MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 8600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_009525	GTC	2	6	3501445	3501450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_009525	AGG	2	6	3501464	3501469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_009525	GGC	3	9	3501513	3501521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_009525	TTG	2	6	3501527	3501532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_009525	CGG	2	6	3501584	3501589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_009525	GGAGT	2	10	3501627	3501636	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_009525	ACG	2	6	3501647	3501652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_009525	TGT	2	6	3502564	3502569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_009525	CA	3	6	3502597	3502602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_009525	GCC	2	6	3503827	3503832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6511	NC_009525	GAAT	2	8	3503874	3503881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_009525	AAC	2	6	3503927	3503932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_009525	ATG	2	6	3503946	3503951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_009525	GGCA	2	8	3503953	3503960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6515	NC_009525	GCT	2	6	3505392	3505397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_009525	GAG	2	6	3505420	3505425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_009525	CTG	2	6	3505501	3505506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_009525	GCG	2	6	3505545	3505550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_009525	CGG	3	9	3505574	3505582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_009525	GCT	2	6	3505591	3505596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_009525	CGG	2	6	3505686	3505691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_009525	GTA	2	6	3505702	3505707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_009525	GGT	2	6	3505728	3505733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_009525	TGG	2	6	3505749	3505754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_009525	GCC	2	6	3506391	3506396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_009525	CG	3	6	3506456	3506461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6527	NC_009525	ACC	2	6	3506489	3506494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6528	NC_009525	CTT	2	6	3506518	3506523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_009525	CTG	2	6	3506552	3506557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_009525	CG	3	6	3506566	3506571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6531	NC_009525	ACG	2	6	3506604	3506609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_009525	CGA	2	6	3506699	3506704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_009525	AGA	2	6	3506723	3506728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_009525	TCGG	2	8	3506761	3506768	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6535	NC_009525	ACC	2	6	3506775	3506780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6536	NC_009525	TGA	2	6	3506786	3506791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_009525	GAG	2	6	3508583	3508588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_009525	TCC	2	6	3508610	3508615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6539	NC_009525	CG	3	6	3508654	3508659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6540	NC_009525	CAC	2	6	3512077	3512082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6541	NC_009525	GAAT	2	8	3513051	3513058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_009525	CGGC	2	8	3513240	3513247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6543	NC_009525	CCG	2	6	3513270	3513275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6544	NC_009525	GCCC	2	8	3513298	3513305	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6545	NC_009525	CAA	2	6	3513344	3513349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_009525	G	6	6	3513403	3513408	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_009525	TCCCA	2	10	3515423	3515432	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6548	NC_009525	CTG	2	6	3515449	3515454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_009525	TTA	2	6	3515465	3515470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_009525	ACGC	2	8	3515496	3515503	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6551	NC_009525	GGT	2	6	3517482	3517487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_009525	CTG	2	6	3520209	3520214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_009525	TTG	2	6	3521718	3521723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_009525	CCG	2	6	3521746	3521751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6555	NC_009525	CGGC	2	8	3522219	3522226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6556	NC_009525	GCT	2	6	3523494	3523499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_009525	AAC	2	6	3523554	3523559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_009525	TGC	2	6	3523563	3523568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_009525	CGAC	2	8	3523639	3523646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6560	NC_009525	GCC	2	6	3523796	3523801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6561	NC_009525	GGC	2	6	3523807	3523812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_009525	ACG	2	6	3523818	3523823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_009525	GC	3	6	3531342	3531347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_009525	AC	3	6	3531386	3531391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6565	NC_009525	GGC	2	6	3531431	3531436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_009525	CGA	2	6	3541415	3541420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_009525	GC	3	6	3543332	3543337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6568	NC_009525	CGG	2	6	3543357	3543362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_009525	CAC	2	6	3547513	3547518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6570	NC_009525	TGCC	2	8	3547528	3547535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6571	NC_009525	GGTT	2	8	3547552	3547559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_009525	GCCG	2	8	3550583	3550590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6573	NC_009525	ACG	2	6	3550606	3550611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_009525	CCG	2	6	3550635	3550640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6575	NC_009525	GCT	2	6	3552944	3552949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6576	NC_009525	CGC	2	6	3552974	3552979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6577	NC_009525	GCC	2	6	3553003	3553008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6578	NC_009525	GCC	2	6	3553540	3553545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6579	NC_009525	CCAT	2	8	3553578	3553585	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6580	NC_009525	ACA	2	6	3554226	3554231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_009525	AGG	2	6	3554284	3554289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_009525	CG	3	6	3557457	3557462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6583	NC_009525	ACC	2	6	3558478	3558483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6584	NC_009525	CGC	2	6	3558510	3558515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6585	NC_009525	TCC	2	6	3558516	3558521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6586	NC_009525	CACCG	2	10	3558564	3558573	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6587	NC_009525	GTC	2	6	3559106	3559111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_009525	CGC	2	6	3559117	3559122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6589	NC_009525	GGC	2	6	3559130	3559135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_009525	TCCGCT	2	12	3559167	3559178	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6591	NC_009525	CGG	2	6	3559183	3559188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_009525	ATC	2	6	3559542	3559547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6593	NC_009525	TG	3	6	3559580	3559585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_009525	CGA	2	6	3559650	3559655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_009525	ATC	2	6	3561114	3561119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_009525	GGC	2	6	3561134	3561139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_009525	CG	3	6	3561186	3561191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6598	NC_009525	CCA	2	6	3561225	3561230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6599	NC_009525	AAC	2	6	3561327	3561332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_009525	GCG	2	6	3561366	3561371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_009525	GGT	2	6	3562394	3562399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_009525	CGA	2	6	3562465	3562470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_009525	CCG	2	6	3562481	3562486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6604	NC_009525	CCA	2	6	3562487	3562492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6605	NC_009525	CCGG	2	8	3563221	3563228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6606	NC_009525	TCC	2	6	3563344	3563349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6607	NC_009525	TC	3	6	3563423	3563428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6608	NC_009525	CGGT	2	8	3563435	3563442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6609	NC_009525	CCG	2	6	3563469	3563474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6610	NC_009525	CCG	2	6	3563486	3563491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6611	NC_009525	ATC	2	6	3563907	3563912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_009525	TCAGA	2	10	3564828	3564837	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6613	NC_009525	CTGTT	2	10	3564878	3564887	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6614	NC_009525	CAG	2	6	3564914	3564919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_009525	TGG	2	6	3564949	3564954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6618	NC_009525	GTA	2	6	3565064	3565069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_009525	GGA	2	6	3565084	3565089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_009525	TG	3	6	3566097	3566102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_009525	GCC	2	6	3566184	3566189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6622	NC_009525	GGC	2	6	3566214	3566219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_009525	CGG	2	6	3567532	3567537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_009525	ATGCA	2	10	3567547	3567556	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6625	NC_009525	CGTCG	2	10	3567585	3567594	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6626	NC_009525	CGA	2	6	3567633	3567638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_009525	ATC	2	6	3567901	3567906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_009525	GCC	2	6	3567980	3567985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6630	NC_009525	GGT	2	6	3568031	3568036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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