MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 10349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011832	CAT	2	6	1541494	1541499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_011832	GGAG	2	8	1541500	1541507	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_011832	CGT	3	9	1541509	1541517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_011832	CGA	2	6	1541521	1541526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_011832	ATC	2	6	1541636	1541641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_011832	CAGGC	2	10	1541694	1541703	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5507	NC_011832	AT	3	6	1541720	1541725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_011832	CAGG	2	8	1541785	1541792	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5509	NC_011832	G	6	6	1541791	1541796	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_011832	GCA	2	6	1541840	1541845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_011832	ATTC	2	8	1541946	1541953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5512	NC_011832	GGC	2	6	1542011	1542016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_011832	TGA	2	6	1542055	1542060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_011832	ACT	2	6	1542097	1542102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_011832	T	6	6	1542192	1542197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_011832	TATT	2	8	1542220	1542227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_011832	CGA	2	6	1542237	1542242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_011832	T	6	6	1542256	1542261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_011832	T	7	7	1542274	1542280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_011832	A	8	8	1542871	1542878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_011832	ACC	2	6	1542931	1542936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_011832	TCAG	2	8	1543014	1543021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5523	NC_011832	TGT	2	6	1543035	1543040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_011832	AAG	2	6	1543073	1543078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_011832	GCG	2	6	1543080	1543085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_011832	TCA	2	6	1543089	1543094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_011832	AGA	2	6	1543114	1543119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_011832	TC	3	6	1543195	1543200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_011832	TCA	2	6	1543209	1543214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_011832	GTC	2	6	1543260	1543265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_011832	CCTT	2	8	1543363	1543370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_011832	ACCA	2	8	1543584	1543591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_011832	GGT	2	6	1543600	1543605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_011832	GCA	2	6	1543645	1543650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_011832	AAAAT	2	10	1543678	1543687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_011832	A	6	6	1543703	1543708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_011832	TCTT	2	8	1543740	1543747	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5538	NC_011832	CGG	2	6	1543754	1543759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_011832	GA	3	6	1543787	1543792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_011832	GTT	2	6	1543810	1543815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_011832	CAA	2	6	1543843	1543848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_011832	AAC	2	6	1543866	1543871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_011832	GAG	2	6	1543886	1543891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_011832	A	6	6	1543901	1543906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_011832	CAG	2	6	1543907	1543912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_011832	ACA	2	6	1543942	1543947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_011832	AGA	2	6	1543971	1543976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_011832	CTG	2	6	1544001	1544006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_011832	ATC	2	6	1544010	1544015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_011832	ATT	2	6	1544049	1544054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_011832	TGG	2	6	1544055	1544060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_011832	TGA	2	6	1544868	1544873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_011832	CTG	2	6	1544939	1544944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_011832	ATG	2	6	1544958	1544963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_011832	GAT	2	6	1544999	1545004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_011832	GCCG	2	8	1545054	1545061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_011832	GGAG	2	8	1545101	1545108	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_011832	GTT	2	6	1545117	1545122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_011832	CGA	2	6	1545125	1545130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_011832	GCA	2	6	1545310	1545315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_011832	AGGT	2	8	1545348	1545355	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_011832	GTC	2	6	1545473	1545478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_011832	ACC	2	6	1545480	1545485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_011832	GAT	2	6	1545545	1545550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_011832	AGA	2	6	1545577	1545582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_011832	GTA	2	6	1545593	1545598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_011832	C	6	6	1545605	1545610	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5568	NC_011832	AGG	2	6	1545666	1545671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_011832	GAG	2	6	1545686	1545691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_011832	TGG	2	6	1545696	1545701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_011832	GA	3	6	1545732	1545737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_011832	A	6	6	1545796	1545801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_011832	CAC	2	6	1545810	1545815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5574	NC_011832	T	8	8	1545887	1545894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_011832	GAT	2	6	1545895	1545900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_011832	CA	3	6	1545903	1545908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_011832	AT	3	6	1545935	1545940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_011832	TTC	2	6	1545941	1545946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_011832	T	6	6	1546004	1546009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_011832	TAAT	2	8	1546030	1546037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_011832	GAAAA	2	10	1546660	1546669	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_011832	AGA	2	6	1546670	1546675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_011832	T	6	6	1546695	1546700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_011832	T	7	7	1546711	1546717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_011832	AAT	2	6	1546821	1546826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_011832	ATTT	2	8	1546883	1546890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_011832	AAC	2	6	1546925	1546930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_011832	AAG	2	6	1546936	1546941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_011832	ATCAAA	2	12	1546986	1546997	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5590	NC_011832	C	6	6	1548959	1548964	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5591	NC_011832	GA	3	6	1549061	1549066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_011832	T	6	6	1549086	1549091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_011832	GAT	2	6	1549095	1549100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_011832	A	7	7	1549147	1549153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_011832	GTGA	2	8	1549201	1549208	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_011832	CAG	2	6	1549228	1549233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_011832	G	6	6	1549233	1549238	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_011832	AAT	2	6	1549319	1549324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_011832	GAAA	2	8	1549328	1549335	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_011832	T	6	6	1549375	1549380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_011832	A	6	6	1549414	1549419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_011832	ATG	2	6	1549458	1549463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_011832	T	6	6	1549565	1549570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_011832	AGGAA	2	10	1549614	1549623	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_011832	TTCA	2	8	1549657	1549664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5606	NC_011832	GAT	2	6	1549668	1549673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_011832	AGG	2	6	1549675	1549680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_011832	TAA	2	6	1549686	1549691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_011832	CATT	2	8	1549708	1549715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5610	NC_011832	A	7	7	1549743	1549749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_011832	AG	3	6	1549758	1549763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_011832	CTT	2	6	1549771	1549776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_011832	CTT	2	6	1549801	1549806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_011832	CCTT	2	8	1549827	1549834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_011832	CTC	2	6	1549849	1549854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5616	NC_011832	ATC	2	6	1549880	1549885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_011832	TCAG	2	8	1549919	1549926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5618	NC_011832	GAT	2	6	1550114	1550119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_011832	TGC	2	6	1550137	1550142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_011832	TGG	2	6	1550219	1550224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_011832	AT	3	6	1550225	1550230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_011832	ATC	2	6	1550339	1550344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_011832	GGA	2	6	1550377	1550382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_011832	CAGAAC	2	12	1550473	1550484	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_011832	AGA	2	6	1550660	1550665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_011832	TCG	2	6	1550752	1550757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_011832	CTG	2	6	1550805	1550810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_011832	CGG	2	6	1550824	1550829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_011832	CAT	2	6	1550855	1550860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5631	NC_011832	CTG	2	6	1550909	1550914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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