MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 10349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_011832	GTT	2	6	2434977	2434982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_011832	AC	3	6	2435160	2435165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8503	NC_011832	TTC	3	9	2435275	2435283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_011832	TGA	2	6	2436160	2436165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_011832	TGG	2	6	2436172	2436177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_011832	GTT	2	6	2436423	2436428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_011832	T	6	6	2437569	2437574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_011832	GTA	2	6	2437641	2437646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_011832	ACA	2	6	2437654	2437659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8510	NC_011832	CTG	2	6	2437783	2437788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_011832	AT	3	6	2437814	2437819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_011832	CG	3	6	2437890	2437895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8513	NC_011832	CGG	2	6	2437983	2437988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8514	NC_011832	CAC	2	6	2438001	2438006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8515	NC_011832	GCC	2	6	2438050	2438055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8516	NC_011832	CA	3	6	2438178	2438183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8517	NC_011832	GAG	2	6	2438184	2438189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_011832	CTT	2	6	2438202	2438207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_011832	CAA	2	6	2438252	2438257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_011832	ACG	2	6	2438259	2438264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_011832	GCCG	2	8	2438323	2438330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8522	NC_011832	A	7	7	2438468	2438474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_011832	T	6	6	2438486	2438491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_011832	GGCA	2	8	2438504	2438511	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8525	NC_011832	CT	3	6	2438515	2438520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8526	NC_011832	TGA	2	6	2438525	2438530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_011832	CAC	2	6	2438542	2438547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8528	NC_011832	AGCA	2	8	2439261	2439268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8529	NC_011832	GAT	2	6	2439331	2439336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_011832	GA	3	6	2439351	2439356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_011832	CACC	2	8	2439387	2439394	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8532	NC_011832	GAGGG	2	10	2439402	2439411	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_011832	GT	3	6	2439413	2439418	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_011832	A	7	7	2439436	2439442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_011832	GAC	2	6	2439948	2439953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8536	NC_011832	GAC	2	6	2439956	2439961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_011832	CATCAC	2	12	2440669	2440680	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
8538	NC_011832	A	6	6	2440709	2440714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_011832	AGA	2	6	2440750	2440755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_011832	AG	3	6	2440776	2440781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_011832	ACA	2	6	2440789	2440794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8542	NC_011832	GTG	2	6	2441540	2441545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_011832	CGG	2	6	2441577	2441582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8544	NC_011832	AGG	2	6	2441598	2441603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_011832	GAA	2	6	2441885	2441890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_011832	TGA	2	6	2442299	2442304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_011832	CCT	2	6	2442372	2442377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8548	NC_011832	AGC	2	6	2442430	2442435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_011832	GAGAA	2	10	2442445	2442454	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_011832	TAT	2	6	2442500	2442505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_011832	AT	6	12	2442504	2442515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_011832	ATA	2	6	2442522	2442527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_011832	AGA	2	6	2442574	2442579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_011832	GAG	2	6	2442605	2442610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_011832	TCG	2	6	2442627	2442632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8556	NC_011832	A	6	6	2442639	2442644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_011832	C	6	6	2442646	2442651	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8558	NC_011832	GATC	2	8	2442710	2442717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8559	NC_011832	TCG	2	6	2442719	2442724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8560	NC_011832	T	6	6	2442756	2442761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_011832	CGA	2	6	2442831	2442836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8562	NC_011832	CCA	2	6	2442853	2442858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8563	NC_011832	TCG	2	6	2442896	2442901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8564	NC_011832	C	6	6	2442944	2442949	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8565	NC_011832	ATC	2	6	2443012	2443017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8566	NC_011832	ATA	2	6	2443041	2443046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_011832	AGA	2	6	2443050	2443055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_011832	AGG	2	6	2443089	2443094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_011832	TTA	2	6	2443128	2443133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_011832	TC	3	6	2443139	2443144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8571	NC_011832	GGCC	2	8	2443225	2443232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8572	NC_011832	TCA	2	6	2443239	2443244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_011832	ACTC	2	8	2443844	2443851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8574	NC_011832	GA	3	6	2443861	2443866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_011832	GA	3	6	2443881	2443886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_011832	CTGTT	2	10	2443910	2443919	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8577	NC_011832	AGA	2	6	2444031	2444036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_011832	TC	3	6	2444126	2444131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8579	NC_011832	TGG	2	6	2444241	2444246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_011832	CGA	2	6	2444280	2444285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8581	NC_011832	GTT	2	6	2444291	2444296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_011832	AG	3	6	2444332	2444337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8583	NC_011832	TCC	2	6	2444349	2444354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8584	NC_011832	GAA	3	9	2444633	2444641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8585	NC_011832	CGG	2	6	2444673	2444678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8586	NC_011832	GTA	2	6	2444699	2444704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_011832	GGT	2	6	2444729	2444734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_011832	AGG	2	6	2444778	2444783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_011832	CGG	2	6	2444785	2444790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8590	NC_011832	CCCT	2	8	2444805	2444812	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8591	NC_011832	CCTC	2	8	2444935	2444942	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8592	NC_011832	CGATA	2	10	2445424	2445433	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8593	NC_011832	TAA	2	6	2445568	2445573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_011832	TAT	2	6	2445574	2445579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_011832	TCC	2	6	2445584	2445589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8596	NC_011832	CCT	2	6	2445608	2445613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8597	NC_011832	ATA	2	6	2445689	2445694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_011832	CCA	2	6	2446532	2446537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8599	NC_011832	CCACC	2	10	2446545	2446554	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8600	NC_011832	GGC	2	6	2446588	2446593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8601	NC_011832	G	6	6	2446614	2446619	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_011832	C	7	7	2446624	2446630	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8603	NC_011832	CAG	2	6	2446662	2446667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8604	NC_011832	AGGCC	2	10	2446668	2446677	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8605	NC_011832	ATCTCT	2	12	2446699	2446710	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8606	NC_011832	A	6	6	2446845	2446850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8607	NC_011832	GA	3	6	2446953	2446958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_011832	AAT	2	6	2447062	2447067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_011832	TAA	2	6	2447144	2447149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_011832	TAA	2	6	2447212	2447217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_011832	CAA	3	9	2447249	2447257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_011832	CTG	2	6	2448254	2448259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8613	NC_011832	GCG	2	6	2448307	2448312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_011832	A	6	6	2448327	2448332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_011832	ATG	2	6	2448334	2448339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_011832	A	8	8	2448347	2448354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_011832	CAC	2	6	2448404	2448409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8618	NC_011832	CCT	2	6	2448463	2448468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8619	NC_011832	ACA	2	6	2448521	2448526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_011832	CTG	2	6	2448540	2448545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8621	NC_011832	CCAAT	2	10	2448588	2448597	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8622	NC_011832	AAG	2	6	2448604	2448609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8623	NC_011832	CAAT	2	8	2448626	2448633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8624	NC_011832	ATA	2	6	2448693	2448698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_011832	CAG	2	6	2448743	2448748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_011832	CGC	2	6	2448770	2448775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8627	NC_011832	CAG	2	6	2448812	2448817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_011832	CA	3	6	2448904	2448909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8629	NC_011832	AAT	2	6	2448942	2448947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_011832	ACTG	2	8	2448958	2448965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8631	NC_011832	TCA	2	6	2449017	2449022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8632	NC_011832	TAA	2	6	2449033	2449038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8633	NC_011832	T	7	7	2449052	2449058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8634	NC_011832	TCA	3	9	2449105	2449113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8645	NC_011832	T	6	6	2458491	2458496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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