG	2	6	1071940	1071945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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