MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 8881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012207	TGG	2	6	2553238	2553243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_012207	CG	3	6	2553273	2553278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_012207	TCA	2	6	2553283	2553288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_012207	GCT	2	6	2553673	2553678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_012207	TGT	2	6	2553705	2553710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_012207	CGC	2	6	2553723	2553728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_012207	ACG	2	6	2553734	2553739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_012207	TTG	2	6	2554284	2554289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_012207	CGT	2	6	2554294	2554299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_012207	GTG	2	6	2554310	2554315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_012207	AGG	2	6	2554339	2554344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_012207	GCG	2	6	2554631	2554636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_012207	GGT	2	6	2554639	2554644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_012207	CGC	2	6	2554735	2554740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_012207	CTGG	2	8	2554741	2554748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5016	NC_012207	TCA	2	6	2554755	2554760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_012207	CCCG	2	8	2554817	2554824	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5018	NC_012207	GC	3	6	2554850	2554855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_012207	CCG	2	6	2554913	2554918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_012207	GGA	2	6	2566189	2566194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_012207	CTG	2	6	2566674	2566679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_012207	GCA	2	6	2566692	2566697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_012207	CGC	2	6	2566712	2566717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_012207	GC	4	8	2566761	2566768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_012207	GCG	3	9	2566807	2566815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_012207	GGC	2	6	2566818	2566823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_012207	CG	3	6	2566854	2566859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_012207	CCGC	2	8	2566860	2566867	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5029	NC_012207	GCC	2	6	2566868	2566873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_012207	G	6	6	2569849	2569854	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_012207	CGC	2	6	2570363	2570368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_012207	GGC	2	6	2570424	2570429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_012207	CTG	3	9	2570432	2570440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_012207	ACT	2	6	2570461	2570466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_012207	ACT	2	6	2570535	2570540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_012207	TCG	2	6	2570556	2570561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_012207	AAC	2	6	2570568	2570573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_012207	CCT	2	6	2573332	2573337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_012207	GGCC	2	8	2573362	2573369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_012207	GTT	2	6	2573399	2573404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_012207	TGT	2	6	2573515	2573520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_012207	GCA	2	6	2573525	2573530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_012207	TCA	2	6	2574129	2574134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_012207	ACCG	2	8	2578304	2578311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_012207	TCC	2	6	2578422	2578427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_012207	CGC	2	6	2578430	2578435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_012207	TGT	4	12	2578448	2578459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_012207	GCC	2	6	2578537	2578542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_012207	GCC	2	6	2580301	2580306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_012207	CTT	2	6	2580315	2580320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_012207	GCC	2	6	2580325	2580330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_012207	CAT	2	6	2580341	2580346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_012207	GCT	2	6	2580349	2580354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_012207	GCT	2	6	2580408	2580413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_012207	CGAG	2	8	2580518	2580525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_012207	CAA	2	6	2581717	2581722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_012207	CGA	2	6	2582878	2582883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_012207	TCC	2	6	2583939	2583944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_012207	ACG	2	6	2583946	2583951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_012207	TCA	2	6	2583958	2583963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_012207	CGA	2	6	2584015	2584020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_012207	GCT	2	6	2584125	2584130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_012207	CCG	2	6	2584201	2584206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5064	NC_012207	GCC	2	6	2584225	2584230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_012207	CGTG	2	8	2584320	2584327	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_012207	GCG	2	6	2584393	2584398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_012207	TGT	2	6	2584401	2584406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_012207	TCT	2	6	2584452	2584457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_012207	GC	3	6	2584470	2584475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5070	NC_012207	ACC	2	6	2584486	2584491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_012207	TCG	2	6	2587047	2587052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_012207	TCG	2	6	2587487	2587492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_012207	CGG	2	6	2588922	2588927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_012207	CAT	2	6	2588936	2588941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5076	NC_012207	CTG	2	6	2589066	2589071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_012207	TCG	2	6	2589097	2589102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_012207	GCCGG	2	10	2589118	2589127	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5079	NC_012207	TCA	2	6	2589221	2589226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_012207	GGA	2	6	2589284	2589289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_012207	GAC	2	6	2589384	2589389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_012207	GCA	2	6	2589454	2589459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_012207	AAC	2	6	2589970	2589975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_012207	CGT	2	6	2589994	2589999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_012207	GC	3	6	2590077	2590082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_012207	GGAT	2	8	2590103	2590110	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_012207	CCG	2	6	2593662	2593667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_012207	CTT	2	6	2595731	2595736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_012207	TCG	2	6	2595745	2595750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_012207	CTC	2	6	2597338	2597343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_012207	CG	3	6	2597370	2597375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5093	NC_012207	CAC	2	6	2597404	2597409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_012207	GCC	2	6	2597413	2597418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_012207	CCA	2	6	2597429	2597434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_012207	CG	3	6	2598881	2598886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_012207	CAT	3	9	2598963	2598971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_012207	TCCT	2	8	2599000	2599007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_012207	ACC	2	6	2599840	2599845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_012207	GGC	2	6	2599883	2599888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_012207	CGC	2	6	2599903	2599908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_012207	T	6	6	2604512	2604517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_012207	CCG	2	6	2604518	2604523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_012207	CAC	2	6	2609384	2609389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5105	NC_012207	GTG	2	6	2609427	2609432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_012207	ATT	2	6	2609461	2609466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_012207	CGG	2	6	2609488	2609493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_012207	GTC	2	6	2609516	2609521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5110	NC_012207	CGG	2	6	2609770	2609775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_012207	CGG	2	6	2609779	2609784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_012207	GAC	2	6	2609822	2609827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_012207	GCA	2	6	2611841	2611846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_012207	CTCAC	2	10	2612894	2612903	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5115	NC_012207	CGG	2	6	2612940	2612945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_012207	TCG	2	6	2613021	2613026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_012207	TTC	2	6	2613917	2613922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_012207	CGTT	2	8	2613923	2613930	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5119	NC_012207	GAGC	2	8	2613999	2614006	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5120	NC_012207	GCA	2	6	2624999	2625004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_012207	TCG	2	6	2625019	2625024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_012207	GGCG	2	8	2625026	2625033	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5123	NC_012207	CGG	2	6	2625041	2625046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_012207	C	6	6	2633709	2633714	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5125	NC_012207	CAA	2	6	2635435	2635440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_012207	CGCGG	2	10	2635499	2635508	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5127	NC_012207	C	6	6	2637839	2637844	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5128	NC_012207	GTC	2	6	2637848	2637853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_012207	GAA	2	6	2637876	2637881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_012207	ACCC	2	8	2637926	2637933	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5133	NC_012207	GCAG	2	8	2637980	2637987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5134	NC_012207	GCTA	2	8	2638073	2638080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5152	NC_012207	ATC	2	6	2642217	2642222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5162	NC_012207	CG	3	6	2647892	2647897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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