MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 10349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011832	TCC	2	6	1745745	1745750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6502	NC_011832	CCA	2	6	1745754	1745759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6503	NC_011832	ACAG	2	8	1745840	1745847	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6504	NC_011832	G	6	6	1749044	1749049	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_011832	ATC	2	6	1750352	1750357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_011832	TGC	2	6	1750362	1750367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_011832	TTG	2	6	1750394	1750399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_011832	TTC	2	6	1750442	1750447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_011832	ATCC	2	8	1750462	1750469	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_011832	CAC	2	6	1750642	1750647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6511	NC_011832	AGC	2	6	1750655	1750660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_011832	TG	3	6	1750708	1750713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_011832	GAC	2	6	1750724	1750729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_011832	AGG	2	6	1750764	1750769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_011832	C	6	6	1750770	1750775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6516	NC_011832	TCA	2	6	1750840	1750845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_011832	TGA	2	6	1750918	1750923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_011832	GTA	2	6	1750990	1750995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_011832	CTT	2	6	1751030	1751035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_011832	CCA	3	9	1751140	1751148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6521	NC_011832	AAT	2	6	1751181	1751186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_011832	CAA	2	6	1751350	1751355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_011832	CATC	2	8	1751380	1751387	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6524	NC_011832	CCA	2	6	1751394	1751399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6525	NC_011832	CAAT	2	8	1751419	1751426	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6526	NC_011832	ATT	2	6	1751439	1751444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_011832	TCA	2	6	1751524	1751529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_011832	CAT	2	6	1751585	1751590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_011832	ATCA	2	8	1752531	1752538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6530	NC_011832	GGA	2	6	1753199	1753204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_011832	AT	3	6	1753209	1753214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_011832	T	6	6	1753237	1753242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_011832	TAATTG	2	12	1753257	1753268	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_011832	CCAC	2	8	1753303	1753310	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6535	NC_011832	GGACCA	2	12	1753342	1753353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_011832	ACA	2	6	1753378	1753383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_011832	GAAAAA	2	12	1753402	1753413	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_011832	A	6	6	1753442	1753447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_011832	A	7	7	1753451	1753457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_011832	A	8	8	1753463	1753470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_011832	ACA	2	6	1753516	1753521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_011832	ACCA	2	8	1753535	1753542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6543	NC_011832	GGCC	2	8	1755060	1755067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6544	NC_011832	A	6	6	1755128	1755133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_011832	CAA	2	6	1755203	1755208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_011832	TCC	2	6	1755238	1755243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6547	NC_011832	TCAC	2	8	1755252	1755259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6548	NC_011832	GAA	2	6	1755360	1755365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_011832	ACC	2	6	1755372	1755377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6550	NC_011832	GAT	2	6	1755388	1755393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_011832	CAT	2	6	1755395	1755400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_011832	ATG	2	6	1755423	1755428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_011832	TA	3	6	1755430	1755435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_011832	TGA	2	6	1755450	1755455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_011832	ATG	2	6	1755461	1755466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_011832	ATT	2	6	1758296	1758301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_011832	ATA	3	9	1758323	1758331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_011832	ATA	3	9	1758361	1758369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_011832	AC	3	6	1758380	1758385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6560	NC_011832	AG	3	6	1758413	1758418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_011832	ATCG	2	8	1758419	1758426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6562	NC_011832	CACAG	2	10	1759169	1759178	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6563	NC_011832	C	7	7	1759206	1759212	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6564	NC_011832	CAG	2	6	1759216	1759221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_011832	TCTTA	2	10	1759223	1759232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6566	NC_011832	T	6	6	1761726	1761731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_011832	TGA	2	6	1761738	1761743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_011832	CTG	2	6	1761754	1761759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_011832	TGA	2	6	1761766	1761771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_011832	ATAA	2	8	1762974	1762981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_011832	T	6	6	1763011	1763016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_011832	AGT	2	6	1763039	1763044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_011832	AAT	2	6	1764451	1764456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_011832	TTTA	2	8	1764481	1764488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_011832	GAA	2	6	1765548	1765553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_011832	AG	3	6	1765564	1765569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_011832	TAA	2	6	1767667	1767672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_011832	GATC	2	8	1767769	1767776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6579	NC_011832	CAC	2	6	1767862	1767867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6580	NC_011832	CAG	2	6	1767868	1767873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_011832	AAG	2	6	1769749	1769754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_011832	GAA	2	6	1769884	1769889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_011832	AC	4	8	1769906	1769913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6584	NC_011832	T	9	9	1773603	1773611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_011832	AG	4	8	1773624	1773631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_011832	ATT	2	6	1775721	1775726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_011832	CTG	2	6	1775737	1775742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_011832	GATT	2	8	1775771	1775778	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_011832	T	6	6	1775830	1775835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6592	NC_011832	GAG	2	6	1775882	1775887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_011832	AG	3	6	1775927	1775932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_011832	TGATC	2	10	1775961	1775970	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6595	NC_011832	GAA	2	6	1776131	1776136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_011832	GATG	2	8	1776265	1776272	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_011832	ATCCT	2	10	1776304	1776313	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6598	NC_011832	GCC	2	6	1776314	1776319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6599	NC_011832	T	6	6	1776357	1776362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_011832	AT	3	6	1776396	1776401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_011832	ATA	2	6	1776406	1776411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_011832	CTA	2	6	1776459	1776464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_011832	AT	3	6	1780719	1780724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_011832	AG	3	6	1780752	1780757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_011832	GGT	2	6	1780764	1780769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_011832	AG	3	6	1780819	1780824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_011832	GTG	2	6	1780825	1780830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_011832	AC	3	6	1780859	1780864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6609	NC_011832	ATC	2	6	1780882	1780887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6611	NC_011832	ATC	2	6	1780912	1780917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_011832	ACA	2	6	1780926	1780931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_011832	GAT	2	6	1780990	1780995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_011832	TCA	2	6	1781042	1781047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_011832	GA	3	6	1781091	1781096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_011832	CAT	2	6	1781122	1781127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_011832	ACTGA	2	10	1781162	1781171	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6618	NC_011832	TCCCTT	2	12	1781234	1781245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6619	NC_011832	T	6	6	1781244	1781249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_011832	AAG	2	6	1781252	1781257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_011832	ATG	2	6	1781270	1781275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6624	NC_011832	TGG	2	6	1781342	1781347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_011832	A	7	7	1781355	1781361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_011832	CT	3	6	1781368	1781373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6627	NC_011832	TCT	2	6	1781390	1781395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6632	NC_011832	AT	3	6	1781542	1781547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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