MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium abscessus chromosome

Total Repeats: 6956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010397	GCT	2	6	4850401	4850406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_010397	CAC	2	6	4850434	4850439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6503	NC_010397	TTCA	2	8	4850516	4850523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6504	NC_010397	GCT	2	6	4850570	4850575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_010397	CAC	2	6	4850619	4850624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_010397	GCT	2	6	4850628	4850633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_010397	GC	3	6	4851467	4851472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6508	NC_010397	TCG	2	6	4851500	4851505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_010397	TCG	2	6	4853393	4853398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_010397	GTC	2	6	4853406	4853411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_010397	CGGCG	2	10	4853457	4853466	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6512	NC_010397	GC	3	6	4853498	4853503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6513	NC_010397	AGATC	2	10	4853504	4853513	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6514	NC_010397	CACG	2	8	4853601	4853608	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6515	NC_010397	ATGG	2	8	4853614	4853621	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_010397	GCA	2	6	4853652	4853657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_010397	GGC	2	6	4853663	4853668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_010397	CGCCC	2	10	4853719	4853728	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6519	NC_010397	GTT	2	6	4853730	4853735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_010397	TGAG	2	8	4853783	4853790	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_010397	GC	3	6	4853902	4853907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6522	NC_010397	CCA	2	6	4855028	4855033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6523	NC_010397	TCAT	2	8	4856979	4856986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6524	NC_010397	GTG	2	6	4857026	4857031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_010397	GGTAT	2	10	4857055	4857064	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_010397	CG	3	6	4857079	4857084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6527	NC_010397	AGA	2	6	4857090	4857095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_010397	CGC	3	9	4860713	4860721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6529	NC_010397	C	7	7	4861192	4861198	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6530	NC_010397	GCG	2	6	4861207	4861212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_010397	GTAC	2	8	4861839	4861846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6532	NC_010397	TACAT	2	10	4861849	4861858	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6533	NC_010397	AT	3	6	4861857	4861862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_010397	GTACG	2	10	4861863	4861872	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6535	NC_010397	CGG	2	6	4863676	4863681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_010397	CCGA	2	8	4863682	4863689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6537	NC_010397	GGC	2	6	4863704	4863709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_010397	CAA	2	6	4863742	4863747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_010397	CGG	2	6	4865813	4865818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_010397	GA	3	6	4865861	4865866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_010397	GC	3	6	4865910	4865915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6542	NC_010397	ATC	2	6	4868847	4868852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_010397	GTT	2	6	4869681	4869686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_010397	CGC	2	6	4870837	4870842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_010397	CAT	2	6	4871283	4871288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_010397	GGC	2	6	4874057	4874062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_010397	GTC	2	6	4874071	4874076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_010397	TCA	2	6	4874101	4874106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_010397	GC	3	6	4874132	4874137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6550	NC_010397	GTA	2	6	4874214	4874219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_010397	GCCGC	2	10	4874287	4874296	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6552	NC_010397	GGGA	2	8	4876612	4876619	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_010397	CCG	2	6	4876621	4876626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6554	NC_010397	TGC	2	6	4876642	4876647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_010397	CGGC	2	8	4877357	4877364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6556	NC_010397	ACC	2	6	4882621	4882626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6557	NC_010397	CAC	2	6	4882638	4882643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6558	NC_010397	AATTG	2	10	4882656	4882665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_010397	ATGC	2	8	4882706	4882713	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6560	NC_010397	GC	3	6	4883312	4883317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6561	NC_010397	TG	3	6	4883322	4883327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_010397	CGGC	2	8	4885691	4885698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6563	NC_010397	GC	3	6	4885707	4885712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_010397	TTAT	2	8	4885804	4885811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_010397	CGC	2	6	4885966	4885971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6566	NC_010397	AG	3	6	4886058	4886063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_010397	GTCGG	2	10	4886120	4886129	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6568	NC_010397	GGC	2	6	4886534	4886539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6570	NC_010397	GAT	2	6	4886601	4886606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_010397	CAT	2	6	4886633	4886638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_010397	GAA	2	6	4887454	4887459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_010397	ACT	2	6	4887491	4887496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_010397	GC	3	6	4887548	4887553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6575	NC_010397	GGC	2	6	4888180	4888185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6576	NC_010397	CTC	2	6	4888188	4888193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6577	NC_010397	TTG	2	6	4888199	4888204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_010397	GTC	2	6	4889213	4889218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_010397	CGTC	2	8	4889679	4889686	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6580	NC_010397	GC	3	6	4889699	4889704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6581	NC_010397	GTT	2	6	4892524	4892529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6583	NC_010397	GAAG	2	8	4893446	4893453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_010397	GGAGA	2	10	4893509	4893518	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_010397	GCCC	2	8	4893528	4893535	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6586	NC_010397	GAC	2	6	4893558	4893563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_010397	GCA	2	6	4895186	4895191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_010397	TC	3	6	4896331	4896336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6589	NC_010397	CCG	2	6	4896397	4896402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6590	NC_010397	CCT	2	6	4897851	4897856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6591	NC_010397	GAT	2	6	4898737	4898742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_010397	CATATC	2	12	4898838	4898849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6593	NC_010397	CGC	2	6	4900185	4900190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6594	NC_010397	CAG	2	6	4900191	4900196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_010397	CAA	2	6	4900252	4900257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_010397	TTC	2	6	4902187	4902192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_010397	ACCA	2	8	4902194	4902201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6598	NC_010397	GC	3	6	4902214	4902219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6599	NC_010397	AGCC	2	8	4902320	4902327	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6600	NC_010397	GAG	3	9	4902336	4902344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_010397	T	7	7	4904211	4904217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_010397	TGA	2	6	4904248	4904253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_010397	GGT	2	6	4905262	4905267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_010397	CCA	2	6	4905286	4905291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6605	NC_010397	CTT	2	6	4907300	4907305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_010397	AAC	2	6	4907315	4907320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_010397	GCC	2	6	4907377	4907382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6608	NC_010397	CCG	2	6	4907399	4907404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6609	NC_010397	TAC	2	6	4907408	4907413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6610	NC_010397	GGT	2	6	4909893	4909898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_010397	CATCGC	2	12	4911064	4911075	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6612	NC_010397	GTGGA	2	10	4911121	4911130	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_010397	CGG	2	6	4911455	4911460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_010397	CG	3	6	4911467	4911472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6615	NC_010397	ATC	2	6	4911486	4911491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_010397	CAT	2	6	4911710	4911715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_010397	CGG	2	6	4913933	4913938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_010397	GAC	2	6	4914023	4914028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_010397	CGG	2	6	4914075	4914080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_010397	CAAT	2	8	4914225	4914232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6621	NC_010397	AGGA	2	8	4914341	4914348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_010397	GCT	2	6	4915685	4915690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6626	NC_010397	AC	3	6	4915813	4915818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6627	NC_010397	AGCA	2	8	4916019	4916026	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6628	NC_010397	TCCC	2	8	4919025	4919032	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6629	NC_010397	GCG	2	6	4919054	4919059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6932	NC_010397	CG	3	6	5061215	5061220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6933	NC_010397	CGG	2	6	5061233	5061238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6941	NC_010397	CCG	2	6	5065822	5065827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6942	NC_010397	GCC	2	6	5065872	5065877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6954	NC_010397	TGT	2	6	5067072	5067077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.