MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis F11 chromosome

Total Repeats: 8362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009565	CAA	2	6	36	41	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009565	TTC	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009565	A	7	7	1654	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009565	TC	4	8	1663	1670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009565	CGG	2	6	1744	1749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009565	AC	4	8	1787	1794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009565	CCGA	2	8	1826	1833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009565	TCG	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009565	ACC	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009565	TCG	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009565	ATG	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009565	GTT	3	9	2026	2034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009565	CTG	2	6	2038	2043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009565	CGT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009565	TCG	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009565	GAA	2	6	5192	5197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009565	CGA	3	9	9931	9939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009565	GAG	2	6	9960	9965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009565	TCG	2	6	10963	10968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009565	TCC	2	6	11048	11053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009565	ACG	2	6	11078	11083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009565	GGC	2	6	11123	11128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009565	TCG	2	6	11131	11136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009565	CCT	2	6	11184	11189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009565	ACCCG	2	10	11380	11389	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009565	CGG	2	6	11421	11426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009565	ACG	2	6	11483	11488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009565	ACC	2	6	11526	11531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009565	ACC	3	9	11596	11604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009565	GCC	2	6	11633	11638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_009565	GCAC	2	8	11709	11716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009565	CCG	2	6	11738	11743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009565	CGA	2	6	11795	11800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009565	ACT	2	6	11842	11847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009565	CAT	2	6	11903	11908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009565	GAC	2	6	11964	11969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009565	GCC	2	6	12416	12421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009565	CGG	2	6	12496	12501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009565	GCCC	2	8	12554	12561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_009565	TCG	2	6	13135	13140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009565	CAC	2	6	13678	13683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_009565	CGACC	2	10	13773	13782	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_009565	ATTC	2	8	13792	13799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009565	CGG	2	6	13803	13808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009565	GAC	2	6	14133	14138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009565	C	6	6	23308	23313	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_009565	GC	3	6	23324	23329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009565	TCG	2	6	23355	23360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009565	GGT	2	6	23917	23922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009565	TCG	2	6	25577	25582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009565	TCAA	2	8	25615	25622	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009565	GAGC	2	8	25643	25650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009565	GGCC	2	8	25657	25664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009565	CCG	2	6	25678	25683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_009565	CTA	2	6	25713	25718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009565	TCC	2	6	25730	25735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009565	GTT	2	6	25737	25742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009565	TCG	3	9	25857	25865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009565	GCC	2	6	25871	25876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009565	AAC	2	6	26983	26988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009565	CGT	2	6	27001	27006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009565	CTT	2	6	27052	27057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009565	CGAGC	2	10	27069	27078	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_009565	CCT	2	6	27551	27556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009565	TA	3	6	27627	27632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009565	GTA	2	6	27666	27671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009565	AC	3	6	29761	29766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009565	GCG	2	6	31184	31189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009565	ACCGCG	2	12	31190	31201	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009565	ACCA	2	8	31225	31232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009565	CGG	2	6	31236	31241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009565	CAA	2	6	31271	31276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009565	GAG	2	6	31277	31282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009565	GGC	2	6	31974	31979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009565	TCG	2	6	32034	32039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009565	TGC	3	9	32043	32051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009565	AC	3	6	32096	32101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009565	CAC	2	6	32106	32111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_009565	GAT	2	6	32135	32140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009565	TGG	2	6	33300	33305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009565	G	6	6	33304	33309	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009565	CCGCC	2	10	33909	33918	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
83	NC_009565	GCTA	2	8	33956	33963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009565	CGG	2	6	34015	34020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009565	GCG	2	6	34036	34041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009565	TGG	2	6	34097	34102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009565	CGG	2	6	34168	34173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009565	GGT	2	6	34230	34235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009565	CCA	2	6	34252	34257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009565	G	6	6	34292	34297	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009565	TCA	2	6	39064	39069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009565	CG	3	6	39085	39090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009565	GC	3	6	39095	39100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009565	CT	3	6	39134	39139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009565	CG	3	6	39141	39146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009565	GC	3	6	39151	39156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009565	CAC	2	6	39931	39936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_009565	TCG	2	6	39953	39958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009565	GCC	2	6	41327	41332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_009565	GGT	2	6	41388	41393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009565	GAT	2	6	41396	41401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009565	CCG	3	9	42020	42028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_009565	AGC	2	6	42039	42044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009565	GCGTC	2	10	42045	42054	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_009565	GCC	2	6	42469	42474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_009565	CGT	2	6	43504	43509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009565	