MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL6

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012001	C	6	6	84	89	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_012001	A	6	6	106	111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012001	TCC	2	6	126	131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_012001	GAAA	2	8	142	149	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012001	AGA	2	6	183	188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012001	AAGAAA	2	12	191	202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012001	GAA	2	6	280	285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012001	AGAA	2	8	288	295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012001	AGAAA	2	10	298	307	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012001	ATTG	2	8	315	322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012001	A	6	6	325	330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012001	AG	3	6	343	348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012001	TGTTT	2	10	366	375	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012001	TATC	2	8	409	416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012001	ATT	2	6	482	487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012001	CAG	2	6	515	520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012001	GAAA	2	8	528	535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012001	CAGA	2	8	572	579	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012001	CAG	2	6	590	595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012001	CA	3	6	608	613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012001	ACT	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012001	A	6	6	708	713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012001	AGA	2	6	716	721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012001	TA	5	10	752	761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012001	TAA	2	6	764	769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012001	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012001	TC	3	6	794	799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012001	TTG	2	6	844	849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012001	T	7	7	862	868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012001	TA	4	8	900	907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012001	TA	4	8	911	918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012001	GAG	2	6	1119	1124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012001	GAT	2	6	2092	2097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012001	ACC	2	6	2102	2107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012001	A	6	6	2116	2121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012001	GAG	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012001	TG	3	6	2543	2548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012001	T	7	7	2550	2556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012001	CAAGAA	2	12	2674	2685	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012001	T	6	6	2699	2704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012001	AGG	2	6	2712	2717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012001	G	6	6	2725	2730	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012001	CTG	2	6	2793	2798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012001	ATA	2	6	2814	2819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012001	ATT	2	6	2844	2849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012001	TAT	2	6	2858	2863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012001	TGT	2	6	2902	2907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012001	TGA	2	6	2927	2932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012001	AGG	2	6	2973	2978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012001	A	6	6	2988	2993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012001	ACAG	2	8	3021	3028	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012001	AAG	2	6	3386	3391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012001	GGA	2	6	3429	3434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.