MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL1

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011995	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011995	ATC	2	6	56	61	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011995	AT	3	6	67	72	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011995	CAT	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011995	TCT	2	6	193	198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011995	TCT	2	6	228	233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011995	TTG	2	6	270	275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011995	GAC	2	6	293	298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011995	CCA	2	6	309	314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011995	CTT	2	6	430	435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011995	GAC	2	6	461	466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011995	CTT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011995	A	6	6	1015	1020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011995	T	6	6	1041	1046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011995	GTGAT	2	10	1065	1074	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011995	TTG	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011995	AAC	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011995	CATCA	2	10	1175	1184	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011995	A	6	6	1194	1199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011995	T	6	6	1260	1265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011995	ACTT	2	8	1312	1319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011995	ATC	2	6	1358	1363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011995	TTC	2	6	1370	1375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011995	GAT	2	6	1386	1391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011995	CAT	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011995	TGGAT	2	10	1461	1470	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011995	AATCC	2	10	1495	1504	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011995	TCC	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011995	TTA	2	6	1963	1968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011995	AT	3	6	2014	2019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011995	CAC	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_011995	AGG	2	6	2056	2061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011995	CATG	2	8	2071	2078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011995	GTT	2	6	2081	2086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011995	TAT	2	6	2116	2121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011995	T	6	6	2197	2202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011995	ATG	2	6	2209	2214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011995	A	7	7	2257	2263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011995	CAT	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011995	A	6	6	2294	2299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011995	GTA	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011995	TAA	2	6	2356	2361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011995	ATA	3	9	2389	2397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011995	AAAGT	2	10	2413	2422	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011995	GAT	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011995	AT	3	6	3355	3360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011995	ATGA	2	8	3366	3373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011995	TCAT	2	8	3379	3386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011995	TTA	3	9	3993	4001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011995	CAT	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011995	ATT	2	6	4017	4022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011995	TAT	2	6	4078	4083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011995	TCC	2	6	5897	5902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011995	TAA	2	6	5914	5919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011995	T	6	6	5925	5930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011995	ATCAGT	2	12	5955	5966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_011995	TAAAGA	2	12	5975	5986	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011995	TTA	2	6	6037	6042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011995	GAT	2	6	6062	6067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011995	TA	3	6	6075	6080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011995	CAA	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011995	AT	3	6	6106	6111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011995	T	7	7	6167	6173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011995	ATT	2	6	6187	6192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011995	TA	3	6	6196	6201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011995	T	8	8	9497	9504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011995	TTC	2	6	9508	9513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011995	CAATAT	2	12	9535	9546	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011995	CTT	2	6	9571	9576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011995	T	6	6	9575	9580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011995	ATTA	2	8	9636	9643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011995	T	6	6	9660	9665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011995	AT	3	6	9668	9673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011995	T	7	7	9679	9685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011995	A	6	6	9687	9692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011995	TAT	2	6	9708	9713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011995	TA	3	6	9715	9720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011995	ATA	3	9	9718	9726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011995	AATT	2	8	9727	9734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011995	GAT	2	6	9739	9744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011995	ATT	2	6	9771	9776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011995	T	6	6	9839	9844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011995	ATT	2	6	9854	9859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011995	TTAT	2	8	9903	9910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011995	TCC	2	6	10786	10791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_011995	TAA	2	6	10801	10806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011995	ATCA	2	8	10848	10855	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011995	T	7	7	10892	10898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011995	TAT	2	6	10979	10984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011995	A	6	6	10987	10992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011995	ATA	2	6	11853	11858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011995	TA	3	6	11857	11862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011995	CA	3	6	11922	11927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011995	T	7	7	11948	11954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011995	TTTGCT	2	12	11982	11993	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011995	TA	3	6	11997	12002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011995	A	7	7	12037	12043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011995	ATCA	2	8	12054	12061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011995	ATT	2	6	12115	12120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011995	TCAT	2	8	12127	12134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011995	GTTTT	2	10	12149	12158	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011995	T	6	6	12217	12222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011995	TC	3	6	12239	12244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011995	ATT	2	6	12252	12257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011995	TAA	2	6	13787	13792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011995	ATTT	2	8	13808	13815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011995	TATC	2	8	13838	13845	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011995	TATC	2	8	13898	13905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011995	TATC	2	8	13958	13965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011995	TATC	2	8	14018	14025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011995	TATC	2	8	14078	14085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011995	TATC	2	8	14138	14145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011995	TATC	2	8	14198	14205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011995	TATC	2	8	14258	14265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011995	TATC	2	8	14318	14325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011995	TAA	2	6	14367	14372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011995	T	7	7	15529	15535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011995	TTG	2	6	15594	15599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.