MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanocorpusculum labreanum Z chromosome

Total Repeats: 5388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008942	TGA	2	6	7	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008942	AAG	2	6	23	28	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008942	TTG	2	6	41	46	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008942	T	6	6	124	129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008942	ACAAA	2	10	158	167	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008942	T	7	7	172	178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008942	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008942	AACA	2	8	213	220	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008942	AACT	2	8	241	248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008942	T	6	6	248	253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008942	AT	3	6	273	278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008942	A	8	8	298	305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008942	CCCT	2	8	306	313	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008942	CCCTCC	2	12	317	328	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
15	NC_008942	CAA	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008942	CAA	2	6	347	352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008942	TCA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008942	TTC	2	6	396	401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008942	ACA	2	6	409	414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008942	CACTC	2	10	462	471	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_008942	AGT	2	6	474	479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008942	A	8	8	494	501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008942	ATA	2	6	503	508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008942	ATC	2	6	2310	2315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008942	TAA	2	6	3484	3489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008942	T	7	7	3530	3536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008942	CT	4	8	4963	4970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008942	TTC	2	6	4971	4976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008942	TAT	2	6	4995	5000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008942	CTC	2	6	5004	5009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008942	TCA	2	6	7152	7157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008942	A	7	7	7157	7163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008942	T	8	8	7167	7174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008942	AGC	2	6	7203	7208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008942	T	6	6	7213	7218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008942	A	6	6	7225	7230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008942	T	6	6	7630	7635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008942	CTCTT	2	10	8188	8197	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_008942	TGGGG	2	10	8206	8215	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008942	TGG	2	6	8270	8275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008942	CAT	2	6	8336	8341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008942	TTCGA	2	10	10227	10236	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008942	GTT	2	6	11144	11149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008942	T	6	6	11148	11153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008942	GA	3	6	12006	12011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008942	A	7	7	12058	12064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008942	TA	3	6	14404	14409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008942	ATT	2	6	15798	15803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008942	TAAT	2	8	15899	15906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008942	T	6	6	15916	15921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008942	T	6	6	15939	15944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008942	AT	3	6	15946	15951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008942	ATATT	2	10	15960	15969	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008942	TTA	2	6	15984	15989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008942	TTAA	2	8	15998	16005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008942	A	7	7	16004	16010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008942	CT	3	6	16105	16110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008942	GTT	2	6	16139	16144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008942	CA	3	6	16148	16153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008942	A	6	6	16161	16166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008942	ATGA	2	8	16172	16179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008942	AAG	2	6	16181	16186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008942	AT	3	6	19111	19116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008942	TAAA	2	8	19139	19146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008942	TAT	3	9	19155	19163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008942	CTG	2	6	19197	19202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008942	AAT	2	6	19211	19216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008942	A	8	8	19248	19255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008942	TA	3	6	20196	20201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008942	T	6	6	20210	20215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008942	T	6	6	22787	22792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008942	CGG	2	6	22820	22825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008942	ATT	2	6	24036	24041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008942	ACT	2	6	24071	24076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008942	GTA	2	6	24081	24086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008942	GAGTAA	2	12	24192	24203	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008942	ATT	3	9	24270	24278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008942	T	6	6	25094	25099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008942	AT	3	6	27302	27307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008942	AGAT	2	8	27320	27327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008942	CGG	2	6	27347	27352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008942	CAAT	2	8	27364	27371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008942	CA	3	6	27397	27402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008942	TTG	2	6	27421	27426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008942	T	7	7	31671	31677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008942	T	6	6	31679	31684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008942	TCT	2	6	31691	31696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008942	TCAT	2	8	31724	31731	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008942	CGT	3	9	31821	31829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008942	TAA	2	6	31979	31984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008942	GTG	2	6	32081	32086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008942	AT	3	6	32919	32924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008942	GAGCA	2	10	33023	33032	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008942	CGA	2	6	33033	33038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008942	CTG	2	6	33806	33811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008942	T	6	6	33846	33851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008942	T	6	6	33917	33922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008942	GTA	2	6	33988	33993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008942	AG	4	8	34003	34010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008942	A	7	7	34037	34043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008942	GATC	2	8	34075	34082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008942	T	7	7	34105	34111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008942	TACTA	2	10	34156	34165	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_008942	A	8	8	34178	34185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008942	AAAT	2	8	34198	34205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008942	T	7	7	34221	34227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008942	T	6	6	34250	34255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008942	CAT	2	6	34264	34269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008942	A	6	6	34299	34304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008942	ACC	2	6	34337	34342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_008942	TCA	2	6	34347	34352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008942	AT	3	6	34365	34370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008942	GCG	2	6	34455	34460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008942	TC	3	6	34487	34492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008942	TCA	2	6	34530	34535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008942	CTT	2	6	34547	34552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008942	A	6	6	34556	34561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008942	A	6	6	34599	34604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008942	TCTCC	2	10	35011	35020	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
120	NC_008942	AT	3	6	35408	35413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008942	TAAA	2	8	36057	36064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008942	CCT	3	9	36066	36074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_008942	TACA	2	8	36115	36122	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008942	TAC	2	6	36143	36148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008942	AAT	2	6	38432	38437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008942	AGA	2	6	38441	38446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008942	ATA	2	6	38457	38462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008942	ATT	2	6	38511	38516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008942	AATC	2	8	38519	38526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008942	TCG	2	6	38556	38561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008942	T	6	6	38570	38575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008942	AAT	2	6	38597	38602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008942	TGA	2	6	38607	38612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008942	ATA	2	6	38630	38635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008942	TAATA	2	10	38638	38647	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008942	GTT	2	6	38658	38663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008942	GTC	2	6	39569	39574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008942	TCT	2	6	39611	39616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008942	T	6	6	39636	39641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008942	CATT	2	8	40171	40178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008942	A	6	6	40180	40185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008942	GAC	2	6	40220	40225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_008942	ATT	2	6	40232	40237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008942	T	6	6	40242	40247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008942	CTT	2	6	40263	40268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008942	TGC	2	6	40280	40285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008942	TTC	2	6	40308	40313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_008942	CTT	2	6	40323	40328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008942	TAA	2	6	40415	40420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008942	GAA	2	6	40449	40454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008942	A	7	7	41404	41410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_008942	A	8	8	110681	110688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_008942	T	7	7	179301	179307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_008942	TA	3	6	197964	197969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_008942	ATT	2	6	197976	197981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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