GTG	2	6	43581	43586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009565	CGG	2	6	46580	46585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009565	CGC	2	6	46635	46640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_009565	CGG	2	6	46647	46652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009565	CTAC	2	8	47320	47327	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009565	GCT	2	6	47437	47442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009565	ATCGG	2	10	47452	47461	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009565	GTG	2	6	50101	50106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009565	CCT	2	6	51836	51841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_009565	ACG	2	6	51867	51872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009565	AT	3	6	51904	51909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009565	ACA	2	6	51915	51920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009565	TAG	2	6	52807	52812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009565	CTGG	2	8	52817	52824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009565	CCG	2	6	52841	52846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_009565	CAA	2	6	52855	52860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009565	GGT	2	6	52879	52884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009565	CGT	2	6	52893	52898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009565	TGC	2	6	57503	57508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009565	CGC	2	6	58130	58135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_009565	TCG	2	6	58139	58144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009565	GGT	2	6	58167	58172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009565	CCT	2	6	58239	58244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_009565	AGG	2	6	58277	58282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009565	TGA	2	6	58283	58288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009565	GAA	3	9	58640	58648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009565	GCC	2	6	58657	58662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_009565	AGG	2	6	58679	58684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009565	TG	3	6	63133	63138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009565	ATG	2	6	63170	63175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009565	CGG	2	6	63208	63213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009565	CGT	2	6	63237	63242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009565	AGG	3	9	64000	64008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009565	TCG	2	6	65083	65088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009565	TGCCG	2	10	65585	65594	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_009565	GCC	2	6	65637	65642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_009565	CGTCGG	2	12	66840	66851	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_009565	CTG	2	6	68589	68594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_009565	GCC	2	6	68636	68641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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162	NC_009565	GCG	2	6	79269	79274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_009565	CGG	2	6	79348	79353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_009565	CGG	2	6	80503	80508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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180	NC_009565	ACC	3	9	80655	80663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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262	NC_009565	AGCA	2	8	141229	141236	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
263	NC_009565	CGC	2	6	141252	141257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
264	NC_009565	CG	3	6	141281	141286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
265	NC_009565	GAG	2	6	141324	141329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_009565	TCC	2	6	147913	147918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_009565	GTG	2	6	147940	147945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_009565	GGGTC	2	10	147999	148008	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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278	NC_009565	GGT	2	6	148599	148604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
279	NC_009565	GC	3	6	148614	148619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
280	NC_009565	GCC	2	6	149371	149376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
281	NC_009565	GGT	2	6	149474	149479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
282	NC_009565	CTCGGT	2	12	149510	149521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_009565	GTC	2	6	149610	149615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_009565	GCC	2	6	151401	151406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_009565	AGG	2	6	151451	151456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
286	NC_009565	TCG	2	6	152534	152539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_009565	ACC	2	6	152545	152550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_009565	GCCG	2	8	152552	152559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
289	NC_009565	ATTGG	2	10	152564	152573	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_009565	GAG	3	9	154478	154486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_009565	GAG	3	9	154531	154539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_009565	GCGT	3	12	155946	155957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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406	NC_009565	GGCCG	2	10	231878	231887	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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410	NC_009565	CTG	2	6	241614	241619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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417	NC_009565	GCC	2	6	243621	243626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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419	NC_009565	ACG	2	6	243671	243676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_009565	CCG	2	6	243677	243682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
421	NC_009565	CA	3	6	247687	247692	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
422	NC_009565	GCC	2	6	249239	249244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
423	NC_009565	CGG	2	6	249277	249282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_009565	CTG	2	6	249294	249299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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426	NC_009565	CCA	2	6	249324	249329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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442	NC_009565	TCG	2	6	273254	273259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_009565	CCT	2	6	273284	273289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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447	NC_009565	GCAGT	2	10	276321	276330	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
448	NC_009565	TCG	2	6	276341	276346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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450	NC_009565	AGG	2	6	278207	278212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
451	NC_009565	TCG	2	6	281461	281466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_009565	GCC	2	6	287183	287188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
453	NC_009565	GCG	2	6	287196	287201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_009565	CTC	2	6	287396	287401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
455	NC_009565	C	6	6	287460	287465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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460	NC_009565	GCC	2	6	293861	293866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
461	NC_009565	GGT	2	6	293884	293889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
462	NC_009565	GTT	2	6	293935	293940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_009565	TGG	2	6	293997	294002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_009565	AACC	2	8	296097	296104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
474	NC_009565	GCG	2	6	296148	296153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_009565	ATG	2	6	296882	296887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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