MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanococcus aeolicus Nankai-3 chromosome

Total Repeats: 9451

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009635	AT	3	6	9	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009635	TAAA	2	8	53	60	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009635	ATTTTT	2	12	73	84	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009635	ATA	2	6	85	90	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009635	TAA	2	6	105	110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009635	AC	3	6	153	158	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009635	A	6	6	162	167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009635	ATA	2	6	175	180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009635	CCA	2	6	1447	1452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009635	ATA	2	6	2582	2587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009635	ATT	2	6	2592	2597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009635	TTAA	2	8	2601	2608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009635	AT	3	6	2617	2622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009635	ATATTT	2	12	2624	2635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009635	AT	3	6	2645	2650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009635	TAT	2	6	2658	2663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009635	AGT	2	6	3638	3643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009635	ATA	2	6	3644	3649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009635	TGG	2	6	3692	3697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009635	TTATA	2	10	4025	4034	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009635	AAT	2	6	4067	4072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009635	TAATA	2	10	4092	4101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009635	TA	3	6	4147	4152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009635	CAC	2	6	5729	5734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009635	A	7	7	5736	5742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009635	TA	3	6	7136	7141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009635	ATTA	2	8	7144	7151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009635	TA	3	6	7216	7221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009635	TCC	2	6	8816	8821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009635	AT	3	6	8832	8837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009635	ATTA	2	8	8859	8866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009635	TA	4	8	8886	8893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009635	AT	3	6	8894	8899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009635	TAATA	2	10	8914	8923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009635	TATAA	2	10	8988	8997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009635	AT	3	6	9026	9031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009635	TAAT	2	8	9039	9046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009635	TA	3	6	9090	9095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009635	CTAT	2	8	9096	9103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009635	GTG	2	6	9110	9115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009635	AT	3	6	9120	9125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009635	GA	3	6	9154	9159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009635	GGT	2	6	10372	10377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009635	AAT	2	6	10604	10609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009635	TAA	2	6	10659	10664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009635	TTAT	2	8	10692	10699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009635	AT	3	6	10733	10738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009635	TAT	3	9	10736	10744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009635	TATT	2	8	10771	10778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009635	T	7	7	10777	10783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009635	ATGT	2	8	10789	10796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009635	ATA	2	6	12733	12738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009635	ATA	2	6	12749	12754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009635	TAAAA	2	10	15210	15219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009635	A	6	6	15248	15253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009635	TA	3	6	15257	15262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009635	T	6	6	15334	15339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009635	TGTC	2	8	15345	15352	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009635	ATT	2	6	15366	15371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009635	AT	3	6	15387	15392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009635	TAT	2	6	15481	15486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009635	GT	3	6	15487	15492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009635	ATTAA	2	10	15503	15512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009635	AG	3	6	15572	15577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009635	T	7	7	16117	16123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009635	TAT	2	6	16129	16134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009635	ATTTT	2	10	16135	16144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009635	T	9	9	16152	16160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009635	ATA	2	6	16165	16170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009635	TATAT	2	10	16179	16188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009635	TTA	2	6	17495	17500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009635	CTG	2	6	17510	17515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009635	ATTTT	2	10	17520	17529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009635	TTA	2	6	17530	17535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009635	ATTTT	2	10	17536	17545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009635	TTA	2	6	17546	17551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009635	T	6	6	18228	18233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009635	TAT	2	6	18242	18247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009635	TTTTA	2	10	18255	18264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009635	TTTA	2	8	18274	18281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009635	TTTTTA	2	12	18282	18293	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009635	T	7	7	18294	18300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009635	CTT	2	6	18321	18326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009635	TTTTA	2	10	19173	19182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009635	AT	3	6	19183	19188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009635	AT	3	6	19193	19198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009635	TAATTA	2	12	19200	19211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009635	GTATT	2	10	19223	19232	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009635	TAAT	2	8	19274	19281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009635	TAAT	2	8	19284	19291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009635	ATTAT	2	10	19296	19305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009635	ACA	2	6	19311	19316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009635	TAT	2	6	19338	19343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009635	A	6	6	19405	19410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009635	AT	3	6	19770	19775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009635	TAA	2	6	20849	20854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009635	ATA	2	6	21696	21701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009635	ATATA	2	10	21706	21715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009635	AAT	2	6	21724	21729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009635	AATAA	2	10	21734	21743	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009635	TTTTTG	2	12	21748	21759	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009635	T	6	6	21760	21765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009635	TA	3	6	21778	21783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009635	AT	3	6	22858	22863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009635	ACA	2	6	22870	22875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009635	ATA	3	9	22878	22886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009635	TAA	2	6	22887	22892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009635	AT	3	6	22913	22918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009635	ATA	2	6	24169	24174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009635	TA	3	6	24185	24190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009635	ATT	2	6	24233	24238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009635	TAA	2	6	24257	24262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009635	ATAA	2	8	24524	24531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009635	A	7	7	24530	24536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009635	TAAA	2	8	24947	24954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009635	TTA	2	6	24955	24960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009635	T	8	8	24966	24973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009635	TA	4	8	24976	24983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009635	TAA	2	6	25007	25012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009635	A	6	6	25028	25033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009635	A	6	6	25039	25044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009635	CA	3	6	25045	25050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009635	AT	3	6	25051	25056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009635	TA	3	6	25057	25062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009635	TG	3	6	25079	25084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009635	T	6	6	25092	25097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009635	TATAT	2	10	25506	25515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009635	T	7	7	25515	25521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009635	T	7	7	25525	25531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009635	TTTA	2	8	26865	26872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009635	AT	3	6	26877	26882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009635	AG	4	8	26888	26895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009635	TAAT	2	8	26922	26929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009635	TA	4	8	26930	26937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009635	ATTT	2	8	26939	26946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009635	TAC	2	6	26950	26955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009635	ATT	2	6	26958	26963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009635	TAT	2	6	26964	26969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009635	CCG	2	6	26990	26995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_009635	ATTATA	2	12	27008	27019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009635	AT	3	6	27022	27027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009635	TAT	2	6	29614	29619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009635	ATT	2	6	29674	29679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009635	AT	4	8	29681	29688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009635	GATAT	2	10	29690	29699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009635	AT	3	6	30718	30723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009635	ATA	2	6	30726	30731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009635	AT	3	6	30733	30738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009635	ATT	2	6	30761	30766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009635	ATA	2	6	32139	32144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009635	ATA	2	6	32148	32153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009635	ATA	2	6	32174	32179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009635	GTG	2	6	32191	32196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_009635	TAT	2	6	75959	75964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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